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《廣州管圓線蟲不同發(fā)育時期差異蛋白表達的研究》由會員上傳分享,免費在線閱讀,更多相關(guān)內(nèi)容在學(xué)術(shù)論文-天天文庫。
1、溫州醫(yī)學(xué)院碩士學(xué)位論文廣州管圓線蟲不同發(fā)育時期差異蛋白表達的研究姓名:宋增梅申請學(xué)位級別:碩士專業(yè):臨床檢驗診斷學(xué)指導(dǎo)教師:潘長旺;黃慧聰2012-05-22溫州醫(yī)學(xué)院碩士學(xué)位論文廣州管圓線蟲不同發(fā)育時期蛋白差異表達的研究中文摘要廣州管圓線蟲病(angiostrongyliasiscantonensis),是由廣州管圓線蟲(Angiostrongyluscantonensis)幼蟲侵害人的中樞神經(jīng)系統(tǒng)引起的,是一種人獸共患寄生蟲病。寄生蟲需要通過改變宿主來完成其生活史,因此,他們有根據(jù)宿主環(huán)境來調(diào)節(jié)基因的差異表達的能力。廣州管圓線蟲生活史的完成需要幾個不同的宿主。成蟲寄生在正常
2、宿主大鼠體內(nèi),大鼠可排出I期幼蟲,I期幼蟲經(jīng)水進入中間宿主如福壽螺等軟體動物體內(nèi),并發(fā)育成為Ⅲ期幼蟲;Ill期幼蟲感染大鼠后,穿過血腦屏障發(fā)展成Ⅳ、V期幼蟲,再移行至心、肺部血管內(nèi)發(fā)育成成蟲。蛋白質(zhì)組學(xué)已經(jīng)成為研究蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)、功能和相互作用以及基礎(chǔ)生物學(xué)的典范,可以從整體層次上,更精確、貼切地反映蛋白質(zhì)的表達情況。而線蟲是最好的研究模式生物之一。差異蛋白質(zhì)組學(xué)主要用于篩選和鑒定不同種類和狀態(tài)下各樣本蛋白質(zhì)組之間的區(qū)別和變化,尋找任何能引起樣本間差異蛋白質(zhì)譜的有意義的因素,從而能進一步認識個體生理的發(fā)展與變化。雙向熒光差異凝膠電泳相對于傳統(tǒng)的雙向電泳能夠避免膠與膠之間的變異并提高
3、敏感性,在發(fā)育生物學(xué)和組織蛋白質(zhì)組學(xué)研究中更顯其優(yōu)勢。本研究運用雙向熒光差異凝膠電泳和質(zhì)譜相結(jié)合的蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)分析鑒定廣州管圓線蟲不同發(fā)育時期的差異表達蛋白質(zhì)。目的1.應(yīng)用蛋白質(zhì)組學(xué)雙向熒光差異凝膠電泳和質(zhì)譜技術(shù)分析鑒定廣州管圓線蟲ⅡI期幼蟲、V期雌雄蟲和雌雄成蟲的差異表達蛋白質(zhì)。2.建立一個穩(wěn)定的廣州管圓線蟲不同發(fā)育時期蛋白質(zhì)組的雙向熒光差異凝膠電泳圖譜,利用基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時間質(zhì)譜技術(shù)對廣州管圓線蟲不同發(fā)育時期的差異表達蛋白質(zhì)進行質(zhì)譜分析和鑒定,建立一個可靠的蛋白質(zhì)組學(xué)生物技術(shù)。3.探討可能與廣州管圓線蟲不同發(fā)育時期的生長發(fā)育相關(guān)的蛋白質(zhì),可以為宿主環(huán)境在寄生蟲發(fā)
4、育過程中的調(diào)控或宿主一寄生蟲相互作用中的關(guān)鍵蛋白質(zhì)提供依據(jù)。方法1.廣州管圓線蟲蟲體的收集:實驗室條件下建立廣州管圓線蟲生活史,分別于感染的不同時期收集廣州管圓線蟲ⅡI期幼蟲、V期雌蟲、V期雄蟲、雌成蟲溫州醫(yī)學(xué)院碩士學(xué)位論文和雄成蟲,蟲體用0.01mol/LPBS緩沖液洗滌3次后,-80。C凍存。2.蛋白樣品的制備:將收集的蟲體分別使用裂解液裂解、超聲裂解、離心,獲得的上清,使用Bio.Radproteinassayreagent測定蛋白質(zhì)濃度。分裝后-80。C低溫保存。3.CyDye染料標記蛋白質(zhì):分別用Cy3或Cy5標記樣品,Cy2標記內(nèi)標。4.雙向熒光差異凝膠電泳(2D.
5、DIGE)4.1第一向等電聚焦(IEF)4.2膠條的平衡4.3第二向SDS.PAGE電泳:12.5%的SDS.PAGE凝膠5.雙向熒光凝膠電泳的圖像掃描:利用U]VIaxPowerlook2110XL和TyphoonFLA9000對電泳后的膠板圖像掃描,得到不同顏色的掃描圖。6.DeCyder7.0圖像分析7.質(zhì)譜鑒定:膠內(nèi)酶解,抽提酶解肽段,ZipTip脫鹽,MALDI.TOF.MS鑒定、數(shù)據(jù)庫檢索結(jié)果1.對廣州管圓線蟲5個樣品及內(nèi)標進行雙向熒光差異凝膠電泳后,得到了清晰的蛋白質(zhì)表達譜。用UMaxPowerlook2110XL和TyphoonFLA9000激光掃描儀于熒光模式
6、下進行Cy2、Cy3、Cy5激光掃描,8塊張膠共得到24張熒光掃描圖譜。2.經(jīng)過DeCyder7.0軟件分析,校準后,蛋白表達差異值經(jīng)統(tǒng)計學(xué)分析(f檢驗),篩選出在24張圖譜中均出現(xiàn)的點共183個蛋白點。與成蟲相比,314、537、698、925和980這5個蛋白點在V期幼蟲中表達上調(diào),但沒有表現(xiàn)出顯著的性別差異;與IⅡ期幼蟲相比,點469、488、609、855、859、885、1253、1520和1416等89個蛋白點在成蟲和V期幼蟲中上調(diào),相反的,點623、730、1053、1161和1060等13個蛋白點在IⅡ期幼蟲中出現(xiàn)明顯上調(diào);雌雄蟲及V期幼蟲雌雄比較中,點1496
7、在雄蟲和V期幼蟲雄蟲中均表達上調(diào)。3.質(zhì)譜分析差異蛋白點,獲得肽質(zhì)量指紋圖譜(PMF),經(jīng)數(shù)據(jù)庫檢索,鑒定了其中37個蛋白質(zhì)。10.81%是細胞骨架相關(guān)蛋白,如肌動蛋白和副肌球蛋白;64.86%功能蛋白與代謝過程、免疫反應(yīng)和轉(zhuǎn)錄調(diào)控相關(guān),如熱休克蛋白和變換域相關(guān)蛋白;24.32%是未知的蛋白質(zhì)。這些差異表達蛋白在細胞黏附、細胞凋亡、炎癥反應(yīng)、蛋白質(zhì)水解、抗氧化和免疫調(diào)節(jié)等許多生理和病理過程。4.與V期雌蟲相比,過氧化物氧還蛋白(1253)、吲哚胺2,3雙加氧酶(1520)和TRRAP.1ik