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《虹鱒腦型肌酸激酶基因cdna全長的克隆與序列分析》由會員上傳分享，免費在線閱讀，更多相關(guān)內(nèi)容在教育資源-天天文庫。
1、虹鱒腦型肌酸激酶基因cDNA全長的克隆與序列分析第18卷第4期2009年7月上海海洋大學JOURNALOFSHANGHAIOCEANUNIVERSITYVo1.18.No.4July,2009文章編號:1674—5566(2009)04—0385～06虹鱒腦型肌酸激酶基因cDNA全長的克隆與序列分析王家慶,李代宗,郭冉,張輝,宋波瀾,王志平,鐘尉方(1.河北農(nóng)業(yè)大學海洋學院,河北秦皇島0660032.暨南大學水生生物研究所,廣東廣州510632)摘要:肌酸激酶(Creatinekinase,CK)能夠催化磷酸基團在二磷酸腺苷(ADP)和磷酸肌
2、酸間的可逆性轉(zhuǎn)移,在細胞能量代謝過程中發(fā)揮重要作用.以虹鱒(Oncorhynchnsmykiss)為研究材料,使用RT—PCR和RACE法分離和克隆了虹鱒腦型肌酸激酶(c^)基因cDNA的全長序列(GenBank登錄號:FJ548753).序列全長1493bp,其中5端非翻譯區(qū)81bp,3端非翻譯區(qū)266bp,開放性閱讀框1146bp,編碼381個氨基酸.虹鱒魚CKB蛋白存在兩個重要功能結(jié)構(gòu)域,分別為EF—hand結(jié)構(gòu)域和ATP:guanido磷酸轉(zhuǎn)移酶結(jié)構(gòu)域.構(gòu)建的系統(tǒng)進化樹證實所克隆的肌酸激酶CK基因?qū)儆谀X型肌酸激酶基因CKB.虹鱒魚CK
3、B蛋白序列與大西洋鮭(Salmosalar)的CKB在進化樹上最先聚為一支,這與兩者同屬鮭科魚類這一事實是一致的.虹鱒魚CKB蛋白序列與大西洋鮭的CKB蛋白同源性高達99%,與已報道的哺乳動物的CKB蛋白同源性均在80%以上相符,表明CKB基因在進化過程中是高度保守的,在細胞能量發(fā)生與轉(zhuǎn)移過程中發(fā)揮著重要作用.關(guān)鍵詞:虹鱒魚;肌酸激酶基因;RT—PCR;RACE中圖分類號:S917文獻標識碼:AThecloningandanalysisofCKBfulllengthcDNAderivedfromOncorhynchusmykissWANGJi
4、a—qing,LIDai.zong,GUORan,ZHANGHui,SONGBo—lan,WANGZhi—ping,ZHONGWei—fang(1.CollegeofOcean,HebeiAgricultureUniversity,Qinhuangdao066003,China;2.AquaticResearchInstitute,JinanUnwe~ity,Guangzhou510632,China)Abstract:ATPlevelsinvertebratecellsarelargelyregulatedbycreatinekinase(
5、EC2.7.3.2)thatreversiblycatalyzethetransferofphosphatebetweenATPandvariousphosphogens.Inthispaper,RT—PCRandRACE(RapidAmplificationofcDNAEnds)methodswereusedfortheisolationofthefulllengthcDNAofCKBgene(GenBankaccessionnumber:FJ548753)frombrainofOneorhynehusmykiss.Sequenceanal
6、ysisrevealeda1493bpcDNAcontainingthe81bp5untranslatedregion,266bp3一untranslatedregionand1146bpopenreadingframeencoding381aminoacids.O.mykissCKBhastwoimportantproteinfunctiondomains,namely,EF—handdomainandATP:guanidophosphotransferasedomain.Evolutionarytreeofalltypesof收稿日期:2
7、008—12—18基金項目:河北省科技廳項目(0724240011)作者簡介:王家慶(1981一),男,遼寧海城人,講師,主要從事海洋動物分子生物學及生物信息學方面的研究.E—mail:jiaqing5212@163.con,Fax:0335—3152206,Tel:0335—3150004386上海海洋大學18卷creatinekinaseswasthenconstructed.anditwasdeterminedthatthiscDNAofO.mykisscreatinekinasefrombrainbelongedtobraintype
8、CK.CKBproteinofO.mykissandCKBproteinofS.salarfirstclusteredintoabranch,becausethey
