龍頭魚微衛(wèi)星標(biāo)記的開發(fā)及篩選【畢業(yè)論文】

龍頭魚微衛(wèi)星標(biāo)記的開發(fā)及篩選【畢業(yè)論文】

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1、本科畢業(yè)論文目錄本科畢業(yè)論文(20屆)龍頭魚微衛(wèi)星標(biāo)記的開發(fā)及篩選專業(yè):生物科學(xué)本科畢業(yè)論文目錄目錄摘要IAbstractII引言11.材料與方法21.1材料21.1.1儀器與設(shè)備21.1.2藥品與試劑21.2實(shí)驗(yàn)方法21.2.1龍頭魚基因組DNA的提取21.2.2酶切31.2.3接頭的制備與連接31.2.4龍頭魚基因組文庫的建立31.2.5探針雜交和磁珠富集41.2.6富含微衛(wèi)星序列的PCR產(chǎn)物及測序41.2.7微衛(wèi)星PCR引物和電泳51.2.8聚丙烯酰胺凝膠銀染52.結(jié)果與分析72.1DNA提取結(jié)果72.2

2、酶切及適宜基因組片段的獲得72.3菌落PCR檢測重組率82.4測序結(jié)果及序列分析93.小結(jié)113.1磁珠富集法113.2測序結(jié)果及序列分析113.3討論12參考文獻(xiàn)15致謝17千萬不要刪除行尾的分節(jié)符,此行不會被打印。在目錄上點(diǎn)右鍵“更新域”,然后“更新整個(gè)目錄”。本科畢業(yè)論文中文摘要本科畢業(yè)論文中文摘要摘要本科畢業(yè)論文中文摘要本科畢業(yè)論文中文摘要[摘要]為了研究龍頭魚(Harpodonneherus)的群體遺傳結(jié)構(gòu),本實(shí)驗(yàn)采用富集文庫法構(gòu)建龍頭魚的微衛(wèi)星富集文庫。將龍頭魚基因組DNA用MseⅠ限制性內(nèi)切酶精心

3、酶切后,回收并純化250bp-1000bp左右的片段,用生物素標(biāo)記的簡單重復(fù)序列作探針與其雜交,雜交復(fù)合物結(jié)合到包被有鏈霉親和素的磁珠上,經(jīng)一系列的洗滌過程,去除磁珠表面不含有微衛(wèi)星的片段。將吸附在磁珠上的片段洗脫,PCR擴(kuò)增放大,再進(jìn)行克隆和測序,根據(jù)微衛(wèi)星兩端的保守序列設(shè)計(jì)引物,即可得到微衛(wèi)星分子標(biāo)記。從菌落中篩選出的90個(gè)陽性克隆進(jìn)行測序,其中有62個(gè)具有微衛(wèi)星序列,所占的比例為68.9%。根據(jù)自行分離得到的序列共設(shè)計(jì)引物28對,其中有21對能成功擴(kuò)增出條帶,對舟山海域的龍頭魚樣本進(jìn)行群體遺傳多樣性研究,

4、其中5對引物擴(kuò)增出條帶清晰,多態(tài)性高的目的片段。篩選出的微衛(wèi)星標(biāo)記可為今后研究龍頭魚的分子遺傳育種提供有效的遺傳標(biāo)記。[關(guān)鍵詞]微衛(wèi)星;龍頭魚;種群多樣性;多態(tài)性;分子標(biāo)記。本科畢業(yè)論文英文摘要Abstract[Abstract]PartialgenomiclibrarywasconstructedinordertostudythegeneticstructureofHarpadonnehereus.Inthisexperiment,weisolatedmicrosatelliteDNAfromHarpadon

5、nehereusgenomewiththismethod.HarpadonnehereusgenomicDNAwasextractedanddigestedwithrestrictionenzymeMseI.Fragmentsover250bpwereisolatedandpurifiedandthenligatedwithshortlinkers.ThisgenomicDNAwashybridizedwithabiotin-labeledmicrosatelliteprobe(CA)15.Thehybridm

6、ixturewasincubatedwithmagneticbeadscoatedwithstreptavidin.Afterwashingtoremovethenon-SRSfragmentstheelutedsingle-strandedDNAcontainstheselectedmicrosatelliteDNA.Ninetypositiveclonesfromthe(CA)15enrichedgenomiclibraryweresequencedand62(68.9%)sequencescontaine

7、dsufficientrepeatmotifs(di-,tri-andtetra-nucleotide).TostudytheZhoushanpopulationgeneticdiversityofHarpadonnehereusFromtheprimersdesignedforthe28microsatelliteloci,and21weresuccessfullyamplifiedand5lociwerepolymorphic.ThemicrosatellitelociofHarpadonnehereuso

8、btainedfromthepresentstudyarepotentialforfurtherinvestigationofgeneticdiversityinHarpadonnehereus.[Keywords]Microsatellite;Harpadonnehereus;Populationdiversity;Polymorph;Molecularmarkers本科畢業(yè)論文引言

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