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《肝癌相關(guān)基因的篩選及功能研究》由會員上傳分享，免費在線閱讀，更多相關(guān)內(nèi)容在工程資料-天天文庫。
1、上海交通大學(xué)碩士學(xué)位論文肝癌相關(guān)基因的篩選及功能研究姓名：滕小梅申請學(xué)位級別：碩士專業(yè)：生物化學(xué)與分子生物學(xué)指導(dǎo)教師：韓澤廣20080501上海交通大學(xué)學(xué)位論文版權(quán)使用授權(quán)書本學(xué)位論文作者完全了解學(xué)校有關(guān)保留、使用學(xué)位論文的規(guī)定，同意學(xué)校保留并向國家有關(guān)部門或機(jī)構(gòu)送交論文的復(fù)印件和電子版，允許論文被查閱和借閱。本人授權(quán)上海交通大學(xué)可以將本學(xué)位論文的全部或部分內(nèi)容編入有關(guān)數(shù)據(jù)庫進(jìn)行檢索，可以采用影印、縮印或掃描等復(fù)制手段保存和匯編本學(xué)位論文。保密口，在年解密后適用本授權(quán)書。本學(xué)位論文屬于不保密口。（請
2、在以上方框內(nèi)打“7”）學(xué)位論文作者簽名:指導(dǎo)教師簽名:日期:日期:上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院碩士學(xué)位論文肝癌相關(guān)基因的篩選及功能研究摘要我們前期利用去甲基化藥物處理15株肝癌細(xì)胞株，結(jié)合基因芯片技術(shù)分析藥物處理前后基因表達(dá)譜的變化，候選到一個新的功能未知基因SCARA5基因。通過RT-PCR,DNA測序、FISH、甲基化檢測等分子生物學(xué)技術(shù)，研究了該基因在肝癌組織中的表達(dá)及其分子生物學(xué)機(jī)制。我們發(fā)現(xiàn)SCARA5基因在72.5%(29/40)的肝癌樣本中表達(dá)明顯降低。進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn)，在40對肝癌樣本中，有14
3、(35%)對樣本表現(xiàn)岀至少一個微衛(wèi)星位點缺失。在14對SCARA5基因明顯下調(diào)的肝癌樣本中，7對樣本中該基因啟動子區(qū)域的甲基化水平明顯升高(pvO.Ol)o我們當(dāng)前的結(jié)果提示：SCARA5可能是一個新的肝癌相關(guān)的抑癌基因，其在肝癌的表達(dá)下調(diào)與染色體雜合子缺失以及啟動子區(qū)域的異常高甲基化有密切的關(guān)系。我們利用前期的肝癌基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)(基因芯片)，發(fā)現(xiàn)PNMA5基因在肝癌組織中高表達(dá)。利用逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(yīng)(RT-PCR)技術(shù)，檢測PNMA5在人類正常組織以及肝癌組織和癌旁組織中的表達(dá)水平，結(jié)果顯示在1
4、5種人類正常組織中，PNMA5僅在睪丸、卵巢和腦組織中高表達(dá)。PNMA5基因在41.7%(5/12)的肝癌組織中有明顯的上調(diào)。利用RNA干擾技術(shù)沉默肝癌細(xì)胞株Focus和PLC中內(nèi)源性PNMA5基因表達(dá)后，兩種肝癌細(xì)胞的生長均受到明顯的抑制(pvO.Ol),同時，從G1期進(jìn)入S期細(xì)胞明顯減少(p<0.01)o提ZNPNMA5可能是一個新的腫瘤-睪丸相關(guān)基因。關(guān)鍵詞肝癌，抑癌基因，SCARA5,PNMA5,RNA干擾上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院碩士學(xué)位論文SCREENINGANDFUNCTIONSTUDYOFH
5、EPATOCELLpLARCARCINOMARELATEDGENESABSTRACTInthepresentstudy,weapplied15HCCcelllinestreatedwith5-aza-2!-deoxycytidineandtrichostatinAforDNAmicroarray.Wedisclosed,SCARA5,anovelputativetumorsuppressorgenebyanalysisofgenesexpressionprofilewhencomparedwithc
6、ellstreatedwith5-aza-2f-deoxycytidineandtrichostatinA.ThroughRT-PCR,DNAsequencing,FISHandbisulphate-treatedDNAsequencingassays,weresearchedtheexpressionandthemoleculemechanismofSCARA5geneinHCC.SCARA5genewassignificantlydown-regulatedin72.5%(29/40)HCCsp
7、ecimensascomparedtoadjacentnon-cancerousliversatmRNAlevel.Furthermore,14outof40caseswereconsideredasinvolvinginLOHatleast1themicrosatellitemarker.7outof14caseswithdown-regulationofSCARA5expressionshowedthehypermethylationofSCARA5promoter(p<0.01).Ourres
8、ultsshowedLOHatSCARA5locusandthehypermethylationofSCARA5promoterwereassociatedwiththedown-regulationofSCARA5expressioninprimaryHCC?InourprevioustranscriptomicdataonHCC,weinvestigatedPNMA5genewassignificantlyup-regulatedin41.7%(5/12)HCCs
