棉花根響應(yīng)黃萎病菌侵染的轉(zhuǎn)錄組分析

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1、分類(lèi)號(hào)密級(jí)華中農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文棉花根響應(yīng)黃萎病菌侵染的轉(zhuǎn)錄組分析454--transcriptomesequencinganalysisofcottonrootsinoculatedbyVerticiUiumdahliae碩士研究生:學(xué)號(hào):指導(dǎo)老師:指導(dǎo)小組:劉敏2010301110079張獻(xiàn)龍教授聶以春教授郭小平教授林忠旭教授朱龍付副教授涂禮莉副教授專(zhuān)業(yè):作物遺傳育種研究方向:棉花功能基因組論文提交時(shí)間:2013年4月學(xué)位授予日期:2013年6月華中農(nóng)業(yè)大學(xué)植物科學(xué)技術(shù)學(xué)院二零一三年四月一苓一=

2、牛四月華中農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)位論文獨(dú)創(chuàng)性聲明及使用授權(quán)書(shū)。學(xué)fi,瞼乏娃0r抹銜莒血U胃i保蒈i,解律iHJ‘l訂Jfr月¨獨(dú)創(chuàng)性聲明f嘩咝㈣型本人聲明所呈交的論文是我個(gè)人在導(dǎo)師指導(dǎo)下進(jìn)行的研究工作及取得的研究成果。盡我所知,除了文中特別加以標(biāo)注和致謝的地方外,論文中不包含其他人已經(jīng)發(fā)表或撰寫(xiě)過(guò)的研究成果,也不包含為獲得華中農(nóng)業(yè)大學(xué)或其他教育機(jī)構(gòu)的學(xué)位或證書(shū)而使用過(guò)的材料,指導(dǎo)教師對(duì)此進(jìn)行了審定。與我一同工作的同志對(duì)本研究所做的任何貢獻(xiàn)均已在論文中做了明確的說(shuō)明,并表示了謝意。研究生簽名:剝?nèi)r(shí)間:加I≥年6

3、月、7日學(xué)位論文使用授朽l(xiāng)書(shū)本人完全了解華中農(nóng)業(yè)大學(xué)關(guān)于保存、使用學(xué)一立論文的規(guī)定,即學(xué)生必須按照學(xué)校要求提交學(xué)位論文的印刷本和電子版本;學(xué)校有書(shū)保存提交論文的印刷版和電子版,并提供目錄檢索和閱覽服務(wù),可以采用影印、縮印j競(jìng)掃描等復(fù)制手段保存、匯編學(xué)位論文。本人同意華中農(nóng)業(yè)大學(xué)可以用不同方式在不I司媒體上發(fā)表.傳播學(xué)位論文的全部或部分內(nèi)容,為存在館際合作關(guān)系的兄弟高校用,5提供文獻(xiàn)傳遞和交換服務(wù),同時(shí)本人保留在其他媒體發(fā)表論文的權(quán)力。注:保密學(xué)位論文(即涉及技術(shù)秘密、商業(yè)秘密或lp請(qǐng)專(zhuān)利等潛在需要提交

4、保密的論文)在解密后適用于本授權(quán)書(shū)。學(xué)位-侖文作者簽名:安1西文導(dǎo)師簽名:j蝴比4簽名曰期:歷哆年易周7日簽名日期:U瀘哆每£P(guān)7E棉花根響應(yīng)黃萎病菌侵染的454轉(zhuǎn)錄組分析目錄摘要???????????????????????????????????????????一iAbstract?.....?????????.....??????????????.?????.............??.??..ii縮略語(yǔ)表???????????????????????????????iv1前言????????

5、??????????????????????????????????..11.1植物抗黃萎病研究進(jìn)展??????????????????????.11.2植物抗病基因的克隆與鑒定????????????????????21.2.1利用轉(zhuǎn)座子標(biāo)簽技術(shù)克隆植物抗病基因????????????..21.2.2利用圖位克隆法克隆植物抗病基因??????????????.31.2.3利用同源序列法克隆植物抗病基因??????????????.41.2.4通過(guò)表達(dá)譜測(cè)序分離植物抗病基因??????????????

6、.41.2.4.1構(gòu)建抑制消減雜交文庫(kù)(SSH)分離植物抗病基因??????.41.2.4.2通過(guò)RNA.seq表達(dá)譜測(cè)序分離植物抗病基因???????一51.3454轉(zhuǎn)錄組測(cè)序方法介紹?????????????????????.61.3.1454轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的實(shí)驗(yàn)步驟??????????????????71.3.2454轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的運(yùn)用????????????????????71.3.2.1對(duì)物種進(jìn)行基因組測(cè)序及重測(cè)序?????????????71.3.2.2通過(guò)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序發(fā)掘新基因、研究基因的表達(dá)調(diào)

7、控模式???81.3.2.3SNP位點(diǎn),挖掘分子標(biāo)記????????????????91.3.2.4發(fā)現(xiàn)sRNA?????????????????????????????.91.4植物類(lèi)受體蛋白及其研究進(jìn)展???????????????????91.5病毒介導(dǎo)的基因沉默技術(shù)(Virus—inducedgenesilencing,VIGS)???101.5.1植物轉(zhuǎn)錄后的基因沉默現(xiàn)象(PTGS)????????????.101.5.2VIGS機(jī)制及其應(yīng)用研究進(jìn)展????????????????..1l1

8、.6研究的目的與意義???????????????????????.122實(shí)驗(yàn)材料與方法???????????????????????????122.1實(shí)驗(yàn)材料???????????????????????????.122.1.1棉花材料和菌種??????????????????????122.1.2培養(yǎng)基??????????????????????????122.1.3實(shí)驗(yàn)試劑?????????????????????????122.2實(shí)驗(yàn)方法????

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