甘薯冷誘導轉(zhuǎn)錄組測序及轉(zhuǎn)錄因子swdreb1b在抗冷調(diào)節(jié)中的作用

《甘薯冷誘導轉(zhuǎn)錄組測序及轉(zhuǎn)錄因子swdreb1b在抗冷調(diào)節(jié)中的作用》由會員上傳分享，免費在線閱讀，更多相關(guān)內(nèi)容在學術(shù)論文-天天文庫。

1、‘＇．社分類號＿型＿密級不保密ＵＤＣ６３３全曰制碩王專業(yè)學位研究生學位論文甘馨冷誘導轉(zhuǎn)錄組測序及轉(zhuǎn)錄因子ＳｗＤＲＥＢｌＢ在抗冷調(diào)節(jié)中的作用作者姓名：趙曉飛指導教師：楊虎清副教授專業(yè)學位名稱；農(nóng)業(yè)推廣碩±領(lǐng)域名稱：食品加工與安全研究方向：農(nóng)產(chǎn)品膽藏與保鮮所在學院：農(nóng)業(yè)與食品科學學院論巧日期：２０１５年１２月２１日浙江農(nóng)林大學２０１５年１２月獨創(chuàng)性聲明本人聲明，所呈交的學位論文，是受浙江省自然科學基金項目（Ｙ１４Ｃ２０００５２）＂＂ＳＣＢＦ的，甘墓冷誘導轉(zhuǎn)錄因子ｐ抗冷

2、特性研究資助，在指導教師指導下通過我的努力取得的成果，并且是自己撰寫的。盡我所知，除了文中作了標注和致謝中己經(jīng)作了答謝的地方外，論文中不包含其他人發(fā)表或撰寫過的研究成果，也不包含在浙江一農(nóng)林大學或其他教育機構(gòu)獲得學位或證書而使用過的材料。與我同對本研究做出貢獻的同志，都在論文中作了明確的說明并表示了謝意。如被查有嚴重侵犯他人知識產(chǎn)權(quán)的行為，由本人承擔應有的責任。學位論文作者親筆簽名：義日期：Ｖ皮辜Ｐ．Ｗ論文使用授權(quán)的說明本人完全了解浙江農(nóng)林大學有關(guān)保留、使用學位論文的規(guī)定，即學校有權(quán)送交論文的復印件，允許論文被

3、查閱和借閱；學?？晒颊撐牡娜炕虿糠謨?nèi)容，可Ｗ采用影印、縮印或其他復制手段保存論文。保密，在＿＿年后解密可適用本授權(quán)書?！酰崳姴槐Ｃ?，本學位論文屬＂于不＂保密。０（請在方框內(nèi)打Ｖ）學位論文作者親筆簽名：曰期：來主巧＿指導教師親筆簽名：卸考曰期：風?！牐玻崳奪hejiangA&FUniversityDissertationfortheDegreeofMasterTranscriptomeanalysisUnderColdStressandFunctionidentificationofSwDREB1Bincoldin

4、ductionfromsweetpotato（Ipomoeabataasa）Candidate:ZhaoXiao-feiAdviser:YangHu-qingAssociateprofessorSpecialty:FoodProcessandSecurityDateofSubmission:December21,2015ZhejiangA&FUniversityLin’an,zhejiangprovince,P.R.ChinaDecember,2015摘要摘要甘薯（Ipomoeabatatas(L.)Lam.）作為世界上第4大糧食作物，除了食用外

5、，還是重要的工業(yè)原料。甘薯喜溫怕冷，在貯藏過程中極易發(fā)生冷害。然而目前對甘薯冷害在分子水平的研究鮮有報道。本研究利用轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)獲得了塊根在低溫脅迫下的表達數(shù)據(jù)譜并對篩選出的甘薯DREB(SwDREB)家族基因進行了克隆、表達以及與抗氧化酶活性間的相關(guān)性做了研究，主要研究結(jié)果如下：（1）測序產(chǎn)生了8.25Gb的高質(zhì)量數(shù)據(jù)，40.86Mb的cleanreads。組裝拼接后共獲得201,388條Transcripts和60,170條Unigenes；N50分別為2035bp、1455bp；平均長度分別為1352.32bp、781.90bp。（2）通

6、過與不同數(shù)據(jù)庫比對，共有34,168條Unigenes獲得了注釋信息，其中注釋到GO數(shù)據(jù)的有22,723條，7,437條Unigenes注釋到148條KEGG途徑。有16條Unigenes被注釋到DREB家族。26,002條Unigenes未獲得注釋，這其中可能有部分屬于甘薯特有基因。（3）低溫脅迫下，實驗組與對照組相比，共有4,470條差異表達基因，其中上條表達的Unigene有4,059條，下調(diào)表達的有411條。（4）利用PCR技術(shù)克隆得到了兩條DREB基因：SwDREB1B、SwDREB2。SwDREB1B的ORF全長為711bp，編碼23

7、7個氨基酸，無內(nèi)含子，含有一個AP2結(jié)構(gòu)域，氨基酸序列比對和系統(tǒng)進化樹分析該基因?qū)儆贒REB1類成員。SwDREB2基因ORF全長726bp，含有一個AP2結(jié)合域，含有典型的YRG和RAYD保守區(qū)，序列比對和系統(tǒng)進化樹分析該基因?qū)儆贒REB2類。（5）利用qRT-PCR對SwDREB1B基因的組織特異性及低溫逆境誘導表達進行分析，結(jié)果表明：SwDREB1B在甘薯中均有表達，不具有組織特異性；低溫誘導上調(diào)表達；SwDREB1B在低溫下的表達與多種抗氧化酶的活性呈正相關(guān)；在葉片和塊根中，CuZnSOD、APX、β-淀粉酶受低溫誘導表達，而CAT只在塊

8、根中被誘導。關(guān)鍵詞：甘薯；轉(zhuǎn)錄組測序；DREB/CBF轉(zhuǎn)錄因子；低溫脅迫；抗氧化酶IABSTRACTABSTRACTSweetpotat