基于logistic回歸模型的彌漫性大b細(xì)胞淋巴瘤分型研究

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1、溫州醫(yī)學(xué)院碩士學(xué)位論文基于logistic回歸模型的彌漫性大B細(xì)胞淋巴瘤分型研究姓名：李海英申請學(xué)位級別：碩士專業(yè)：臨床檢驗(yàn)診斷學(xué)指導(dǎo)教師：俞康2012-05-20溫州醫(yī)學(xué)院碩士學(xué)位論文基于logistic回歸模型的彌漫性大B細(xì)胞淋巴瘤分型研究中文摘要目的：研究彌漫性大B細(xì)胞淋巴瘤病人石蠟標(biāo)本的基因，蛋白表達(dá)，在免疫組化分型的基礎(chǔ)上，探討基因表達(dá)與免疫組化分型之間的關(guān)系，以期為彌漫性大B細(xì)胞淋巴瘤提供新的分組預(yù)測方案。方法：。1．臨床收集彌漫性大B細(xì)胞淋巴瘤病人，切取病變淋巴組織，石蠟包埋。2．石蠟切片，常規(guī)免疫組化檢

2、測CDIO，BCL-6，MUMl，按Hans分類標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行亞型分類。3．石蠟組織中提取RNA，并檢測RNA的質(zhì)量。4．培養(yǎng)淋巴瘤細(xì)胞株Raji，提取RNA，并檢測RNA的質(zhì)量。5．Real—timePCR法檢測BCL-2、CCND2、LM02、FOXPl、BCL一6、HGAL、FNl、CCL3、MME、MUMl和REL基因的表達(dá)。．6．用單因素．109istic回歸分析，篩選有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義的基因，然后用多因素logistic回歸前進(jìn)法(Conditional)建立預(yù)測模型。結(jié)果：1．從石蠟組織中提取的RNA標(biāo)本OD260／

3、OD280在1．6-2．O。之間，RNA濃度范圍在0．04u‘g／u1—3．2ug／ul。2．免疫組化結(jié)果顯示CDIOpH性率17．07％，BCL6陽性率78．05％，MUMl陽性率60．98％，Hans標(biāo)準(zhǔn)分型GCB型24．39％，non-GCB型75．61％。3．Logistic回歸模型單因素分析結(jié)果表明MME、LM02、BCL-2基因與DLBCL的免疫分型有關(guān)(P

4、-3．946--0．887帆2m199啪+042件㈣2)模型判斷DLBCL分型與病理診斷的總符合率為95．1％。結(jié)論：從石蠟中提取RNA，Real-timePCR檢測刪E、LM02、BCL-2基因表達(dá)，建立logistic回歸模型尸三e。3946噸687域L2m19辨m惟m42件LM02／(1+e_3·946m687蝴cL2m199"刪E+0．421．LM02)，利用該模型對DLBCL分型是可行的。[關(guān)鍵詞]彌漫性大B細(xì)胞淋巴瘤：石蠟：基因表達(dá)；logistic回歸；分型溫州醫(yī)學(xué)院碩士學(xué)位論文TheResearchab

5、outDiffuseLarge--B·-cellLymphomaClassificationBaseonLogisticRegressionModelAbstractobjectiveTodetecttheexpressionofmRNAandproteinindiffuselarge·-B··celllymphomapatientssamples，andstudytherelationshipbetweentheexpressionofmRNAandsubgroupsbaseontheimmunohistochemi

6、sty．Methods1．Collect．theparaffinsamplesofdiffuselarge-B—celllymphomapatients．2．DividethepatientsintotwosubgroupsaccordingtotheimmunohischemistyofCDl0，BCL-6andMUMl．3．ExtractRNAfromtheparaffin—embeddedtissuesanddetectthequalityofRNA．4．ExtractRNAfromthelymphomacell

7、lineRajianddetectthequalityofRNA．5．MeasuretheexpressionofBCL一2，CCND2，LM02，F(xiàn)OXP1，·BCL一6，HGAL，F(xiàn)Nl，CCL3，MME，MUMlandRELbyreal-timeRCR．6．Screenthegeneswhichhavestatisticalsignificancebyunivariatelogisticregressionanalysisanddevelopamultivariatemodelthatisbasedontheex

8、pressionofthesegenes．Results1．TheOD260／OD280ofRNAwhichareextractedfromparaffinembeddedtissuesarefrom1．6to2．0andtheconcentrationofRNAarefrom0．041xg／Ixlto3．2p∥¨1．2．Acco