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《角蟾科三亞科代表物種的線粒體基因組全序列研究》由會員上傳分享，免費在線閱讀，更多相關內容在學術論文-天天文庫。
1、AnalysiscompletemitochondrialgenomesinrepresentativespeciesofthreesubfamiliesofMegophryidae(Amphibia，Anura)ByXiangTianminADissertationSubmittedtoTheUniversityofChineseAcademyofSciencesInpartialfulfillmentoftherequirementForthedegreeofMasterofDepartmentofamphibiansandrepti
2、lesChengduInstituteofBiology,ChineseAcademyofSciencesMay,2013中文摘要摘要角蟾科三亞科代表物種的線粒體基因組全序列研究向天敏(動物學)指導教師：謝鋒研究員中國科學院成都生物研究所，成都6100411黜㈣Y243112線粒體基因組(mtDNA)是動物體內存在的核外遺傳信息載體，分子量小，進化速率快，一般沒有間隔序列，結構簡單，母系遺傳，一般不發(fā)生倒位、易位等畸變與重組，使之易于被檢測。另外，各個基因具有較寬范圍的進化速率，因而可在一個大的時間跨度上提供分析，這使得mtDNA成為良好
3、的分子系統(tǒng)發(fā)育學標記。比較線粒體基因組的基因排列順序可以作為一個有力的系統(tǒng)發(fā)育研究的工具，尤其是那些具有共同祖先的類群。本論文采用常規(guī)PCR和長PCR技術對角蟾科三亞科3個代表物種的線粒體基因組全序列進行測定，并結合NCBI數據庫中的無尾目動物的線粒體基因組全序列，探討了角蟾科在無尾目中的系統(tǒng)發(fā)生地位。獲得以下結果：1．所測得的角蟾科三個代表物種線粒體基因組，分別為沙坪角蟾(Megophrysshapingensis)(17，631bp)、峨山掌突蟾(Paramegophrysoshanensis)(17，747bp)、大齒蟾(Oreol
4、alaxmajor)(17,479bp控制區(qū)以及tRNA-Phe未測全)。角蟾亞科代表物種沙坪角蟾線粒體的基因組成、基因順序與鋤足蟾科的強刃鋤足蟾(PelobatescuItripes)線粒體基因組一致，呈現典型的脊椎動物排布方式，包含13個蛋白質編碼基因(PCG)，22個tRNA基因，2個rRNA和1個D—loop區(qū)；擬髭蟾亞科代表物種大齒蟾與掌突蟾亞科代表物種峨山掌突蟾線粒體的基因組成、基因順序發(fā)生了改變和重排，大齒蟾線粒體的基因組成、基因順序大致與脊椎動物動物排布方式一致，包含13個蛋白質編碼基因，23個tRNA基因，2個rRNA和
5、1個D—loop區(qū)，但多了個tRNA-Met，同時，tRNA一唧移至D．100p的上游；峨山掌突蟾線粒體基因組成的基因排列變化較大，tRNA．Trp移位到@場的上游并且已經失去了編碼功能，多了一個tRNA-Met拷貝，tRNA．Val移位到tRNA-Metl的下游以及tRNA-Pro移位到tRNA-Met2的上游，其余各基因順序與沙坪角蟾線粒體基因組一致，包含13個蛋白質編碼基因(PCG)，22個tRNA基因(tRNA—Trp缺失，額外多了個tRNA-Met)，2個核糖體基因和一個D．100p區(qū)。以上兩種線粒體基因組的組成和排布方式在兩棲
6、動物中首次發(fā)現，將它們分別命角蟾科三亞科代表物種的線粒體基因組全序列研究名為類型29和類型30，豐富了兩棲類動物的線粒體基因組排列類型。研究結果支持掌突蟾亞科為一獨立的亞科。2．角蟾科物種的蛋白質編碼基因中使用最多的起始密碼子是ATG，其次是GTG；使用最多的終止密碼子是TAR；3．在始蛙亞目(Archaeobatrachia)和中蛙亞目(Mesobatrachia)物種中沒有出現串聯(lián)重復tRNA-Met，幾乎沒有出現基因的重排。在所測得的角蟾科三個亞科代表物種中，角蟾亞科中沙坪角蟾呈現典型的脊椎動物排布方式，而擬髭蟾亞科中大齒蟾與掌突蟾
7、亞科中峨山掌突蟾出現了串聯(lián)重復tRNA-Met，這與新蛙亞目中的叉舌蛙亞科(Dicroglossinae)一樣，并且發(fā)生了tRNA的移位和消失，說明掌突蟾亞科進化速率比角蟾亞科快，角蟾亞科物種較為原始。4．研究基于線粒體基因組全序列的11個蛋白編碼基因和2個rRNA對無尾目60個物種構建系統(tǒng)發(fā)生樹(BI、ML)，系統(tǒng)發(fā)生樹的結果強烈支持鋤足蟾超科居于始蛙亞目與新蛙亞目之間，屬于過渡類群并且與新蛙亞目形成姐妹關系。角蟾科內三個亞科的系統(tǒng)發(fā)育關系為(角蟾亞科(擬髭蟾亞科，掌突蟾亞科))。支持角蟾亞科分化較早，擬髭蟾亞科和掌突蟾亞科分化較晚。關
8、鍵詞：角蟾科，線粒體基因組，系統(tǒng)發(fā)生關系英文摘要Analysisofcompletemitochondrialgenomesinrepresentativespeciesofthreesubf
