基因的轉(zhuǎn)錄、轉(zhuǎn)錄后調(diào)控.doc

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1、. 基因的轉(zhuǎn)錄、轉(zhuǎn)錄后加工及逆轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)錄(transcription)是以DNA單鏈為模板,NTP為原料,在DNA依賴的RNA聚合酶催化下合成RNA鏈的過(guò)程。與DNA的復(fù)制相比,有很多相同或相似之處,亦有其特點(diǎn),它們之間的異同可簡(jiǎn)要示于表13-1轉(zhuǎn)錄的模板是單鏈DNA,與復(fù)制的模板有較多的不同特點(diǎn),引出了下列相關(guān)概念。轉(zhuǎn)錄過(guò)程只以基因組DNA中編碼RNA(mRNA、tRNA、rRNA及小RNA)的區(qū)段為模板。把DNA分子中能轉(zhuǎn)錄出RNA的區(qū)段,稱為結(jié)構(gòu)基因(structuregene)。結(jié)構(gòu)基因的雙鏈中,僅有一股鏈作為模板轉(zhuǎn)錄成RNA,稱為模板鏈(templatestrand),也稱作

2、Watson(W)鏈(Watsonstrand)、負(fù)(-)鏈(minusstrand)或反意義鏈(antisensestrand)。與模板鏈相對(duì)應(yīng)的互補(bǔ)鏈,其編碼區(qū)的堿基序列與mRNA的密碼序列相同(僅T、U互換),稱為編碼鏈(codingstrand),也稱作Crick(C)鏈(Crickstrand)、正(+)鏈(plusstrand),或有意義鏈(sensestrand)。不同基因的模板鏈與編碼鏈,在DNA分子上并不是固定在某一股鏈,這種現(xiàn)象稱為不對(duì)稱轉(zhuǎn)錄(asymmetrictranscription)。模板鏈在相同雙鏈的不同單股時(shí),由于轉(zhuǎn)錄方向都從5’→3’,表觀上轉(zhuǎn)錄方向

3、相反,如圖13-1。與DNA復(fù)制類似,轉(zhuǎn)錄過(guò)程在原核生物和真核生物中所需的酶和相關(guān)因子有所不同,轉(zhuǎn)錄過(guò)程及轉(zhuǎn)錄后的加工修飾亦有差異。下面的討論中將分別敘述?!⑴c轉(zhuǎn)錄的酶轉(zhuǎn)錄酶(transcriptase)是依賴DNA的RNA聚合酶(DNAdependentRNApolymerase,DDRP),亦稱為DNA指導(dǎo)的RNA聚合酶(DNAdirectedRNApolymerase),簡(jiǎn)稱為RNA聚合酶(RNApol)。它以DNA為模板催化RNA的合成。..原核生物和真核生物的轉(zhuǎn)錄酶,均能在模板鏈的轉(zhuǎn)錄起始部位,催化2個(gè)游離的NTP形成磷酸二酯鍵而引發(fā)轉(zhuǎn)錄的起始,如圖13-2所示。因此,轉(zhuǎn)

4、錄的起始不需引物,這也是轉(zhuǎn)錄與復(fù)制在起始階段的一大區(qū)別。一、原核生物的RNA聚合酶細(xì)菌中只發(fā)現(xiàn)一種RNA聚合酶,能催化mRNA,tRNA和rRNA等的合成,研究得比較清楚的是大腸桿菌(Ecoli)的RNA聚合酶。(一)大腸桿菌RNA聚合酶的組成大腸桿菌RNA聚合酶的分子量約450kDa,由四種5個(gè)亞基(α2ββ′σ)組成全酶(holoenzyne),σ亞基與全酶疏松結(jié)合,在胞內(nèi)、外均容易從全酶中解離,解離后的部分(α2ββ′)稱為核心酶(coreenzyme)。通過(guò)利福霉素等抑制轉(zhuǎn)錄的實(shí)驗(yàn)研究,對(duì)轉(zhuǎn)錄酶各亞基的功能已有一定的認(rèn)識(shí):α亞基可能參與全酶的組裝及全酶識(shí)別啟動(dòng)子,從而決定哪些

5、基因可轉(zhuǎn)錄;β亞基與底物(NTP)及新生RNA鏈結(jié)合;β′亞基與模板DNA結(jié)合;β和β′亞基組成酶的活性中心,通過(guò)DNA的磷酸基團(tuán)與核心酶的堿性基團(tuán)間的非特異性吸附作用,核心酶能與模板DNA非特異性松馳結(jié)合;σ亞基的功能是識(shí)別啟動(dòng)子,辯認(rèn)轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn),但不能單獨(dú)與DNA模板結(jié)合,當(dāng)它與核心酶結(jié)合時(shí),可引起酶構(gòu)象的改變,從而改變核心酶與DNA結(jié)合的性質(zhì),使全酶對(duì)轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)的親和力比其他部位高4個(gè)數(shù)量級(jí),在轉(zhuǎn)錄延長(zhǎng)階段,σ亞基與核心酶分離,僅由核心酶參與延長(zhǎng)過(guò)程。因此,σ亞基實(shí)際上被認(rèn)為是一種轉(zhuǎn)錄輔助因子,因而稱為σ因子(σfactor)。(二)σ因子生物體在生命周期的不同階段或在內(nèi)、外環(huán)

6、境有所變化時(shí),其基因表達(dá)有一定的時(shí)、空順序,以適應(yīng)生長(zhǎng)、發(fā)育及環(huán)境變化的需要。RNA聚合酶的活性是決定基因表達(dá)的重要一環(huán)。而σ因子是RNA聚合酶識(shí)別及結(jié)合啟動(dòng)子的亞基,原核生物中所有RNA的轉(zhuǎn)錄都由同一種RNA聚合酶催化,在生命周期的不同階段或不同環(huán)境下,這個(gè)酶如何識(shí)別所有轉(zhuǎn)錄單位的啟動(dòng)子,是由識(shí)別啟動(dòng)子的σ因子來(lái)完成的?;騿?dòng)子-35和-10區(qū)的共有序列(圖13-3)是σ因子識(shí)別的位點(diǎn),如表13-2所示,不同的σ因子能識(shí)別的共有序列可以完全不同。二、真核生物的RNA聚合酶真核生物的RNA聚合酶已發(fā)現(xiàn)有三種,稱為RNA聚合酶I、II和III,分別負(fù)責(zé)轉(zhuǎn)錄不同的RNA,它們對(duì)特異性抑

7、制劑鵝膏蕈堿的敏感性亦有差異,如表13-3所示。第二節(jié)轉(zhuǎn)錄過(guò)程..轉(zhuǎn)錄是生物合成RNA的過(guò)程,與復(fù)制相似,有起始、核苷酸鏈延長(zhǎng)和鏈合成終止三個(gè)階段。一、轉(zhuǎn)錄的起始轉(zhuǎn)錄的起始,就是形成轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物的過(guò)程。這一階段反應(yīng)所需的輔助因子,在原核生物與真核生物之間有較大的差異。㈠原核生物轉(zhuǎn)錄的起始轉(zhuǎn)錄的起始由RNA聚合酶與DNA模板的啟動(dòng)子(promoter)結(jié)合。經(jīng)過(guò)對(duì)百種以上原核生物不同基因的啟動(dòng)子進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)啟動(dòng)子具有下列的共同點(diǎn):在-10bp處有一段共有

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