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《真鯛虹彩病毒lamp檢測(cè)方法的建立》由會(huì)員上傳分享,免費(fèi)在線閱讀,更多相關(guān)內(nèi)容在工程資料-天天文庫(kù)。
1、2018年第35卷第1期真鯛虹彩病毒LAMP檢測(cè)方法的建立袁向芬,石素婷,呂繼洲,吳紹強(qiáng)(中國(guó)檢驗(yàn)檢疫科學(xué)研究院動(dòng)物檢疫研究所,北京 100176)摘 要:為建立一種檢測(cè)真鯛虹彩病毒的環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增(LAMP)方法,滿足口岸、養(yǎng)殖場(chǎng)對(duì)該病的快速監(jiān)測(cè)的需求,本研究比對(duì)分析了GenBank中公布的真鯛虹彩病毒基因組序列,篩選其主要衣殼蛋白MCP基因保守區(qū)序列,進(jìn)行LAMP引物設(shè)計(jì),建立了真鯛虹彩病毒LAMP檢測(cè)方法。對(duì)擴(kuò)增條件進(jìn)行優(yōu)化,確定最佳反應(yīng)條件為62℃,45min。靈敏度試驗(yàn)結(jié)果顯示,該方法最低檢測(cè)限為1
2、00拷貝/μL目的基因。特異性試驗(yàn)結(jié)果顯示,該方法不與流行性造血器官壞死病毒(EHNV)、蛙病毒3型(FV3)、甲魚(yú)虹彩病毒(STIV)發(fā)生交叉反應(yīng)。結(jié)果表明,本研究建立的LAMP方法具有良好的敏感性和特異性。對(duì)5份疑似真鯛虹彩病毒感染的臨床樣品進(jìn)行檢測(cè),發(fā)現(xiàn)檢測(cè)結(jié)果與世界動(dòng)物衛(wèi)生組織(OIE)推薦的PCR方法檢測(cè)結(jié)果符合率為100%。研究表明,本方法具有靈敏度高、特異性強(qiáng),以及儀器設(shè)備簡(jiǎn)單、操作便捷、結(jié)果直觀等優(yōu)點(diǎn),非常適合作為初篩手段,應(yīng)用于養(yǎng)殖場(chǎng)、口岸等一線的疫病監(jiān)測(cè)。關(guān)鍵詞:水生動(dòng)物疫??;真鯛虹彩病毒
3、;環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增;快速檢測(cè)中圖分類(lèi)號(hào):S852.65 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:A 文章編號(hào):1005-944X(2018)01-0095-05DOI:10.3969/j.issn.1005-944X.2018.01.026EstablishmentofLAMPforDetectionofRedSeaBreamIridovirusYuanXiangfen,ShiSuting,LüJizhou,WuShaoqiang(InstituteofAnimalQuarantine,ChineseAcademyofInspecti
4、onandQuarantine,Beijing100176,China)Abstract:TodevelopaLoop-mediatedisothermalampli?cation(LAMP)methodofRedseabreamiridovirus(RSIV)forrapidmonitoringofthediseaseatportofentryand?shery,theRSIVgenomesequencepublishedinGenBankwascomparedandanalyzed.Theconserva
5、tiveregionsequenceofthemaincapsidproteinMCPgenewasscreenedout,theLAMPprimersweredesigned,andLAMPfordetectionofRSIVwasestablished.Theconditionsofampli?cationwereoptimized,andthebestreactionconditionwas62℃,45min.Sensitivitytestresultsshowedthattheminimumdetec
6、tionlimitforthismethodwas100copies/μL.Speci?ctestresultsshowedthatthismethoddidnotcrossreactionwithEHNV,F(xiàn)V3andSTIV,withgoodsensitivityandspeci?city.Bydetectionof5clinicalsamples,resultsshowedthatthecoincidencerateofthetestresultswiththatofthePCRmethodrecomm
7、endedbyOIEwas100%.Thismethodwasarapid,simple,speci?candsensitiveassaywithsimpleinstrumentsandvisualizationresults,whichwassuitableforbeingusedasascreeningmethodformonitoringdiseasesatportsand?shfarms.Keywords:aquaticanimaldiseases;Redseabreamiridovirus;Loop
8、-mediatedisothermalampli?cation(LAMP);rapiddetection真鯛虹彩病毒(Redseabreamiridovirus,年首次在日本四國(guó)島的人工養(yǎng)殖患病真鯛中被發(fā)RSIV)屬于虹彩病毒科(Iridoviridae)、細(xì)胞腫現(xiàn)[3],主要感染真鯛、花鱸、條石鯛等30余種海[1-2]大病毒屬(Megalocytivirus)。該病毒于1990[4-5]水魚(yú)類(lèi)?;?/p>