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《arraycgh數(shù)據(jù)的常規(guī)流程分析_上海豐核信息科技有限公司》由會員上傳分享，免費在線閱讀，更多相關(guān)內(nèi)容在應(yīng)用文檔-天天文庫。
1、arrayCGH數(shù)據(jù)的常規(guī)流程分析一介紹異常的DNA拷貝數(shù)變化（CNV）是許多人類疾?。ㄈ绨┌Y、遺傳性疾病、心血管疾病）的一種重要分子機制。作為疾病的一項生物標志，染色體水平的缺失、擴增等變化已成為許多疾病研究的熱點，然而傳統(tǒng)的方法（比如G顯帶，F(xiàn)ISH，CGH等）存在操作繁瑣，分辨率低等問題，難以提供變異區(qū)段的具體信息?；谛酒夹g(shù)的比較基因組雜交（aCGH：array-basedComparativeGenomicHybridization）平臺解決了上述問題。通過在一張芯片上用標記不同熒光素的樣品（病例樣品
2、和對照樣品）進行共雜交可檢測樣本基因組相對于對照基因組的DNA拷貝數(shù)變化（CNV），常用于腫瘤或遺傳性疾病全基因組CNV檢測，直觀地表現(xiàn)出腫瘤及遺傳性疾病基因組DNA在整個染色體組的缺失或擴增。對腫瘤而言缺失片段可能包含抑癌基因，而擴增片段則可能存在致癌基因。二分析流程________________________________________________________________________上海豐核www.microsci.comSCI論文發(fā)表，基金申請，實驗外包4000-331-887三應(yīng)用
3、1：挖掘疾病樣本中DNA層面上的拷貝數(shù)變異，比如在癌癥中發(fā)現(xiàn)特定的DNA變異，并深入挖掘DNA變異區(qū)域是否為基因功能區(qū)域。________________________________________________________________________上海豐核www.microsci.comSCI論文發(fā)表，基金申請，實驗外包4000-331-887四參考文獻1:MarkA.vandeWiel,FranckPicard,Preprocessinganddownstreamanalysisofmicro
4、arrayDNAcopynumberprofiles.BRIEFINGSINBIOINFORMATICS.20102:Venkatraman,E.S.andOlshen,A.B.(2007).Afastercircularbinarysegmentationalgorithmfortheanalysisofarraycghdata.Bioinformatics3:NigelPCarteretal,MethodsandstrategiesforanalyzingcopynumbervariationusingDNA
5、microarrays.NatGenet.2007July4:NancyR.Zhang,JointEstimationofDNACopyNumberfromMultiplePlatforms.BIOINFORMATICS.20055:KentaroNakaoetal.,High-resolutionanalysisofDNAcopynumber________________________________________________________________________上海豐核www.micros
6、ci.comSCI論文發(fā)表，基金申請，實驗外包4000-331-887alterationsincolorectalcancerbyarray-basedcomparativegenomichybridization.Carcinogenesisvol.25no.8pp.1345--1357,2004________________________________________________________________________上海豐核www.microsci.comSCI論文發(fā)表，基金申請，實驗外
7、包4000-331-887
