桃果實(shí)PpPFK基因的電子克隆及低溫脅迫下的轉(zhuǎn)錄水平分析

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1、現(xiàn)代食品科技ModernFoodScienceandTechnology2013,Vol.29,No.9桃果實(shí)PpPFK基因的電子克隆及低溫脅迫下的轉(zhuǎn)錄水平分析111211余芳,王可,邵興鋒,龔一富,王鴻飛,許鳳(1.寧波大學(xué)食品科學(xué)與工程系,浙江寧波315211)(2.寧波大學(xué)生物與海洋科學(xué)系,浙江寧波315211)摘要:為了克隆桃果實(shí)中PpPFK(Prunuspersicaphosphofructokinase,磷酸果糖激酶)基因,并對(duì)其序列和不同低溫脅迫下的轉(zhuǎn)錄水平進(jìn)行分析。本研究采用了電子克隆和RT-PCR(reversetranscriptionPCR)相結(jié)合的

2、方法分離桃果實(shí)PpPFK基因的cDNA全長(zhǎng)序列,采用RT-qPCR(reversetranscriptionreal-timequantitativePCR)技術(shù)分析桃果實(shí)在0℃、5℃冷藏過程中目的基因轉(zhuǎn)錄水平的變化。試驗(yàn)成功獲得了全長(zhǎng)1405bp的PpPFK基因序列,該序列具有完整的開放閱讀框(ORF,openreadingframe),編碼232個(gè)氨基酸。對(duì)ORF進(jìn)行PCR的驗(yàn)證結(jié)果和電子克隆的結(jié)果一致。序列分析顯示該基因的氨基酸序列同大豆和葡萄具有很高的相似度。RT-qPCR分析顯示,5℃貯藏下的桃果實(shí)PpPFK基因轉(zhuǎn)錄水平在前14d高于0℃果實(shí),這可能導(dǎo)致5℃貯藏

3、的桃果實(shí)發(fā)生更明顯的冷害癥狀。本研究結(jié)果表明,桃果實(shí)PpPFK轉(zhuǎn)錄水平在不同低溫貯藏過程中存在差異,這可能在桃果實(shí)低溫脅迫響應(yīng)過程中發(fā)揮重要作用。關(guān)鍵詞:桃;磷酸果糖激酶;電子克??;轉(zhuǎn)錄水平;調(diào)控文章篇號(hào):1673-9078(2013)9-2125-2130InSilicoCloningandTranscriptLevelAnalysisofPpPFKinPeachFruitStoredatDifferentLowTemperaturesYUFang1,WANGKe1,SHAOXing-feng1,GONGYi-fu2,WANGHong-fei1,XUFeng1(1.De

4、partmentofFoodScienceandEngineering,NingboUniversity,Ningbo315211,China)(2.DepartmentofBiologyandMarineScience,NingboUniversity,Ningbo315211,China)Abstract:InordertoclonePpPFK(Prunuspersicaphosphofructokinase)geneandanalyzeitstranscriptlevelsofpeachfruitstoredatdifferentlowtemperatures,Pp

5、PFKgenecompletecDNAlengthwasisolatedwithinsilicocloningmethodandRT-PCR(reversetranscriptionPCR),anditstranscriptlevelsofpeachfruitstoredat0℃and5℃wereexaminedthroughreversetranscriptionreal-timequantitativePCR(RT-qPCR).ThePpPFKgenewith1405bpwasgained,whichcodes232aminoacidswithanORF(openre

6、adingframe).TheORFchecktestwasconductedandtheresultsuggestedthatthesequenceofPpPFKgenethroughPCRwasthesameasthatinsilicocloning.TheaminoacidsequenceofPpPFKgeneinpeachfruitwasverysimilartothatofGlycinemaxandVitisvinifera.TheRT-qPCRanalysisofPpPFKgeneindicatedthatitstranscriptlevelsofpeachf

7、ruitstoredat5℃werehigherthanthatat0℃duringfirst14days,resultinginanobviouschillinginjuryofpeachfruitstoredat5℃.TheseresultsrevealedthatPpPFKwascoldresponsegene,anddifferentialresponsesexistedinpeachfruitstoredatlowtemperatures,indicatingitsimportantroleinlowtemperat

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