核酸定量與光吸收值

核酸定量與光吸收值

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1、260/280;260/230&核酸定量核酸在波長260nm處有最高吸收峰。吸收紫外光的性質是嘌呤環(huán)和嘧啶環(huán)的共軛雙鍵系統(tǒng)所具有的,所以嘌呤和嘧啶以及一切含有它們的物質,不論是核苷、核苷酸或核酸都有吸收紫外光的特性。但紫外法不能區(qū)分DNA和RNA,只能用來鑒定核酸的純度和含量。蛋白質由于含有芳香氨基酸,因此也能吸收紫外光。通常蛋白質的吸收高峰在280nm波長處,在260nm處的吸收值公為核酸的十分之一或更低,故核酸樣品中蛋白質含量較低時對核酸的紫外測定影響不大。RNA的260nm與280nm吸收的比值在2.0以上;DNA的260nm與280nm吸收的比值則在1.

2、9左右。當樣品中蛋白質含量較高時比值即下降。核酸的定量DNA和RNA都有吸收紫外光的性質,它們的吸收高峰在260nm波長處,每種核酸的分子構成不一,因此其換算系數(shù)不同。定量不同類型的核酸,事先要選擇對應的系數(shù)。如:1OD的吸光值分別相當于50μg/ml的dsDNA,37μg/ml的ssDNA,40μg/ml的RNA,30μg/ml的寡核苷酸。測試后的吸光值經(jīng)過上述系數(shù)的換算,從而得出相應的樣品濃度,這些由分光光度計內預設的程序執(zhí)行,因此,測試前選擇正確的程序,測試樣品的類型,首先測試空白液,然后再測試樣品,注意輸入樣品稀釋倍數(shù)。如何避免吸光值漂移讀數(shù)不穩(wěn)定可能是

3、實驗者最頭痛的問題。靈敏度越高的儀器,表現(xiàn)出的吸光值漂移越大。事實上,分光光度計的設計原理和工作原理,允許吸光值在一定范圍內變化,即儀器有一定的準確度和精確度。核酸本身物化性質溶解核酸的緩沖液的pH值、離子濃度等在測試時,離子濃度太高也會導致讀數(shù)漂移,因此建議使用pH值一定、離子濃度較低的緩沖液(如TE)可大大穩(wěn)定讀數(shù)。核酸的吸光值受pH值和緩沖液離子濃度影響。只有在一定的pH值和低離子濃度的條件下(如10mMTris-HClpH8.0),才能得到精確的檢測結果。水的pH值不穩(wěn)定,可能導致檢測誤差。一些緩沖液在紫外范圍內存在自身吸收,為了確保準確測量,請使用與懸

4、浮或洗脫樣品時相同的緩沖液。樣品的稀釋濃度同樣是不可忽視的因素,由于樣品中不可避免存在一些細小的顆粒,尤其是核酸樣品。這些小顆粒的存在干擾測試效果。為了最大程度減少顆粒對測試結果的影響,要求核酸吸光值至少大于0.1A,吸光值最好在0.1-1.5A。在此范圍內,顆粒的干擾相對較小,結果穩(wěn)定。從而意味著樣品的濃度不能過低,或者過高(超過光度計的測試范圍)。操作因素如混合要充分,否則吸光值太低,甚至出現(xiàn)負值;混合液不能存在氣泡,空白液無懸浮物,否則讀數(shù)漂移劇烈;必須使用相同的比色杯測試空白液和樣品,否則濃度差異太大;換算系數(shù)和樣品濃度單位選擇一致;不能采用窗口磨損的比

5、色杯;樣品的體積必須達到比色杯要求的最小體積等多個操作事項。各波長具體含義及相關問題1.A260nm是核酸最高吸收峰的吸收波長,最佳測量值的范圍為0.1至1.0。如果不在此范圍,稀釋或濃縮樣品,使之在此范圍內;如果吸光度小于0.05,檢查是否存在操作因素(如移液不準確,樣品內有懸浮物等)影響。DNA樣品的A260吸光度值是否>0.1。(請注意,這個值跟儀器無關,核酸的吸光度必需大于0.1,其值才有效和可靠,因為樣品中的雜質和顆粒這些不純物的干擾通常會對光有一定吸收,其值<0.1);1.A280nm,A270nm是蛋白最高吸收峰的吸收波長,比值可進行核酸樣品純度評

6、估:純DNA的A260/A280比值為1.8,純RNA為2.0。如果比值低,表示受到蛋白(芳香族)或酚類物質的污染,需要純化樣品。比值=1.5相當于50%蛋白質/DNA溶液.酚的最大吸收峰在270nm。2.A230nm是碳水化合物最高吸收峰的吸收波長,比值可進行核酸樣品純度評估:純DNA和RNA的A260/A230比值為2.5。若比值小于2.0標明樣品被碳水化合物(糖類)、鹽類或有機溶劑污染,需要純化樣品。A230產(chǎn)生負值主要是由于在很低DNA濃度的溶液中的一些其他成分的干擾所導致的。在下一個測定中,需要降低樣品的稀釋度,A230的負值會被校正。3.A320nm

7、或A340nm為檢測溶液樣品的濁度和其他干擾因子。該值應該接近0.0。如果不是,標明溶液中有懸浮物,需要純化樣品。純樣品的A320一般是0。4.A260/A280和A260/A230是核酸純度的指示值。純度好的DNA或RNA,在pH7-8.5下A260/A280的比值應該在2.0或2.5。純凈的樣品比值大于1.8(DNA)或者2.0(RNA)。如果比值低于1.8或者2.0,表示存在蛋白質或者酚類物質的影響。A230表示樣品中存在一些污染物,如碳水化合物、鹽(胍鹽)等,較純凈的核酸A260/A230的比值大于2.0。當0.5%BSA蛋白質污染時,蛋白污染會導致26

8、0和280的數(shù)值都下降,

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