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《基因組學課件8.比較基因組學.ppt》由會員上傳分享，免費在線閱讀，更多相關內(nèi)容在教育資源-天天文庫。
1、比較基因組學中英聯(lián)合實驗室Evaluationonly.CreatedwithAspose.Slidesfor.NET3.5ClientProfile5.2.0.0.Copyright2004-2011AsposePtyLtd.9/2/2021比較基因組學的產(chǎn)生伴隨著基因組的研究,相關信息出現(xiàn)了爆炸性增長,迫切需要對大量基因組數(shù)據(jù)進行處理,比較基因組學作為一門重要的工具學科應運而生。比較基因組學是通過對系統(tǒng)發(fā)育中的代表性物種之間的全方位基因和基因家族的比較分析，構建系統(tǒng)發(fā)育的遺傳圖譜,來揭示基因、基因家族的起源和功能及其在進化過程中復雜化和多樣化的機制。E
2、valuationonly.CreatedwithAspose.Slidesfor.NET3.5ClientProfile5.2.0.0.Copyright2004-2011AsposePtyLtd.9/2/2021果蠅基因組果蠅基因組全長180mb，2/3是euchromatin，1/3是heterochromatin；BlastSearch確定有14113個轉錄產(chǎn)物（功能基因）。Science,287:2185-2195(2000)Evaluationonly.CreatedwithAspose.Slidesfor.NET3.5ClientProfil
3、e5.2.0.0.Copyright2004-2011AsposePtyLtd.9/2/2021比較基因組學定義利用不同物種基因組之間功能區(qū)域順序上、組織結構上的同源性克隆新基因揭示基因功能闡明物種進化關系、基因組的內(nèi)在結構Evaluationonly.CreatedwithAspose.Slidesfor.NET3.5ClientProfile5.2.0.0.Copyright2004-2011AsposePtyLtd.9/2/2021比較基因組學的應用揭示非編碼功能序列發(fā)現(xiàn)新基因發(fā)現(xiàn)功能性SNP闡述物種間的進化史闡明人類疾病過程的分子機制Evaluat
4、iononly.CreatedwithAspose.Slidesfor.NET3.5ClientProfile5.2.0.0.Copyright2004-2011AsposePtyLtd.9/2/2021比較基因組學與進化古細菌---產(chǎn)甲烷球菌與原核生物共同之處：染色體組織與結構：環(huán)狀基因組、基因的操縱子結構等能量產(chǎn)生和固氮基因與有很高的同源性與細胞分裂有關的蛋白質(zhì)、20多個編碼無機離子運輸?shù)鞍椎腛RF與細菌基因同源調(diào)控模式類似于原核生物與真核生物共同之處：細胞遺傳信息傳遞，尤其是轉錄和翻譯系統(tǒng)分泌系統(tǒng)說明該細菌與真核生物親緣關系較近。Evaluation
5、only.CreatedwithAspose.Slidesfor.NET3.5ClientProfile5.2.0.0.Copyright2004-2011AsposePtyLtd.9/2/2021比較基因組學與進化比較基因組學提供的結果表明，在進化系統(tǒng)樹上，古細菌與真核生物親緣關系比原核生物更近。自養(yǎng)生物的三個分支，細菌、古細菌和真核生物中，細菌的分化發(fā)生較早。Evaluationonly.CreatedwithAspose.Slidesfor.NET3.5ClientProfile5.2.0.0.Copyright2004-2011AsposePtyL
6、td.9/2/2021比較基因組學的具體應用方法和策略序列的比對分析確定基因組序列的進化關系基因共線性synteny：染色體片段的分析物種序列的優(yōu)化選擇對DNA序列的信息注釋Evaluationonly.CreatedwithAspose.Slidesfor.NET3.5ClientProfile5.2.0.0.Copyright2004-2011AsposePtyLtd.9/2/2021基因組成的相似性基因共線性synteny：基因排列順序的一致性宏觀共線性：遺傳連鎖圖上錨定標記排列次序的一致性微觀共線性：物理圖上基因序列的一致排列進化距離非常近的物種間
7、保持很好的微觀共線性在進化過程中，基因共線性被各種因素所破壞，進化距離越遠的物種之間基因共線性越差，兩個物種之間的共線性程度可以作為衡量它們之間進化距離的尺度Evaluationonly.CreatedwithAspose.Slidesfor.NET3.5ClientProfile5.2.0.0.Copyright2004-2011AsposePtyLtd.9/2/2021高度保守和高度變異X染色體極為保守，人類和貓的X染色體具有縱貫全條的共線性在保守性較低的區(qū)段，基因進化速率快于整個基因組的平均進化速率它們在種間基因組中很少表現(xiàn)共線性，甚至在同一物種的不
8、同生態(tài)型之間這些區(qū)段也會發(fā)生較大變異當用基因共線性程度估算物種分化
