黃瓜無(wú)側(cè)枝基因的初步定位

黃瓜無(wú)側(cè)枝基因的初步定位

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1、園藝學(xué)報(bào)2013,40(7):1375–1381http://www.ahs.ac.cnActaHorticulturaeSinicaE-mail:yuanyixuebao@126.com黃瓜無(wú)側(cè)枝基因nlb的初步定位*任國(guó)良,楊緒勤,何歡樂(lè),蔡潤(rùn),潘俊松(上海交通大學(xué)農(nóng)業(yè)與生物學(xué)院,上海200240)摘要:以黃瓜無(wú)側(cè)枝品系419(P1)和有側(cè)枝品系SB-2(P2)為親本構(gòu)建的136株F2群體為試驗(yàn)材料,對(duì)黃瓜無(wú)側(cè)枝基因nlb進(jìn)行定位研究。田間調(diào)查和遺傳分析結(jié)果表明,F(xiàn)2群體的表現(xiàn)型中有側(cè)枝與無(wú)側(cè)枝的分離比為3︰1。運(yùn)用分離群體分組混合

2、分析法(bulkedsegregantanalysis,BSA),從F2無(wú)側(cè)枝群體和有側(cè)枝群體中各隨機(jī)選取10株,分別混合其DNA,構(gòu)建無(wú)側(cè)枝和有側(cè)枝基因池,通過(guò)分析SSR分子標(biāo)記在基因池間的多態(tài)性,篩選得到nlb基因連鎖標(biāo)記9個(gè)。然后利用F2群體進(jìn)行進(jìn)一步驗(yàn)證,經(jīng)MAPMAKER3.0軟件分析,將nlb基因定位于黃瓜1號(hào)染色體,其中距離nlb基因較為緊密的標(biāo)記是SSR19673,遺傳距離為15.9cM。關(guān)鍵詞:黃瓜;無(wú)側(cè)枝基因nlb;基因定位;SSR標(biāo)記中圖分類(lèi)號(hào):S642.2文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A文章編號(hào):0513-353X(2013)07

3、-1375-07GeneticMappingoftheNon-lateralBranchGene(nlb)inCucumber*RENGuo-liang,YANGXu-qin,HEHuan-le,CAIRun,andPANJun-song(SchoolofAgricultureandBiology,ShanghaiJiaoTongUniversity,Shanghai200240,China)Abstract:AF2populationincluding136individualsderivedfromthecrossingofnon-

4、lateralbranchline419(P1)andbranchlineSB-2(P2),usingthisF2populationasmaterialstoresearchonnon-lateralbranch(nlb)genemappingofcucumber.WefoundthatF2populationmaybedividedintolateralbranchindividualsandnonelateralbranchindividualsbyfieldinvestigationandgeneticanalysis,andt

5、heirproportionfitfor3︰1.Constructingnonebranchandbranchgenepoolsbytakingbulkedsegregantanalysis(BSA)whichselect10individualsfromF2non-branchpopulationandbranchpopulationrandomlyandmixtheirDNArespectively.Wefound9simplesequencerepeat(SSR)markerswhichhavepolymorphismbetwee

6、ntwogenepoolswaslinkedtonlbgene.TheF2populationwasusedonfurtherverificationandfoundmolecularmarkerSSR19673whichisclosertonlbgenewithgeneticdistance15.9cMthroughanalysisofsoftwareMAPMAKER3.0,therefore,nlbgenewasmappedonthefirstchromosomeofcucumber.Keywords:cucumber;nlbgen

7、e;genemapping;SSRmarker黃瓜(CucumissativusL.)具有性型多樣、側(cè)枝長(zhǎng)勢(shì)區(qū)別明顯等特點(diǎn)。側(cè)枝性狀是黃瓜生產(chǎn)中重要的農(nóng)藝性狀,對(duì)黃瓜產(chǎn)量有較大的影響。中國(guó)黃瓜栽培方式多數(shù)為搭架式或吊式,適合種植側(cè)收稿日期:2013–01–31;修回日期:2013–05–29基金項(xiàng)目:國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31071081);國(guó)家重點(diǎn)基礎(chǔ)研究發(fā)展計(jì)劃項(xiàng)目(2012CB113900)*通信作者Authorforcorrespondence(E-mail:jspan71@sjtu.edu.cn)1376園藝學(xué)報(bào)40卷枝少的品

8、種,側(cè)枝多會(huì)影響黃瓜的生長(zhǎng)和掛果率,且需要花費(fèi)人工進(jìn)行去除,育種上希望能夠培育出無(wú)側(cè)枝或少側(cè)枝的高產(chǎn)黃瓜品種。目前對(duì)于擬南芥?zhèn)壬鞴俜只约耙干稚M織的發(fā)生研究已經(jīng)比較深入。研究結(jié)果發(fā)現(xiàn),側(cè)生分生組織的發(fā)

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