馬鈴薯a病毒液相芯片快速檢測(cè)方法的建立

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1、中國(guó)農(nóng)學(xué)通報(bào)2013,29(15):37-41ChineseAgriculturalScienceBulletin馬鈴薯A病毒液相芯片快速檢測(cè)方法的建立121221劉洪義,張永江,劉忠梅,辛言言,李桂芬,張洪祥(1黑龍江出入境檢驗(yàn)檢疫局檢驗(yàn)檢疫技術(shù)中心,哈爾濱150001;2中國(guó)檢驗(yàn)檢疫科學(xué)研究院,北京100029)摘要:旨在建立可檢測(cè)馬鈴薯A病毒(PotatovirusA,PVA)的液相芯片快速檢測(cè)技術(shù),用PrimerPremier5.0軟件對(duì)GenBank中PVA核苷酸序列進(jìn)行分析,設(shè)計(jì)其特異性探針并用生物素標(biāo)記。探針偶聯(lián)熒光編碼微球后與PVA的PCR產(chǎn)物雜交反應(yīng),用液相芯片

2、檢測(cè)儀檢測(cè)熒光信號(hào)。結(jié)果顯示該法具有較好的特異性,不與侵染馬鈴薯的番茄黑環(huán)病毒(Tomatoblackringvirus,TBRV)、馬鈴薯紡錘塊莖類病毒(Potatospindletuberviroid,PSTVd)、馬鈴薯Y病毒(PotatovirusY,PVY)及番茄斑萎病毒(Tomatospottedwiltvirus,TSWV)反應(yīng);檢測(cè)靈敏度約為10pg/μL總RNA。該方法可用于PVA的快速檢測(cè)。關(guān)鍵詞:馬鈴薯A病毒;液相芯片;病毒檢測(cè)中圖分類號(hào):S412文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A論文編號(hào):2012-2980PreliminaryDevelopmentofLiquichipDe

3、tectionTechniqueforRapidDetectionofPotatoVirusA121221LiuHongyi,ZhangYongjiang,LiuZhongmei,XinYanyan,LiGuifen,ZhangHongxiang(1TechnicalCenterofInspectionandQuarantine,HeilongjiangEntry-ExitInspectionandQuarantineBureau,Harbin150001;2ChineseAcademyofInspectionandQuarantine,Beijing100029)Abstrac

4、t:TodevelopliquichipmethodfordetectingPotatovirusA(PVA),thenucleotidesequenceofPVAwasanalyzedbyusingthesoftwarePrimerPremier5.0,andspecificprobelabeledwithbiotinwaspreparedandcoupledwithfluorescence-codedmicrospheres,whichwasusedforhybridizationreactiontoRT-PCRproductsofPVA.Liquichipdetection

5、methodforPVAwasestablishedbyusingBio-RadLiquichiptodetectfluorescencesignalinthereactionsystem.Thespecificityofthismethodwasevaluatedbyapplyingtheproposedmethodtodetectfourvirusesinfectingpotato,TBRV,Potatospindletuberviroid(PSTVd),PotatovirusA(PVA)andTomatospottedwiltvirus(TSWV).Theresultsde

6、monstratedbetterspecificitytoPVAandnoreactionwithotherthreeviruses.Thesensitivityofthemethodwas1pg/μLoftotalRNA,whichwasequaltotheconventionalRT-PCRgelelectrophoresismethod.ThesuccessfuldetectionofPVAinpotatosamplesuggestedthefeasibilityofthisprocedureforroutinetesting.Keywords:PotatovirusA;L

7、iquichipdetectiontechnique;virusdetection0引言種薯進(jìn)行嚴(yán)格檢疫,該病毒傳播擴(kuò)散的可能性就非常馬鈴薯A病毒(PotatovirusA)是馬鈴薯Y病毒屬大,具有較高的流行風(fēng)險(xiǎn)。因此該病毒具有非常高的[1-2](Potyvirus)的成員,侵染馬鈴薯后可造成40%以上的損檢疫重要性,已被列入新修訂的《中華人民共和國(guó)進(jìn)失,和馬鈴薯X病毒、馬鈴薯Y病毒混合侵染后,造成境植物檢疫性有害生物名錄》中。該病毒分布于日本、的損失更加嚴(yán)重,是馬鈴薯生產(chǎn)上危害

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