玉米重要農(nóng)藝性狀和抗病性狀的全基因組關(guān)聯(lián)分析

玉米重要農(nóng)藝性狀和抗病性狀的全基因組關(guān)聯(lián)分析

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1、玉米重要農(nóng)藝性狀和抗病性狀的全基因組關(guān)聯(lián)分析GENOME-WIDEASSOCIATIONANALYSISOFMAINAG民ONOMICANDRESKTANCETRA打SINMAIZEINBREDLINES博±后姓名;林衡合作導(dǎo)師:王國英流動(dòng)站一(級(jí)學(xué)科)名稱:生物學(xué)專業(yè)(二級(jí)學(xué)科)名稱:生物化學(xué)與分子生物學(xué)研究工作起始時(shí)間2013年6月23日研究工作期滿時(shí)間2015年11月20日中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院(北京)2015年11月玉米重要農(nóng)藝性狀和抗

2、病性狀的全基因組關(guān)聯(lián)分析-WGENOMEIDEASSOCIATIONANALYSISOFMAINAGRONOMICANDRESISTANCETRAITSINMAIZEINB艮EDLINES博±后姓名;林衡合作導(dǎo)師:王國英一流動(dòng)站(級(jí)學(xué)科)名稱:生物學(xué)二)專業(yè)(級(jí)學(xué)科名稱;生物化學(xué)與分子生物學(xué)研究工作起始時(shí)間2013年6月23日研究工作期滿時(shí)間2015年11月20日中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院(北京)2015年11月獨(dú)創(chuàng)性聲明本人聲明所呈交的論文是

3、我個(gè)人在導(dǎo)師指導(dǎo)下進(jìn)行的研究工作及取得的研巧成果。盡我所知,除了文中特別加標(biāo)注和致謝的地方外,論文中不包含其他人己經(jīng)發(fā)表或撰寫過的研究成果,也不包含為獲得中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院或其它教育機(jī)構(gòu)的學(xué)位或證書而使用過的材料一。與我同工作的同志對(duì)本研究所做的任何貢獻(xiàn)均已在論文中作了明確的說明并表示了謝意。博±后簽名;時(shí)間年巧方日胃關(guān)于論文使用授權(quán)的聲明,目本人完全了解中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院有關(guān)保留、使用學(xué)位論文的規(guī)定P;中國農(nóng)業(yè)科學(xué),、院有權(quán)保留送交論文的復(fù)印件和磁盤允許論文被查閱和借閱,可

4、W采用影印縮印或レ掃描等復(fù)制手段保存。、匯編學(xué)位論文同意中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院可ッ用不同方式在不同媒體上發(fā)表、傳播學(xué)位論文的全部或部分內(nèi)容。博±后簽名:時(shí)間;^7//年"月^日合作導(dǎo)師簽名:時(shí)間:又辟^月,〇日摘要玉米作為重要的糧食、飼料和工業(yè)原料,在我國國民經(jīng)濟(jì)中占有舉足輕重的地位。研究玉米自交系遺傳多樣性,、雜種優(yōu)勢類群劃分及雜種優(yōu)勢模式應(yīng)用于自交系改良、,可提高組配雜交種的效率,創(chuàng)新及優(yōu)異種質(zhì)資源挖掘、利用、縮短育種年限是玉米育種工作的重要基礎(chǔ)性研究。本研巧W玉

5、米自交系為研究對(duì)象,基于遺傳距離劃分優(yōu)良玉米種質(zhì)雜種優(yōu)勢群,探討雜種優(yōu)勢模式371181190)玉米自交系構(gòu)成的。利用份(東華北民份&黃淮海區(qū)份1自然群體為供試材料,對(duì)考察的15個(gè)主要性狀進(jìn)行表型多樣巧分析,選?。叮罚穫€(gè)SNP標(biāo)ill進(jìn)巧遺傳多樣性、群體結(jié)構(gòu)分析,并運(yùn)用基于全基因組掃描的關(guān)聯(lián)分析策略挖掘與,表型性狀顯著關(guān)聯(lián)標(biāo)記,進(jìn)而開展單倍型分析篩選優(yōu)良種質(zhì)資源為自交系改良和新品系培育奠定堅(jiān)實(shí)理論基礎(chǔ):。主要研究結(jié)論如下1,.玉米自交系表型性狀統(tǒng)計(jì)分析可知兩種生態(tài)區(qū)內(nèi)除吐絲期、

6、散粉期和桿粒含水量外的性狀變異系數(shù)均大于,10%瘤黑粉病性狀在兩種生態(tài)區(qū)下的變異系數(shù)分別為197.65%、193.07%;性狀正態(tài)性檢驗(yàn)顯示15個(gè)性狀均為正態(tài)或偏正態(tài)分布,充分說明供試關(guān)聯(lián)分析群體存在豐富的表型變異。2.利用6771個(gè)多態(tài)性SNP標(biāo)記分析371份玉米自交系的遺傳相似系數(shù),其變幅為-0.270,55。LH2057.99平均為0.與改M01遺傳相似性最小為0.27。各品種平均相-583似系數(shù)變幅為0化,其變異系數(shù)較大為3.77%,表明供試玉米自交系遺傳多.384

7、樣性較為豐富。3,.群體結(jié)構(gòu)分析,根據(jù)不同玉米自交系的遺傳組成Q含0.500的自交系劃分到相應(yīng)亞群中,將283份材料劃分到四個(gè)亞群中,各個(gè)類群歸入材料數(shù)目依次為類AA01群584-73份、類鄭群1份、類BB01群110份、類昌72群59份,并與基于遺傳相似一致系數(shù)聚類結(jié)果基本。4.篩選與性狀思著關(guān)聯(lián)的SNP位點(diǎn)。東華北區(qū)檢出24個(gè)強(qiáng)關(guān)聯(lián)位點(diǎn),其中10號(hào)染色6個(gè),關(guān)聯(lián)性狀依次為吐絲期位體檢出位點(diǎn)最多為、散粉期、瘤黑粉病、百粒重;-于1號(hào)染色體的PZE101063113和株高及

8、穗位高關(guān)験,位于SYN2629010號(hào)染色體的和吐絲期及散粉期關(guān)聯(lián)。黃淮海區(qū)檢出22個(gè)強(qiáng)關(guān)聯(lián)位點(diǎn),3號(hào)染色體檢出位點(diǎn)最多5個(gè),、行粒數(shù)為關(guān)聯(lián)性狀依次為株高;位于3號(hào)染色體的、吐絲期、散粉期PZE-103035720和吐絲期及散粉期關(guān)聯(lián)。5.基于與各個(gè)性狀少數(shù)最強(qiáng)關(guān)聯(lián)標(biāo)記進(jìn)斤單倍型分析,篩選高產(chǎn)、抗病和早熟自交系。------50%的材料有115份,占供試材料的3,4東華北區(qū)選擇指數(shù)含1%其中D37621111和LM33FM選擇指數(shù)

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