三明野生蕉Whirly轉(zhuǎn)錄因子的克隆及其在低溫脅迫下的定量表達(dá)分析-論文.pdf

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1、熱帶作物學(xué)報(bào)2014,35(8):1533—1538ChineseJournalofTropicalCrops三明野生蕉Whirly轉(zhuǎn)錄因子的克隆及其在低溫脅迫下的定量表達(dá)分析楊洋,賴恭梯,賴鐘雄福建農(nóng)林大學(xué)園藝植物生物工程研究所.福建福州350002摘要以三明野生蕉葉片為材料.通過克隆獲得Whirly基因的ORF.并研究Whirly基因在不同溫度處理下的轉(zhuǎn)錄水平。結(jié)果表明:采用PT—PCR結(jié)合RACE技術(shù),克隆得到三明野生蕉Whirly基因,其在GenBank的登錄號(hào)為KC127691。Whirly的開放閱讀

2、框?yàn)?38bp,編碼245個(gè)氨基酸。生物信息學(xué)分析顯示,Whirly蛋白屬于親水蛋白,不具有信號(hào)肽,二級(jí)結(jié)構(gòu)由0【螺旋、B折疊和無(wú)規(guī)則卷曲組成,保守結(jié)構(gòu)域預(yù)測(cè)顯示該基因?qū)儆谥参颳hirly轉(zhuǎn)錄因子基因家族實(shí)時(shí)熒光定量PCR分析顯示.Whirly轉(zhuǎn)錄因子在不同低溫脅迫下表達(dá)水平有較大差異,隨著溫度的降低,相對(duì)表達(dá)量呈“M”型變化模式,在20℃和4℃時(shí)達(dá)到較高的轉(zhuǎn)錄水平,結(jié)合前人研究結(jié)果可知。三明野生蕉Whirly轉(zhuǎn)錄因子可能參與了包括抗寒等多個(gè)抗逆途徑的調(diào)控。關(guān)鍵詞三明野生蕉;Whirly;基因克??;生物信息學(xué);

3、熒光定量PCR中圖分類號(hào)Q943.2文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼ACloningandExpressionUnderLowTemperatureConditionsofWhirlyTranscriptionFactorinaWildBananaAccession(Musaspp.)fromSanmingCityYANGYang,LAIGongti,LAIZhongxiongInstituteofHortieulturdBiotechnology,ionAgricuhureandForestryUniversity,F(xiàn)uzhou,

4、ion350002,ChinaAbstractInthepaper.theopenreadingframe(ORF)ofWhirlygenewasclonedfromaSanmingwildbananaaccession(Musaspp.).Theexpressionlevelof柚lfywasstudiedunderdifferenttemperatureconditions.ofSanmingwildbananawasclonedbyRT—PCRandtheaccessionnumberwasKC12769

5、1inGenBank.Whirlycontainsa755一nucleotides—longopenreadingframe(ORF),encodingapolypeptideof245aminoacids.Bioinformaticsanalysisshowedthattheproteinwashydrophilicandwithoutsignalpeptide.Whirlybelongstoplantwhirlytranscriptionfactors.Thesecondarystructurewasmad

6、eoftheMphahelix,betasheetandcoil.Real—timequantitativePCRresultsindicatedthattheexpressionlevelofWhirlytranscriptionfactorisquitedifferentunderdifferentlowtemperaturestress.Withthetemperaturedecreasing,therelativequantitativeexpressionpattenpresentedas“M”-ty

7、pe.TheexpressionofWhirlypeakedatthetreatmentof20℃.a(chǎn)ndmaintainedahighlevelsat4oC.Combiningwithpreviousstudies,wepredictedthatwhirlytranscriptionfactorsmayplayanimportantroleinmanykindsofresistanceresponseincludingcold—resistance.KeywordsSanmingwildbanana;Whir

8、ly;Genecloning;Bioinformatics;QPCRdoi10,3969/j.issn.1000—2561.2014.08.015芭蕉科(Musaceac)芭蕉屬(Hs0)的香蕉源幾乎覆蓋所有地市,對(duì)三明、福州[3-5]等地的野(Musaspp.)是多年生大型草本單子葉植物,其產(chǎn)生蕉研究已有詳細(xì)報(bào)道其中三明野生蕉耐寒性量?jī)H次于柑桔類水果.在世界水果生產(chǎn)中占有十分比較強(qiáng),

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