基因組學及相關(guān)組學

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1、第七章基因組學及相關(guān)組學Chapter7Genomics,FunctionalGenomicsandProteomics基因組學(genomics)是指對整個基因組的結(jié)構(gòu)、結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系以及基因之間相互作用進行探索的一門科學。第一節(jié)基因組學Section1Genomics人類基因組計劃的歷史FrederickSangerWernerArberDanielNathansHamiltonSmithRobertSinsheimerRenatoDulbeccoChernobylJamesWatson人類基因

2、組計劃(humangenomeproject,HGP)從1990年開始實施,其目標是用15年時間,測定出人類基因組DNA的全部堿基序列。楊煥明該計劃先后有六個國家的數(shù)千位科學家直接或間接參與了HGP的工作。1999年9月,中國加入國際基因組計劃。FrancisCollinsCraigVenter2000年6月26日,偉大的時刻終于來臨,美國總統(tǒng)克林頓等六國領(lǐng)導人共同宣布人類基因組計劃的草圖完成。人類基因組全部DNA堿基序列的測序工作于2003年4月基本結(jié)束;2006年4月,最后一個染色體的測序工作完成

3、。人類基因組計劃的研究內(nèi)容:遺傳圖、物理圖、轉(zhuǎn)錄圖和序列圖。二、人類基因組計劃的醫(yī)學中的意義人類基因組計劃在醫(yī)學中的意義主要體現(xiàn)在:通過對基因結(jié)構(gòu)與功能的研究,推動了在分子水平上對各種生理功能的認識。推動了基因組信息與疾病易感性的研究。促進了對癌癥的研究。促進了對疾病遺傳學背景的研究。促進了藥物基因組學的研究?!端荆ǘi稻)基因組的工作框架序列圖》。第三節(jié)蛋白質(zhì)組學Section3Proteomics蛋白質(zhì)組學(Proteomics)主要研究某種生物體、組織器管、細胞或亞細胞結(jié)構(gòu)在特定條件下所表達的全

4、部蛋白質(zhì)的種類和數(shù)量。蛋白質(zhì)組學的研究遠比基因組學的研究更為復(fù)雜、難度更大。雙向電泳分離技術(shù)、生物信息學處理技術(shù)以及蛋白質(zhì)鑒定技術(shù)被稱為蛋白質(zhì)組研究的三大技術(shù)。(一)雙向電泳分離技術(shù)利用蛋白質(zhì)分子所帶電荷及分子量的不同,將混合的蛋白質(zhì)樣品首先置于IPG膠上進行等電聚焦(IEF)分離,然后再置于變性聚丙烯酰胺凝膠(SDS-PAGE)上進行分離。此法通??煞蛛x到1000~10000種不同的蛋白質(zhì)。雙向電泳示意圖雙向電泳分離結(jié)果圖(二)生物質(zhì)譜與蛋白質(zhì)鑒定目前,對蛋白質(zhì)的鑒定主要根據(jù)其屬性參數(shù),如分子量、等

5、電點、氨基酸組成、肽序列標簽及肽質(zhì)量指紋圖譜等,在生物信息數(shù)據(jù)庫中進行檢索進行鑒定。串聯(lián)質(zhì)譜儀二、蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)庫進行蛋白質(zhì)組學研究廣泛使用的生物信息數(shù)據(jù)庫主要是Swiss-Prot/TrEMBL建立的蛋白質(zhì)分析專家系統(tǒng)(Expasy)。該數(shù)據(jù)庫已收集了大量已知的蛋白質(zhì)序列、肽指紋圖譜及序列標簽,對于蛋白質(zhì)的鑒定非常有用。三、蛋白質(zhì)組學的應(yīng)用隨著蛋白質(zhì)組學研究的發(fā)展,目前已衍生出其他相關(guān)的蛋白質(zhì)組學研究,如比較蛋白質(zhì)組學、功能蛋白質(zhì)組學、疾病蛋白質(zhì)組學等,因此對蛋白質(zhì)組學的研究可深入到醫(yī)學研究領(lǐng)域的各個

6、環(huán)節(jié)中。

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