龍頭魚微衛(wèi)星標記的開發(fā)及篩選【開題報告+文獻綜述+畢業(yè)論文】

龍頭魚微衛(wèi)星標記的開發(fā)及篩選【開題報告+文獻綜述+畢業(yè)論文】

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1、本科畢業(yè)論文目錄本科畢業(yè)論文開題報告生物科學龍頭魚微衛(wèi)星標記的開發(fā)及篩選一、論述龍頭魚微衛(wèi)星多態(tài)標記研究現(xiàn)狀,說明選題的依據(jù)和意義目前,國內(nèi)對龍頭魚的研究主要集中在屬間的遠緣雜交等方面,但是尚未研究成功。對龍頭魚微衛(wèi)星多態(tài)標記的開發(fā)目前尚未見報道,而本文主要是通過對龍頭魚微衛(wèi)星進一步研究,希望能夠利用遠緣雜交所帶來的雜交優(yōu)勢獲得具有優(yōu)良性狀子代,那在生產(chǎn)上或遺傳學上都將有重大意義。微衛(wèi)星標記技術是基于基因組DNA水平的差異進行檢測,不受組織,器官種類、環(huán)境條件等因素影響,因此可作為水生動物種質(zhì)鑒定、親緣關系及種質(zhì)分類等研究的理想標記。龍頭魚俗稱狗母魚,屬于脊索動物門,硬骨魚綱,燈籠魚目,

2、狗母魚科,龍頭魚屬。其形體柔軟,長形,略側扁,頭背稍圓。吻短,鈍圓,口甚大。龍頭魚生活于暖溫性海洋的中下層。運動能力不強。常棲息于淺海泥底的環(huán)境中。每年春季為產(chǎn)卵期。雜食性,以小魚、小蝦、底棲動物為食。分布于印度洋和太平洋、我國南海、東海和黃海南部均產(chǎn)之、尤以浙江的溫、臺和舟山近海以及福建沿海產(chǎn)量較多。屬暖水性底層近岸魚類,緩潮時常到上層。一般只在近海作短距離移動。屬捕食性魚類,生長甚快。以3~4月和9~12月漁獲為大。鑒于恢復與保護野生龍頭魚資源的需要,有必要對龍頭魚的種質(zhì)遺傳基礎和種質(zhì)資源鑒定開展深入的研究。目前,有關龍頭魚群體遺傳背景方面的研究很少,僅見于部分學者對龍頭魚野生群體和

3、養(yǎng)殖群體進行了RAPD分析。然而,迄今為止,本科畢業(yè)論文目錄尚未見有關龍頭魚微衛(wèi)星標記研究方面的報道,這嚴重制約了微衛(wèi)星標記在龍頭魚遺傳學研究中的應用。因此,篩選多態(tài)信息含量豐富的龍頭魚微衛(wèi)星標記,分析龍頭魚群體遺傳結構用于標記選擇育種等,具有重要的理論意義和應用價值。然而,利用微衛(wèi)星標記最關鍵的一步就是微衛(wèi)星位點的分離和富集。目前,常用的富集微衛(wèi)星標記的方法主要有3種:①構建目標生物小片段插入基因組DNA文庫,通過含有重復序列的探針篩選含有微衛(wèi)星的陽性克隆;②通過生物素探針結合鏈霉親和素包被的磁珠進行微衛(wèi)星DNA片段的富集;③從公共核酸序列數(shù)據(jù)庫資源中篩選微衛(wèi)星。其中,傳統(tǒng)的構建小片段

4、插入基因組文庫和利用磁珠富集技術篩選微衛(wèi)星的方法非常繁瑣,不僅需要大量的時間和經(jīng)費,而且獲得微衛(wèi)星的效率較低;在當前公共核酸數(shù)據(jù)庫中也沒有足夠的有用序列來進行微衛(wèi)星標記的篩選。這嚴重阻礙了微衛(wèi)星技術在許多物種上的推廣和應用。因此,必須發(fā)展新的方法來解決這道難題。二、研究的基本內(nèi)容,擬解決的主要問題:研究的基本內(nèi)容:通過構建龍頭魚基因組微衛(wèi)星富集文庫,分離微衛(wèi)星DNA序列并對其特征進行分析。解決的主要問題:1.從龍頭魚樣本中提取其總DNA。2.建立龍頭魚微衛(wèi)星富集文庫3.開發(fā)多態(tài)的微衛(wèi)星標記;4.DNA測序5.篩選微衛(wèi)星標記;三、研究步驟、方法及措施:研究步驟:1.查閱相關資料,構建龍頭魚

5、基因組富集文庫;2.仔細閱讀研究文獻資料并翻譯相關英文資料;3.在老師指導下進行克隆、測序;本科畢業(yè)論文目錄4.設計微衛(wèi)星引物,最終獲得多個個多態(tài)的微衛(wèi)星位點;5.對開發(fā)龍頭魚的多態(tài)進行微衛(wèi)星標記;6.構建遺傳連鎖圖譜;7.數(shù)據(jù)整理和分析,撰寫畢業(yè)論文;8.上交論文初稿;9.反復修改論文;10.論文定稿。方法、措施:查閱文獻,參考已知文獻中關于龍頭魚類微衛(wèi)星多態(tài)的標記開發(fā),構建龍頭魚小片段部分基因組DNA文庫。經(jīng)引物的擴增,得到每個個體的微衛(wèi)星片段,其中引物能擴增出較好的譜帶。用2%的瓊脂糖凝膠電泳檢測微衛(wèi)星標記的PCR擴增產(chǎn)物,并對擴增結果進行了統(tǒng)計分析。四、參考文獻[1]張小谷,童金

6、茍,熊邦喜.微衛(wèi)星標記在魚類遺傳及育種研中的應用[J].農(nóng)業(yè)生物技術學報,2006,14(1):117-121.[2]李紅蕾,宋林生,王玲玲,等.櫛孔扇貝EST中微衛(wèi)星標記的篩選[J].高技術通訊,2003,12:72-75.[3]林凱東,羅琛.鯉的微衛(wèi)星引物對草魚基因組分析適用性的初步研究[J].激光生物學報,2003,12(2):121-127.[4]孫效文,梁利群.鯉魚遺傳連鎖圖譜(初報)[J].中國水產(chǎn)科學,2005,12(2):192-196.[5]劉志毅,相建海.微衛(wèi)星DNA分子標記在海洋動物遺傳分析中的應用[J].海洋科學,2001,25(6):11-13.[6]Elleg

7、renH,Microsatelliteevolutin:abattlebetweenreplicationslippageandpointmutation,TrendsinGenetics,2002..[7]MaliaAJR,GlennCG,GeorgeKR,IsolationandcharacterizationofninemicrosatellitelocifromtheHawaiiangrouperEpinephelusque

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