棉花(gossypium hirsutum)纖維中木聚糖合成相關(guān)基因的分子鑒定

棉花(gossypium hirsutum)纖維中木聚糖合成相關(guān)基因的分子鑒定

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1、分類號——密級——UDC——編號——事·尹蹄黲書零碩士學(xué)位論文益蕉[魚壘嬰垡巫塑魚塹型絲塑』墅絲主木聚糖合成相關(guān)基因的分子鑒定學(xué)位申請人姓名:疊弱申請學(xué)位學(xué)生類別:全旦劌塑±申請學(xué)位專業(yè)方向:生塹絲堂魚僉至壘塑鱟指導(dǎo)教師姓名:迸文亮趲妻至窒趲⑧M—ASTE?R'STHE潞碩士學(xué)位論文IUlIILLLLIIIIIILLILMILItlIIIIIILIILUIY2556231棉花(Gossypiurnhirsutum)纖維中木聚糖合成相關(guān)基因的分子鑒定論文作者:饒弱指導(dǎo)教師:許文亮教授李學(xué)寶教授學(xué)科專業(yè):生物化學(xué)與分子生物學(xué)研究方向:植

2、物分子遺傳學(xué)華中師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院2014年5月碩士學(xué)位論文MASTER’STHESISMolecularcharacterizationofgenesinvolvedInxylan-l●lbiosynthesis·cott●fibincottonerATheSisSubmittedinPartialFulfillmentoftheRequirementFortheMasterDegreeinBiochemistryandmolecularbiologyByRaoYuePostgraduateProgramCollegeofLif

3、eScienceCentralChinaNormalUniversitySupervisor:XuWenliangandLiXuebaoAcademicTitle:ProfessorSignatureMay,2014碩士學(xué)位論文MASTER’STHESIS華中師范大學(xué)學(xué)位論文原創(chuàng)性聲明和使用授權(quán)說明原創(chuàng)性聲明本人鄭重聲明:所呈交的學(xué)位論文,是本人在導(dǎo)師指導(dǎo)下,獨立進行研究工作所取得的研究成果。除文中已經(jīng)標(biāo)明引用的內(nèi)容外,本論文不包含任何其他個人或集體己經(jīng)發(fā)表或撰寫過的研究成果。對本文的研究做出貢獻的個人和集體,均已在文中以明確方式標(biāo)

4、明。本聲明的法律結(jié)果由本人承擔(dān)。作者簽名:/贏碉日期:羽件年籮月忍日學(xué)位論文版權(quán)使用授權(quán)書學(xué)位論文作者完全了解華中師范大學(xué)有關(guān)保留、使用學(xué)位論文的規(guī)定,即:研究生在校攻讀學(xué)位期間論文工作的知識產(chǎn)權(quán)單位屬華中師范大學(xué)。學(xué)校有權(quán)保留并向國家有關(guān)部門或機構(gòu)送交論文的復(fù)印件和電子版,允許學(xué)位論文被查閱和借閱;學(xué)??梢怨紝W(xué)位論文的全部或部分內(nèi)容,可以允許采用影印、縮印或其它復(fù)制手段保存、匯編學(xué)位論文。(保密的學(xué)位論文在解密后遵守此規(guī)定)保密論文注釋:本學(xué)位論文屬于保密,在——年解密后適用本授權(quán)書。非保密論文注釋:本學(xué)位論文不屬于保密范圍,適

5、用本授權(quán)書。作者日期本人學(xué)位論文規(guī)定享受作者日期執(zhí)慌鑰神虢嬲:如淖午5-月站日日期:矽坪年f月謝日已經(jīng)認真閱讀“CALLS高校學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫發(fā)布章程",同意將本人的提交“CALLS高校學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫”中全文發(fā)布,并可按“章程”中的相關(guān)權(quán)益。旦童絲丞垡綾籃封趔童J1堂生三一上I二魚玉』至蘭學(xué)、張僥硐挪張俐:加驢j月謠日日期.沙,盱r月氓目碩士學(xué)位論文MASTER’STHESIS摘要棉花是世界上重要的纖維作物和油料作物,棉纖維是研究植物細胞壁發(fā)生和細胞伸長的理想模型之一。成熟棉纖維含有超過90%的纖維素、少量的半纖維素、果膠和蛋

6、白質(zhì)。關(guān)于細胞壁組分(特別是半纖維素)在棉纖維發(fā)育中的作用尚未見報道,半纖維素的改變?nèi)绾斡绊懨蘩w維發(fā)育,如何影響纖維素一半纖維素網(wǎng)絡(luò)而影響纖維品質(zhì)尚知之甚少。本文根據(jù)擬南芥和楊樹中已經(jīng)報道的參與半纖維素木聚糖合成的蛋白,基于生物信息學(xué)方法從棉花公共EST資料室中分離鑒定了20個可能參與棉細胞纖維半纖維素合成的候選基因,對這些基因編碼蛋白的特征進行了詳細分析,并分別選擇了一個參與主鏈合成和還原末端的候選基因進行了功能驗證,主要結(jié)果如下:1.棉花木聚糖合成相關(guān)基因的篩查鑒定及功能預(yù)測通過生物信息學(xué)的方法,基于目前擬南芥和楊樹中木聚糖合成

7、基因的研究,結(jié)合棉花D基因組序列信息,從棉花EST文庫中篩查鑒定了20個可能參與棉花次生細胞壁半纖維素合成的基因,并獲得全長eDNA序列。通過蛋白質(zhì)序列對比分析,跨膜結(jié)構(gòu)域分析,信號肽分析,蛋白定位分析,3D結(jié)構(gòu)分析,蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域分析和進化樹等方法分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn)所分離鑒定的候選基因所編碼的蛋白質(zhì)分屬不同的參與木聚糖生物合成的酶家族,其中,有2個GT47家族的基因,8個GT8家族的基因,5個ESK類基因,4個GXMT類基因和1個RWA類基因,預(yù)測這些基因可能是定位于高爾基體上的II型膜蛋白,并且具有與木聚糖合成相關(guān)的結(jié)構(gòu)域,說明這些候

8、選基因可能參與木聚糖的合成。2.木聚糖合成相關(guān)基因在棉花組織中的表達分析提取棉花不同組織和不同發(fā)育階段棉花纖維的RNA,逆轉(zhuǎn)錄成eDNA。利用半定量RT-PCR和熒光定量RT.PCR方法對這些基因進行表達分析,結(jié)果顯示這些基因均在棉花

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