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《單晶結(jié)構(gòu)解析說課講解.ppt》由會(huì)員上傳分享，免費(fèi)在線閱讀，更多相關(guān)內(nèi)容在工程資料-天天文庫。
1、主要包含五個(gè)程序：XPREP,XS,XP,XL,XCIF主要文件：name.hkl,name.ins,name.res,name.lst,name.cif等衍射點(diǎn)文件：name.hkl(ASCII)00136.571.311003112.064.07100487057.132178.691……h(huán)klIσ(I)(3I4,2F8.2)一、SHELXTL程序簡介name.hkl,name.ins結(jié)構(gòu)解析和精修的過程，是ins文件建立和不斷更新的過程，這主要是下列過程實(shí)現(xiàn)的:XPREP、XS、XL、XP兩個(gè)必要文件(由XPREP程序產(chǎn)生)7/
2、30/2021其它文件reslstpltciffcfpcftexxs、xl、refine產(chǎn)生的文件記錄xs、xl、refine過程和結(jié)果的文件XP中做的圖形文件晶體學(xué)信息文件結(jié)構(gòu)因子文件晶體結(jié)構(gòu)報(bào)表文件記錄儀器型號(hào)、晶體外觀等的文件7/30/2021SHELXTL程序運(yùn)行圖XPREP確定空間群建立.ins文件name.hklname.insname.hklname.p4pXS解初結(jié)構(gòu)XL最小二乘修正等XP畫圖XCIF打印表格name.resname.insname.resname.hkl改名改名name.ins結(jié)構(gòu)圖name.cif7
3、/30/2021二、數(shù)據(jù)處理--XPREP運(yùn)行步驟：1.從name.hkl文件(若存在)或name.raw文件中讀入衍射點(diǎn)；2.從name.p4p或鍵盤獲得單胞參數(shù)及誤差3.判斷晶格類型4.尋找最高對(duì)稱性5.確定空間群6.輸入分子7.建立name.hkl和name.ins7/30/2021*XPREP的主要功能和應(yīng)用單擊進(jìn)入XPREP程序根據(jù)程序的提示輸入晶胞參數(shù)選擇可能的晶格程序則顯示以下菜單：[D]Read,ModifyorMergeDATDSETS[P]ContourPATTERSONSecions[H]SearchforHIG
4、HERmertricsymmetry[S]DetermineorinputSPACEGROUP讀入、更改、合并衍射數(shù)據(jù)計(jì)算顯示Patterson截面尋找更高的對(duì)稱性確定或輸入已知的空間群7/30/2021[A]ApplyABSORPTIONcorrections[M]TestforMEROHEDRALTWINNING[L]ResetLATTICEtypeofOriginalCell[C]Defineunit-cellCONTENTS[F]SetupSHELXTLFILES[R]RECIPROCALSpaceDisplays[U]UNI
5、T-CELLtransformations[T]ChangeTOLERANCES[O]Self-rotaionfunction[Q]QuitProgram吸收校正重設(shè)原始晶胞的晶格類型孿晶缺面試驗(yàn)定義單胞的化學(xué)組成建立計(jì)算指令文件顯示倒易空間轉(zhuǎn)換晶胞改變一些變量的容忍值自旋函數(shù)退出程序7/30/20213910Reflectionsreadfromfileylid.hkl;mean(I/sigma)=27.80Latticeexceptions:PABCIFObvRevAllN(total)=019481951198119452940
6、259626043910N(int>3sigma)=018901878191818812843251425243780Meanintensity=0.0109.2106.3103.4111.7106.3108.5110.3108.8Meanint/sigma=0.027.826.728.027.727.527.827.727.8SelectOption[P]:判斷晶格類型：判斷標(biāo)準(zhǔn)：I/?(I)?7/30/2021SEARCHFORHIGHERMETRICSYMMETRY--------------------------------
7、----------------------------------------------OptionA:FOM=0.025deg.ORTHORHOMBICP-latticeR(int)=0.022[3032]Cell:5.9659.04218.40390.0090.0290.01Volume:992.52Matrix:1.00000.00000.00000.00001.00000.00000.00000.00001.0000SelectOption[A]:尋找最高對(duì)稱性：判斷標(biāo)準(zhǔn)：R(int)，盡量選用最高對(duì)稱性，R(int)在0
8、.15以下一般即可認(rèn)為對(duì)稱性成立。不要隨意降低對(duì)稱性。若太多不能在一屏上顯示時(shí)可中斷，再查閱生成的PRP文件7/30/2021確定空間群：按照晶系，晶格類型，E值統(tǒng)計(jì)，消光特點(diǎn)來判斷空間群，并給出了可能的空間群及其對(duì)應(yīng)的
