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《9-植物DNA分子標(biāo)記》由會(huì)員上傳分享,免費(fèi)在線閱讀,更多相關(guān)內(nèi)容在教育資源-天天文庫(kù)。
1、植物DNA分子標(biāo)記分子標(biāo)記的概念廣義的分子標(biāo)記(molecularmarker):可遺傳的并可檢測(cè)的DNA序列或蛋白。包括蛋白質(zhì)標(biāo)記和DNA標(biāo)記(狹義的分子標(biāo)記)。蛋白質(zhì)標(biāo)記包括動(dòng)植物蛋白、同工酶及等位酶理想的分子標(biāo)記:1.高多態(tài)性2.共顯性遺傳*3.能明確辨別等位基因4.遍布整個(gè)基因組5.無基因多效性**6.檢測(cè)手段簡(jiǎn)單快速7.成本低廉8.重復(fù)性好*雜合子的一對(duì)等位基因各自都具有自己的表型效應(yīng),稱為共顯性(codominance)**基因多效性(genepleiotropism):一個(gè)基因產(chǎn)生多種表型效應(yīng)的現(xiàn)象。DNA分子標(biāo)記(DNAmolecularmarker)直接在DNA分子水平
2、上檢測(cè)生物間的差異,是DNA水平上遺傳變異的直接反應(yīng)。隨著分子生物學(xué)技術(shù)的發(fā)展,現(xiàn)在DNA分子標(biāo)記技術(shù)已有數(shù)十種,廣泛應(yīng)用于遺傳育種、基因組作圖、基因定位、物種親緣關(guān)系鑒別、基因庫(kù)構(gòu)建、基因克隆等方面。DNA分子標(biāo)記大多以電泳譜帶的形式表現(xiàn),分為非PCR依賴的分子標(biāo)記(基于Southern雜交技術(shù)的分子標(biāo)記)和PCR依賴的分子標(biāo)記。非PCR依賴的分子標(biāo)記(基于Southern雜交技術(shù)的分子標(biāo)記)包括:限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性標(biāo)記(restrictionfragmentlengthpolymorphism,RFLP)原位雜交(insituhybridization)PCR依賴的分子標(biāo)記:隨機(jī)擴(kuò)
3、增多態(tài)性DNA標(biāo)記(randomamplificationpolymorphismDNA,RAPD)DNA擴(kuò)增指紋印記(DNAamplificationfingerprinting,DAF)簡(jiǎn)單序列重復(fù)標(biāo)記(simplesequencerepeat,SSR)隨機(jī)引物聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(arbitrarilyprimedPCR,AP-PCR)擴(kuò)增片段長(zhǎng)度多態(tài)性標(biāo)記(amplifiedfragmentlengthpolymorphism,AFLP)基于分子雜交技術(shù)的分子標(biāo)記技術(shù)此類標(biāo)記技術(shù)是利用限制性內(nèi)切酶解及凝膠電泳分離不同的生物DNA分子,然后用經(jīng)標(biāo)記的特異DNA探針與之進(jìn)行雜交,通過放射自
4、顯影或非同位素顯色技術(shù)來揭示DNA的多態(tài)性。分子雜交:由具有互補(bǔ)堿基順序的任何兩條單鏈核酸分子片斷形成雙鏈的過程。染色體原位雜交是指DNA探針與染色體上的DNA雜交,并在染色體上直接進(jìn)行檢測(cè)的分子技術(shù),其原理是兩條核苷酸單鏈片斷在適宜的條件下,通過氫鍵結(jié)合,形成DNA-DNA,DNA-RNA,RNA-RNA雙鍵分子,用帶有標(biāo)記的DNA或者RNA片斷作為核酸探針,與細(xì)胞內(nèi)染色體雜交,用放射自顯影等方法予以顯示,在熒光顯微鏡下觀察目的mRNA或者DNA的存在與定位。InsituhybridizationForinsituhybridization,atissuesampleisincubat
5、edwithalabelednucleicacidprobe,excessprobeiswashedawayandthelocationofhybridizedprobeisexamined.Thetechniqueenablesthespatiallocalizationofgeneexpressiontobedeterminedaswellasthelocationofindividualgenesonchromosomes.bcdaFig.5GISHimagesofchromosomesoftetraploidanddiploidFestuloliumprogenies.TheDN
6、AofL.perennewasusedasprobe,andshownasbluecolor.ThechromosomesofF.pratensiswereshownaspalebluecolor.Translocationbreakpointsareindicatedinaandcbyarrows.(a)Bx350-184,a28-chromosomegenomewithatleast14intergenerictranslocations,someofwhichhavetwobreakpointsinanarm(arrows).Bar:10μm.(b)Bx351-160,a28-ch
7、romosomegenomewithintergenerictranslocations.Bar:20μm.(c)Bx350-177withfertilepollen,a28-chromosomegenomecomprisingapproximatelyequalamountofLoliumandFestucaDNAwith9intergenerictranslocations,someofwhichhavetwobreakpoin