plce1基因多態(tài)性及中國中部人群食管鱗癌遺傳易感性

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1、原創(chuàng)性聲明本人鄭重聲明:所呈交的學位論文,是本人在導師的指導下,獨立進行研究所取得的成果。除文中已經(jīng)注明引用的內(nèi)容外,本論文不包含任何其他個人或集體已經(jīng)發(fā)表或撰寫過的科研成果。對本文的研究作出重要貢獻的個人和集體,均己在文中以明確方式標明。本聲明的法律責任由本人承擔。學位論文作者:日期:年月日學位論文使用授權聲明本人在導師指導下完成的論文及相關的職務作品,知識產(chǎn)權歸屬鄭州大學。根據(jù)鄭州大學有關保留、使用學位論文的規(guī)定,同意學校保留或向國家有關部門或機構(gòu)送交論文的復印件和電子版,允許論文被查閱和借閱;本人授權鄭州大學可以將本學位論文的全部或部分編入有關數(shù)據(jù)庫進行檢索,可以采用影印

2、、縮印或者其他復制手段保存論文和匯編本學位論文。本人離校后發(fā)表、使用學位論文或與該學位論文直接相關的學術論文或成果時,第一署名單位仍然為鄭州大學。保密論文在解密后應遵守此規(guī)定。學位論文作者:日期:年月日摘要一個新的功能性單核苷酸多態(tài)‘

3、生(singlenucleotidepolymorphism,SNP)位點rs2274223,在三個基于中國人群有關食管鱗癌(Esophagealsquamouscellcarcinoma,ESCC)的大規(guī)模全基因組關聯(lián)分析(Genome.wideassociationstudy,GWAS)研究中均被發(fā)現(xiàn),其位于磷脂酶Col(phospholip

4、aseCepsilon1,PLCEl)基因。PLCEl基因編碼的PLCEl(phospholipaseCepsilon1)蛋白是磷脂酶C(phospholipaseC,PLC)家族一個獨特的成員,其可以催化多磷酸肌醇水解,產(chǎn)生1,4,5-三磷酸(Inositol,1,4,5-triphosphate,IP3)和二酰甘油(diacylglcerol,DAG)兩種第二信使,繼而參與細胞的生長和分化。因此,深入探討PLCEl基因多態(tài)性與食管鱗癌的關系尤為必要。這將為探討食管鱗癌的病因?qū)W提供科學依據(jù),同時,這將對篩選高危人群和保護易感人群有重要意義,也為采取有效的干預措施提供理論基礎。

5、目的探討PLCEl基因三個功能性位點的多態(tài)性與食管鱗癌的關系以及基因.基因,基因.環(huán)境的交互作用,為揭示食管癌病因?qū)W機制提供理論依據(jù)。方法在中國中部漢族人群中,采取病例.對照研究方法,按照頻數(shù)匹配原則,選取381例醫(yī)院來源的食管鱗癌新發(fā)病例和420例健康對照,采用聚合酶鏈反應.限制性片段長度多態(tài)·I生(PCR.RFLP)技術對rsl7417407位點和rs2274223位點進行基因型檢測;采用等位基因特異聚合酶鏈反應(Allele.specificPCR,AS.PCR)技術對rs2274224位點進行基因型檢測。利用統(tǒng)計學軟件SPSSl7.0,對病例組和對照組的樣本特征進行頻率

6、描述,利用,檢驗比較食管鱗癌患者和健康對照組之間的年齡、性別、吸煙、飲酒及腫瘤家族史的差異,采用Hardy.weinberg在線分析軟件分析Hardy-Weinberg平衡。采用非條件二分類Logistic回歸比較各基因型在病例組和健康對照組之間分布頻率的差異。利用Haploview4.0軟件計算連鎖不平衡值(LD)值。利用SHEsis在線軟件進行單體型預測、構(gòu)建及分析。利用趨勢礦檢驗,分析突變位點數(shù)量摘要與食管鱗癌發(fā)病風險之間的劑量反應關系。利用多因素降維法(MDR)分析基因.環(huán)境交互作用。結(jié)果單個SNP位點分析表明,rs2274223位點突變雜合基因型AG、突變純合基因型G

7、G及聯(lián)合突變基因型(AG+GG)均能增加食管鱗癌的發(fā)病風險,其0R(95%CI)分別為1.80(1.30,2.49)、2.80(1.45,5.39)、1.92(1.41,2.62)。rs2274224位點突變雜合基因型CG能降低食管鱗癌的發(fā)病風險(鍬:O.65,95%CI:O.46.0.91)。單體型GrSl74l7407A體2274223C巧2274224可降低食管鱗癌的發(fā)病風險(C懨:O.76,95%CI:O.62.0.93),同時,單體型GrSl7417407Grs2274223CrS2274224、Trsl7417407Grs2274223C體2274224均可增加食管

8、鱗癌的發(fā)病風險,其0R(95%C1)分別為1.75(I.33,2.18)、2.51(1.15,5.49)?;颍h(huán)境交互作用分析顯示,最優(yōu)模型為rs2274223、rs2274224、腫瘤家族史及吸煙四因素的交互。該模型交叉驗證的統(tǒng)計量及其對應值分別為訓練集平均精度:0.66、測試集平均精度:0.58、十重交叉驗證的一致率(比值)為7:10。結(jié)果表明,在該模型中“高?!比巳菏彻荀[癌的發(fā)病風險是“低?!比巳旱?.67倍(锨:3.67,95%CI:2.74.4.92)。結(jié)論PLCEl基因rs22

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