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《基于復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)的真實(shí)世界中醫(yī)臨床新藥發(fā)現(xiàn)方法與系統(tǒng)研究》由會(huì)員上傳分享,免費(fèi)在線閱讀,更多相關(guān)內(nèi)容在學(xué)術(shù)論文-天天文庫(kù)。
1、劣妻未交碩士學(xué)位論文基于復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)的真實(shí)世界中醫(yī)臨床新藥發(fā)現(xiàn)方法與系統(tǒng)研究ComplexNetworkApproachesforReal--WorldTCMClinicalDrugDiscovery:DataMiningalgorithmsandSystemDevelopment作者:杜寧林導(dǎo)師:周雪忠北京交通大學(xué)2013年4月學(xué)位論文版權(quán)使用授權(quán)書(shū)I掣III12I14112IU8I14lI唑II螋本學(xué)位論文作者完全了解北京交通大學(xué)有關(guān)保留、使用學(xué)位論文的規(guī)定。特授權(quán)北京交通大學(xué)可以將學(xué)位論文的全部或部分內(nèi)容編入有關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行檢索
2、,提供閱覽服務(wù),并采用影印、縮印或掃描等復(fù)制手段保存、匯編以供查閱和借閱。同意學(xué)校向國(guó)家有關(guān)部門或機(jī)構(gòu)送交論文的復(fù)印件和磁盤。(保密的學(xué)位論文在解密后適用本授權(quán)說(shuō)明)學(xué)位論文作者簽名:和尊林導(dǎo)師簽名:閡鋤簽字日期:矽哆年歲月,6日簽字日期:猶惦年鄉(xiāng)月,6日中圖分類號(hào):TP39UDC:學(xué)校代碼:10004密級(jí):公開(kāi)北京交通大學(xué)北尿父嬗大字碩士學(xué)位論文基于復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)的真實(shí)世界中醫(yī)臨床新藥發(fā)現(xiàn)方法與系統(tǒng)研究ComplexNetworkApproachesforReal-WorldTCMClinicalDrugDiscovery:Data
3、MiningalgorithmsandSystemDevelopment作者姓名:杜寧林導(dǎo)師姓名:周雪忠學(xué)號(hào):10120459職稱:副教授學(xué)位類別:工學(xué)碩士學(xué)位級(jí)別:碩士學(xué)科專業(yè):計(jì)算機(jī)科學(xué)與技術(shù)研究方向:復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)北京交通大學(xué)2013年4月致謝本論文的工作是在我的導(dǎo)師周雪忠副教授的悉心指導(dǎo)下完成的,周老師嚴(yán)謹(jǐn)?shù)闹螌W(xué)態(tài)度和科學(xué)的工作方法給了我極大的幫助和影響。在此衷心感謝三年來(lái)周老師對(duì)我的關(guān)心和指導(dǎo)。實(shí)驗(yàn)室于劍老師、景麗萍老師和賈彩燕老師在我的科研工作上提出了許多建設(shè)性意見(jiàn),他們?cè)趯W(xué)術(shù)上的追求也是我們的榜樣,討論班的磨練也讓人升華
4、不少,在此表示衷心的感謝。感謝中國(guó)中醫(yī)科學(xué)院廣安門醫(yī)院張潤(rùn)順老師對(duì)我所做的相關(guān)項(xiàng)目提供了長(zhǎng)期的中醫(yī)相關(guān)知識(shí)的支持與指導(dǎo),在數(shù)據(jù)的人工預(yù)感理上張老師花費(fèi)了很多精力。感謝樊士震在程序設(shè)計(jì)上對(duì)我的指導(dǎo),并對(duì)論文中的平臺(tái)軟件參與了開(kāi)發(fā)。在實(shí)驗(yàn)室工作及撰寫(xiě)論文期間,田曠、劉凱等同學(xué)對(duì)我論文內(nèi)容安排及校對(duì)上給予了熱情幫助,在此向他們表達(dá)我的感激之情。另外也感謝我的父母和家人,他們的理解和支持使我能夠在學(xué)校專心完成我的學(xué)、I匕。摘要摘要:當(dāng)前,復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)已經(jīng)成為研究復(fù)雜系統(tǒng)和復(fù)雜性科學(xué)的主要方法之一。人體生命及其疾病系統(tǒng)是典型的復(fù)雜系統(tǒng)。因此,
5、有學(xué)者提出了網(wǎng)絡(luò)醫(yī)學(xué)的理念,旨在采用復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)的視角和方法進(jìn)行醫(yī)學(xué)以及臨床疾病診治規(guī)律的研究。中藥復(fù)方是中醫(yī)臨床干預(yù)的主要手段,是針對(duì)患者個(gè)體化臨床表現(xiàn)對(duì)癥使用的若干味藥物集合。復(fù)方中的多味藥物在治療過(guò)程中具有復(fù)雜的相互作用關(guān)系,因此,把握復(fù)雜的藥物相互作用規(guī)律是復(fù)方藥物取得療效和復(fù)方新藥創(chuàng)制成敗的關(guān)鍵。中醫(yī)是一門基于臨床診療實(shí)踐的醫(yī)學(xué),源自真實(shí)世界(即日常臨床實(shí)際環(huán)境)臨床診療的數(shù)據(jù)如臨床復(fù)方飽含著中醫(yī)理論知識(shí)和醫(yī)生的創(chuàng)新思維,具有重要科研價(jià)值。本文基于真實(shí)世界臨床診療復(fù)方數(shù)據(jù),從復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)的視角對(duì)中藥復(fù)方的藥物配伍規(guī)律進(jìn)行研究。
6、以此為基礎(chǔ),提出了一種基于網(wǎng)絡(luò)比較的臨床有效復(fù)方發(fā)現(xiàn)方法,并研發(fā)了一個(gè)從臨床數(shù)據(jù)出發(fā)進(jìn)行新藥篩選的軟件平臺(tái)。具體研究?jī)?nèi)容主要包括以下三個(gè)方面。(1)對(duì)來(lái)自臨床實(shí)際具有代表性的五個(gè)復(fù)方集(包括綜合性門診、特定西醫(yī)疾病和特定中醫(yī)證候等三類復(fù)方)進(jìn)行網(wǎng)絡(luò)建模和分析,表明中藥臨床藥物配伍網(wǎng)絡(luò)雖然在結(jié)點(diǎn)度的拓?fù)鋵哟紊喜皇莾缏煞植?,但在邊?quán)和結(jié)點(diǎn)強(qiáng)度的加權(quán)層次上卻呈現(xiàn)強(qiáng)烈的冪律特性,提示藥物組配確實(shí)是中藥臨床復(fù)方的關(guān)鍵環(huán)節(jié)。(2)在中醫(yī)診療和新藥研發(fā)中往往涉及到的一個(gè)重要問(wèn)題是如何發(fā)現(xiàn)核心藥物配伍?;诙喑叨裙歉删W(wǎng)的零模型,我們提出了一種網(wǎng)
7、絡(luò)比較方法來(lái)尋找一個(gè)藥物網(wǎng)絡(luò)與其參照網(wǎng)絡(luò)的顯著差異。該方法能夠在針對(duì)同一疾病在不同療效的復(fù)方集所構(gòu)建的網(wǎng)絡(luò)中尋找出兩者的差異。最終這一方法應(yīng)用在兩個(gè)失眠數(shù)據(jù)集上,取得了較好的分析效果,而算法復(fù)雜度低也使其能夠應(yīng)用在大型數(shù)據(jù)集上。(3)構(gòu)建了一個(gè)基于臨床實(shí)際數(shù)據(jù)的中藥新藥發(fā)現(xiàn)軟件平臺(tái)。該平臺(tái)實(shí)現(xiàn)了數(shù)據(jù)抽取、復(fù)方治療結(jié)局標(biāo)注、數(shù)據(jù)篩選、復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)分析與展示和統(tǒng)計(jì)分析等功能,支持基于臨床實(shí)際數(shù)據(jù)的藥物安全性分析、混淆因素分析、藥物七情分析和核心有效復(fù)方發(fā)現(xiàn)等新藥發(fā)現(xiàn)分析應(yīng)用。關(guān)鍵詞:復(fù)雜網(wǎng)絡(luò);新藥發(fā)現(xiàn);中醫(yī);藥物配伍網(wǎng)絡(luò);真實(shí)世界;有效
8、臨床復(fù)方分析;網(wǎng)絡(luò)比較分類號(hào):TP39ABSTRACTABSTRACT:Networkmodelingandanalysishavebeendevelopedasoneofthepromisingapproachesforexploringtheregulari