TALEN-小鼠-基因敲除流程.pdf

TALEN-小鼠-基因敲除流程.pdf

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1、上海斯丹賽生物技術(shù)有限公司SIDANSAIBiotechnologyCO.,LTD小鼠:分類:小鼠屬于哺乳綱(Mammalia)、嚙齒目(Rodentia)、鼠科(Muridae)、小鼠屬(Mus)動物。特征:生長期短、成熟早、繁殖力強。性成熟:6~7周。雌性35~50日齡,雄性45~60日齡;體成熟:雌性為65~75日齡,雄性為70~80日齡;性周期為4~5天,妊娠期為19~21天;哺乳期為20~22天;一次排卵10~23個(視品種而定),每胎產(chǎn)仔數(shù)為8~15只,一年產(chǎn)仔胎數(shù)6~10胎,屬全年、多發(fā)情性動物,繁殖率很高,生育期為一年。確定靶基因

2、同源重組介導(dǎo)的小構(gòu)建同源重組載體鼠基因打靶流程載體線性化導(dǎo)入ES篩選同源重組成功的ESES顯微注射囊胚野生型F0代(嵌合體)野生型野生型F1代(雜合體)F1代(雜合體)野生型F2代(雜合體)F2代(純合體)確定靶基因TALEN介導(dǎo)的小構(gòu)建TALEN載體鼠基因打靶流程TALEN活性檢測小鼠3T3細胞體外轉(zhuǎn)錄mRNA注:KI加同源載體DonorDNA將mRNA注射入一細胞期受精卵野生型F0代(嵌合體)野生型野生型F1代(雜合體)F1代(雜合體)野生型F2代(雜合體)F2代(純合體)Step1設(shè)計TALEN打靶載體?針對靶基因的兩個不同位點分別設(shè)計一個

3、2X3的TALEN組合5’3’3’5’Spacer12-21bpStep2構(gòu)建TALEN打靶載體?通過FastTALETM一步連接法完成TALEN載體的構(gòu)建上游引物測序結(jié)果比對下游引物測序結(jié)果比對Step3細胞水平TALEN活性驗證Day1:小鼠3T3細胞鋪板篩選出一對高活性的TALEN質(zhì)粒用于后續(xù)實驗Day2:Fugene共轉(zhuǎn)TALEN左右臂質(zhì)粒和EIP質(zhì)粒①PCR產(chǎn)物測序結(jié)果②PCR產(chǎn)物進行TA克隆查看套峰測序,計算突變率Day3:藥物篩選(puromycin,1μg/ml)Day6:收集剩余細胞,PCR靶向序列片段,抽基因組DNA擴增出50

4、0bp左右在靶位點上下游設(shè)計PCR引物,對打靶后的細胞基因組DNA進行PCRPCR-FTALEN-L>200bp>200bpTALEN-RPCR-RMarker560bp目的基因片段PCR擴增活性檢測方法①:PCR產(chǎn)物測序結(jié)果查看峰圖方法:TALEN質(zhì)粒轉(zhuǎn)染細胞藥物篩選,收集細胞提取基因組DNAPCR擴增PCR產(chǎn)物測序打靶效率中等的樣品活性檢測方法②:PCR產(chǎn)物連T載體,單克隆測序計算突變率?挑取30-50個克隆,將測序結(jié)果與目標基因的原始系列進行比對,計算突變率。注:圖中第一排WT為原始序列,---表示缺失,紅色為插入或置換。Step4體外轉(zhuǎn)錄

5、生成mRNATALEN質(zhì)粒線性化根據(jù)載體所帶啟動子選擇相應(yīng)試劑盒進行體外轉(zhuǎn)錄mRNA濃度、純度檢測原核啟動子:sp6或T7mRNA轉(zhuǎn)錄后的大小檢測:若片段大于1.5kb可用瓊脂糖凝膠電泳檢測;若片段較小,建議用聚丙烯酰胺凝膠電泳檢測。Step5胚胎注射mRNATALEN左右臂注射至一細胞移至代孕雌鼠37℃培養(yǎng)24hmRNA按1:1期受精卵中,至小鼠至二細胞期比例混合細胞質(zhì)中出生(3周)注射濃度300-500ng/ul注射體積:5-15plStep6F0代突變體小鼠檢測T7E1酶切鑒定法:F0代小鼠剪尾,抽提基因組DNA剪小鼠的尾巴或腳趾提取基因組

6、DNAPCR靶向基因序列PCR擴增靶基因位點PCR產(chǎn)物于94℃失活、50-60℃退火T7E1酶切鑒定PCRT7E1酶37℃作用1h產(chǎn)物,進行初步篩選瓊脂糖凝膠電泳檢測PCR產(chǎn)物連TA克隆進行測序,進一步確認F0代突變體小鼠Step7獲得F1代雜合體小鼠F0代突變體小鼠x野生型小鼠F1代雜合子小鼠F1代小鼠剪尾,抽提基因組DNAPCR靶向基因序列通過PCR產(chǎn)物測序查看峰圖及TA克隆測序結(jié)果比對,鑒定F1代雜合體小鼠同源重組介導(dǎo)的knockoutTALEN介導(dǎo)的knockoutanimalmodelanimalmodel經(jīng)由ES,同源重組打靶得到Kn

7、ockout無需經(jīng)過ES階段,直接注射到胚胎ES細胞系后,再注射到囊胚進行打靶打靶效率高打靶效率低TALEs特異性識別DNA堿基序列,F(xiàn)ok1切斷雙鏈DNA從而造成雙鏈斷裂細胞內(nèi)自然發(fā)生的同源染色體隨機交換,(DSB),引入的DSB激活的DNA自我修復(fù)引起基因的突變和促進靶位點DNA打靶效率通常只有10-6至10-8同源重組。外源引發(fā)DNA斷裂,幾率高,提高幾百倍甚至千倍knockout不需要同源序列同源臂很長,一般3-5kb,克隆困難knockin同源序列1k以內(nèi),易于克隆周期長:12-18個月周期短:6-10個月成本高:12萬成本低:10萬S

8、IDANSAIBiotechnologyCO.,LTDwww.sidansai.com

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