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《小麥灌漿期熱脅迫轉(zhuǎn)錄表達(dá)譜分析及MADS-box轉(zhuǎn)錄因子的克隆》由會(huì)員上傳分享，免費(fèi)在線閱讀，更多相關(guān)內(nèi)容在學(xué)術(shù)論文-天天文庫。
1、分類號(hào)密級(jí)UDC單位代碼10435碩士學(xué)位論文小麥灌漿期熱脅迫轉(zhuǎn)錄表達(dá)譜分析及MADS-box轉(zhuǎn)錄因子的克隆AnalysisofTranscriptionalExpressionProfilingofWheatDuringGrainFillingStageandCloningofMADS-boxTranscriptionFactor研究生姓名王利彬指導(dǎo)教師趙振東研究員學(xué)科專業(yè)作物遺傳育種研究方向小麥遺傳育種中國(guó)?青島二0一八年六月AnalysisofTranscriptionalExpressionPro
2、filingofWheatDuringGrainFillingStageandCloningofMADS-boxTranscriptionFactorThesissubmittedtoQingdaoAgriculturalUniversityInFulfillmentoftheRequirementfortheDegreeofMasterofAgronomyWangLibin（CollegeofAgronomy）Supervisor:ZhaoZhendongQingdao﹒ChinaJune,2018獨(dú)創(chuàng)
3、性聲明本人聲明所呈交的論文是我個(gè)人在導(dǎo)師指導(dǎo)下進(jìn)行的研究工作及取得的研究成果。盡我所知，除了文中特別加以標(biāo)注和致謝的地方外，論文中不包含其他人已經(jīng)發(fā)表或撰寫過的研究成果，也不包含為獲得青島農(nóng)業(yè)大學(xué)或其它教育機(jī)構(gòu)的學(xué)位或證書而使用過的材料。與我一同工作的同志對(duì)本研究所做的任何貢獻(xiàn)均已在論文中作了明確的說明并表示了謝意。研究生簽名：時(shí)間：年月日關(guān)于論文使用授權(quán)的說明本人完全了解青島農(nóng)業(yè)大學(xué)有關(guān)保留、使用學(xué)位論文的規(guī)定，即：學(xué)校有權(quán)保留送交論文的復(fù)印件和磁盤，允許論文被查閱和借閱，可以采用影印、縮印或掃描等復(fù)制
4、手段保存、匯編學(xué)位論文。同意青島農(nóng)業(yè)大學(xué)可以用不同方式在不同媒體上發(fā)表、傳播學(xué)位論文的全部或部分內(nèi)容。(保密的學(xué)位論文在解密后應(yīng)遵守此協(xié)議)研究生簽名：時(shí)間：年月日導(dǎo)師簽名：時(shí)間：年月日青島農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文摘要小麥灌漿期熱脅迫轉(zhuǎn)錄表達(dá)譜分析及MADS-box轉(zhuǎn)錄因子的克隆摘要小麥?zhǔn)俏覈?guó)最主要的糧食作物之一，近年來，隨著全球氣溫的普遍升高，特別是在灌漿期的高溫，對(duì)小麥的產(chǎn)量和品質(zhì)產(chǎn)生許多不利的影響。因此，我們以耐熱品種菏麥13和感熱品種臨麥2號(hào)在灌漿期進(jìn)行42℃高溫?zé)崦{迫處理1h為實(shí)驗(yàn)材料，對(duì)熱脅迫籽粒
5、和旗葉及其對(duì)照進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序。運(yùn)用RNA-seq技術(shù)，以期挖掘熱脅迫響應(yīng)基因，為提高小麥品質(zhì)和產(chǎn)量提供參考。取得的主要結(jié)果如下：1.8個(gè)比對(duì)分析都得到了大約1500萬條reads，但是完全比對(duì)到參考序列的reads在表達(dá)模式上存在差異，兩個(gè)品種旗葉中大約有1000萬條完全匹配的reads，而在菏麥籽粒中大約800萬條，在臨麥2號(hào)中大約有700萬條；8個(gè)比對(duì)方案都得到了大約7萬個(gè)轉(zhuǎn)錄本，兩個(gè)品種旗葉中得到的轉(zhuǎn)錄本比籽粒中多1000-2000個(gè)。8種比對(duì)方案的差異表達(dá)基因：上調(diào)基因300-1200個(gè)，下調(diào)基因
6、400-500個(gè)。2.根據(jù)表達(dá)量距離算法進(jìn)行聚類分析發(fā)現(xiàn)菏麥13和臨麥2號(hào)在旗葉和籽?；虮磉_(dá)模式以及在處理差異之間存在明顯的不同。對(duì)特異表達(dá)分析發(fā)現(xiàn)，菏麥13旗葉和籽粒受熱脅迫特異表達(dá)基因較臨麥2號(hào)熱脅迫特異表達(dá)基因明顯增多，說明菏麥13對(duì)熱脅迫表現(xiàn)出更多的基因響應(yīng)；通過Reads在基因組染色體上的分布，我們發(fā)現(xiàn)在4A染色體上Reads分布最為廣泛，說明在4A染色體上分布更多的熱脅迫相關(guān)基因，熱脅迫基因通過復(fù)制或者依賴染色體片段復(fù)制在染色體上可以形成“基因簇”，這些“基因簇”可能對(duì)調(diào)控?zé)崦{迫響應(yīng)具有“累
7、加效應(yīng)”，使小麥具有更好的耐熱性。3.GO分析發(fā)現(xiàn)，籽粒熱脅迫響應(yīng)基因主要在光合作用、碳固定和蛋白質(zhì)寡聚化等功能顯著富集；旗葉熱脅迫響應(yīng)基因主要在光合作用、呼吸作用、蛋白質(zhì)寡聚化、過氧化氫代謝、逆境調(diào)控、翻譯調(diào)控、細(xì)胞凋亡等生物學(xué)過程顯著富集。4.轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中差異表達(dá)的基因可能同時(shí)參與抗病表達(dá)，表現(xiàn)出耐熱與抗病共表達(dá)，例如麥芽糖凝集素、絲氨酸蛋白酶抑制劑、BnaC03g11030D等。分析了類苯基丙烷合成Pathway可能參與小麥熱脅迫響應(yīng)。5.克隆了一個(gè)響應(yīng)熱脅迫的MADS-box轉(zhuǎn)錄因子基因TaWM2
8、，進(jìn)化分析發(fā)現(xiàn)其與普通小麥和粗山羊草的MADS-box基因同源性較高。關(guān)鍵詞：小麥；高溫脅迫；轉(zhuǎn)錄組；基因挖掘；MADS-box轉(zhuǎn)錄因子1青島農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文AbstractAnalysisofTranscriptionalExpressionProfilingofWheatDuringGrainFillingStageandCloningofMADS-boxTranscriptionFactorAbstractWheat
