聚酰胺抑制基因轉(zhuǎn)錄探究進(jìn)展

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1、聚酰胺抑制基因轉(zhuǎn)錄探究進(jìn)展【摘要】聚酰胺(polyamide)是一類人工合成的小分子,能以序列特異性與DNA小溝結(jié)合,從而干擾天然轉(zhuǎn)錄因子與特定DNA序列的結(jié)合,實(shí)現(xiàn)對(duì)特定基因表達(dá)的調(diào)控。此類小分子發(fā)展迅速,近年來與烷化劑連接而提出了基因沉默新途徑,具有特異基因治療的潛力。本文總結(jié)了聚酰胺對(duì)特定基因轉(zhuǎn)錄抑制的研究進(jìn)展。【關(guān)鍵詞】聚酰胺啟動(dòng)子基因轉(zhuǎn)錄;轉(zhuǎn)錄因子SuppressionofGeneTranscriptionbyPolyamideReviewAbstractPolyamideisasyntheticsmallmoleculeth

2、atrecognizespredeterminedsequencesintheminorgrooveofDNAwithaffinitiesandspecificitiescomparedtothoseofDNAbindingproteins?PolyamidecansuppressgenetranscriptionbyinterferingwiththeattachmentofnaturaltranscriptionfactorsandDNA.Thealkylatingpolyamidesrepresentanovelapproachf

3、orsequencespecificgenesilencing,whichmightbeappliedtogenetherapy.Theresearchonsuppressionofgenetranscriptionbypolyamidewasreviewedinthispaper.Keywordspolyamide;promoter;genetranscription;transcriptionfactor真核生物基因表達(dá)最重要的環(huán)節(jié)是轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控,人工合成的能夠與DNA序列識(shí)別和結(jié)合的小分子成為化學(xué)、分子生物學(xué)及醫(yī)學(xué)等領(lǐng)域關(guān)注的焦

4、點(diǎn)之一。繼DNA、RNA反義技術(shù)和RNA干擾(RNAi)技術(shù)之后,能夠識(shí)別DNA序列的聚酰胺(polyamide)分子的研究十分引人注目[1]。聚酰胺是人工合成的小分子,由芳環(huán)通過酰胺鍵連接而成。已經(jīng)發(fā)現(xiàn),這些小分子不僅具有識(shí)別DNA堿基的序列選擇性,還有易穿透細(xì)胞膜的功能[2,3]。最近報(bào)道的一些實(shí)驗(yàn)表明,聚酰胺成功地抑制了一些基因的轉(zhuǎn)錄,尤其是人類免疫缺陷病毒(HIV)基因和一些腫瘤基因的轉(zhuǎn)錄,具有特異性基因治療的潛力。聚酰胺化學(xué)結(jié)構(gòu)及其與DNA的識(shí)別最初的發(fā)現(xiàn)是從抗腫瘤抗生素“偏端霉素”開始的,這是自然界存在的識(shí)別DNA的天然小分

5、子,能夠與DNA小溝(尤其是AT富集區(qū))結(jié)合。受此結(jié)構(gòu)啟發(fā),Gottefeld及一些研究者[3-7]合成了一些ImPyPyDp分子(Im=N甲基咪呢;Py=N甲基毗咯;Dp=N,N二甲基丙胺),合成的兩個(gè)聚酰胺分子平面相對(duì),與DNA小溝呈反向平行狀態(tài),每個(gè)聚酰胺分子上的酰胺鍵分別與相鄰的DNA堿基形成氫鍵,結(jié)合在DNA的WGWCW序列上(W可以是A或者T)。他們進(jìn)一步用一個(gè)氨基酸分子作為連接子,將兩條反向平行聚酰胺鏈的C端與N端連接起來,形成了頭尾相連發(fā)卡狀(hairpin)聚酰胺。這種發(fā)卡狀聚酰胺與DNA的親合性比獨(dú)立的兩條聚酰胺鏈提

6、高了約400倍。幾種連接子的對(duì)比實(shí)驗(yàn)顯示,由Y氨基丁酸充當(dāng)連接子時(shí)聚酰胺具有最好的親合性。進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn),V氨基丁酸不僅充當(dāng)連接子,還具有一定序列選擇性(V氨基丁酸和B丙氨酸與A?T/T?A的結(jié)合性相對(duì)G?C/C?G要強(qiáng)200-400倍)。聚酰胺識(shí)別DNA的配對(duì)規(guī)則是:從氨基端到竣基端反向平行成對(duì)的Py/Im特異識(shí)別C?G堿基對(duì),而Im/Py識(shí)別G?C堿基對(duì);反向平行成對(duì)的Hp/Py(Hp=N甲基3務(wù)基毗咯)特異識(shí)別T?A堿基對(duì),而Py/Hp識(shí)別A?T堿基對(duì)。利用這個(gè)規(guī)則,可以針對(duì)某一段已知DNA序列設(shè)計(jì)出相應(yīng)的聚酰胺識(shí)別分子,然后進(jìn)行

7、生物活性的測(cè)試與分析。聚酰胺識(shí)別DNA序列的親和力和特異性還可以通過化學(xué)方法將兩個(gè)分子連接起來本綜述由北京大學(xué)第一醫(yī)院朱平教授審校形成串聯(lián)聚酰胺而得到提髙,并且這種串聯(lián)分子可以識(shí)別更長(zhǎng)的序列。不論是無細(xì)胞DNA模型,體外細(xì)胞培養(yǎng)以及動(dòng)物實(shí)驗(yàn)都證實(shí)聚酰胺可以抑制基因轉(zhuǎn)錄。設(shè)計(jì)的聚酰胺與DNA小溝特定序列結(jié)合(通常是基因調(diào)控區(qū)啟動(dòng)子/增強(qiáng)子元件),阻斷真核轉(zhuǎn)錄因子(或病毒轉(zhuǎn)錄因子)與靶序列的結(jié)合,從而抑制特定基因的表達(dá)[8,9]o體外無細(xì)胞DNA實(shí)驗(yàn)最初的實(shí)驗(yàn)是在無細(xì)胞條件下進(jìn)行的,Gottesfeld等[3]設(shè)計(jì)了含有8個(gè)環(huán)的發(fā)卡狀聚酰胺

8、,從非洲蟾蛛腎臟來源的成纖維細(xì)胞分離出染色體,該聚酰胺可以與5SRNA基因的啟動(dòng)子元件結(jié)合,抑制轉(zhuǎn)錄因子TFIIIA與此元件結(jié)合,阻斷RNA聚合酶III的轉(zhuǎn)錄。TATA盒是大多數(shù)真核生物基因調(diào)控區(qū)的核心啟動(dòng)

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