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1、CTAB—硅珠法提取DNA實驗流程前言:實驗是要求非常嚴謹?shù)倪^程,每個一步驟都可能對后面的操作產(chǎn)生很大影響,乃至影響后面的結(jié)果.一步錯,步步錯,每一個操作的失誤都可能導致整個實驗的失敗.事實求是與踏踏實實的作風是每個做實驗的人必備的基本品質(zhì).永遠記住,任何弄虛作假的行為都是可恥的.在這個充滿學術(shù)腐敗的科學界,保持自己的純真.????????????????????謹記1.材料的采集采取植物的嫩葉,可以用硅膠干燥保存,也可以用冰袋,主要是防止葉片組織的降解及葉片的褐化.用泡沫塑料箱子帶回,置于-70℃冰箱保存.2.CTAB—硅珠法提取DNA實驗流程各加入液體的配制:1、CTAB提取液
2、:2%(W/Vg/mol)CTAB;5%(W/Vg/mol)PVP;1.4mol/lNaCl;20mmol/LEDTAPH=8.0;l00mmol/lTris-HClPH=8.0;?2%(V/V)巰基乙醇(臨時加入)配制量:500ml配制方法:(1)計算所需組分量CTAB???????10g??需熱磁力攪拌PVP???????25g??NaCl???????40.908g??EDTA.Na2.2H2O????3.7224g??調(diào)PH=8冷卻為常溫時(母液)Tris???????6.057g??(2)稱取CTAB10g,NaCl40.908g,PVP25g置于500ml燒杯中(3)加
3、入約300ddH2O(雙蒸水)充分磁力攪拌溶解(注意:EDTA和PVP較難溶,加熱溶解的同時用熱磁力攪拌直至完全的透明為止)(4)量取20mlEDTA(0.5mol/lPH=8),50mlTris-HCl(1mol/lPH=8)溶液于燒杯中,均勻混合(5)將燒杯溶液定容至500ml后,高溫高壓滅菌(6)室溫保存。0.5mol/LEDTA配制組分濃度:0.5mol/lEDTA,PH=8配制量:500ml配制方法(1)稱取93.06克EDTA.Na2.2H2O,置于500ml燒杯中??(2)加入約400mlddH2O.用熱磁力攪拌器充分攪拌??(3)用NaOH調(diào)節(jié)PH值到8,約用10克
4、固體NaOH??(4)在溶液冷卻后,再用NaOH調(diào)節(jié)至PH=8??(5)加ddH2O將溶液定容到500ml??(6)高溫高壓滅菌后,室溫保存NaOH溶液的配制組分濃度:5mol/lNaOH配制量:100ml配制方法(1)稱取固體NaOH20克于容器中(2)加入ddH2O定容到100ml100mmol/lTris-HCl的配制組分濃度:mmol/lTris-HCl,PH=6.4配制量:250ml配制方法(1)稱取3.025克Tris于250ml燒杯中.?(2)加入約200mlddH2O充分攪拌溶解.?(3)用濃鹽酸調(diào)節(jié)PH值到6.4.所用濃鹽酸約3ml?(4)將溶液定容至250ml?
5、(5)用棕色瓶分裝于4度冰箱中?(6)如使用,用水浴加熱溶解.2、氯仿-異戊醇的配制:配制方法(1)簡單的體積混合,既要求比例為24:1即可??(2)儲存于棕色玻璃瓶子中??(3)置于4度冰箱以便日后使用3總的實驗流程3.1.總的DNA的提取:1.??在10ml離心管(eppendorf管)中加入4mlCTAB提取液及80ul巰基乙醇,在65℃水浴鍋中預熱2.??取材料1-2g于研缽中,加入適量液氮迅速多次研磨成細粉狀,轉(zhuǎn)至預熱的CTAB提取液中,用封口膜將離心管封密以防止巰基乙醇揮發(fā).放回水浴中保溫30分鐘,保溫過程中輕晃幾次,保持搖勻.3.??取出Eppenedorf管.置于冰
6、上迅速冷卻到室溫,加入等體積的4ml氯仿-異戊醇(24:1),輕微混合均勻且充分,使其徹底地混合成乳狀液,然后4℃下離心12000rpm10min,輕輕將上清液吸取1ml于1.5ml離心管,放于-20℃冰箱中備用.各加入液的用途:(1)去污劑:CTAB:可將細胞膜裂解,使DNA釋放到提取液中,同時也使組織勻漿中的蛋白質(zhì)變性.EDTA:能與DNase的輔助因子Mg2+結(jié)合,使DNase失去活性,不能降解從細胞中釋放的DNA.(2)還原劑巰基乙醇:它抑制從細胞中釋放的多酚氧仿.防止植物組織發(fā)黃變褐.(3)氯仿—異戊醇:它可把組織勻漿中變性的蛋白質(zhì)除去,將DNA與細胞中的蛋白質(zhì)、碳水化合
7、物等分開除去.(4)RNase:它可去除核酸中的RNA,只留下DNA.3.2.總DNA的純化操作步驟:1.??取出1.5ml離心管,內(nèi)含所取DNA,加入100ul硅珠懸浮液(此液要求先行渦旋再使用),使用渦旋振蕩器大約15s,使之充分混勻,于室溫靜置10分鐘,再振蕩5秒,后離心:8000rpm15s4度,去除上清液得到硅珠——核酸復合物.2.??將復合物用鑷子一次打兩個,打成液狀,使之完全分散,加入漂洗液1ml,再渦旋充分混勻,后離心8000rpm15s棄掉上清液.3