陰道細菌群落多樣性及外陰陰道念珠菌病相關(guān)白念珠菌基因多態(tài)性研究

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1、博士學位論文學校代碼：10023學號：B2010017001陰道細菌群落多樣性及外陰陰道念珠菌病相關(guān)白念珠菌基因多態(tài)性研究所院：皮膚病研究所姓名：李彩霞指導教師：劉維達導師小組：龔向東李岷王洪生呂桂霞學科專業(yè)：皮膚病與性病學研究方向：醫(yī)學真菌學完成日期：2013年5月DoctoralDissertationStudyonthebacterialcommunitiesinvaginaandgeneticpolymorphismsofCandidaalbicansassociatedwithvulvovagin

2、alcandidiasisByLiCaixiaUnderthesupervisionofProf．WeidaLiuInstituteofdermatologyPeakingUnionMedicalCollege&ChineseAcademyofMedicalScienceMay,2013北京協(xié)和醫(yī)學院博士學位論文目錄中文摘要?????????????????????????????．1英文摘要?????????????????????????????．3前言?????????????????????????

3、??????．．5第一部分454焦磷酸測序研究健康女性陰道菌群多樣性?????????一9第二部分南京地區(qū)婦女外陰陰道念珠菌病的分子流行病學研究??????．27第三部分妊娠期外陰陰道念珠菌病相關(guān)白念珠菌基因多態(tài)性的研究????．40全文小結(jié)?????????????????????????????．7l全文參考文獻一覽?????????????????????????．73綜述1陰道菌群多樣性研究進展???????????????????79綜述2白念珠菌基因分型方法的研究進展??????????????

4、?．89綜述3RespiratoryinfectionscausedbyTrichosporonspecies?????????98附錄???????????????????????????????109學位論文原創(chuàng)性聲明和授權(quán)使用說明?????????????????11l參加學術(shù)會議???????????????????????????113在讀期間發(fā)表論文?????????????????????????115致謝???????????????????????????????117北京協(xié)和醫(yī)學院博士學

5、位論文中文摘要第一部分454焦磷酸測序研究健康女性陰道細菌群落多樣性目的了解正常女性陰道微環(huán)境中各種細菌的種類和豐度。方法采集20例健康志愿者的陰道分泌物標本，直接提取基因組DNA，使用細菌16SrRNA通用引物擴增V1．V3區(qū)，產(chǎn)物進行焦磷酸測序。對測序數(shù)據(jù)進行有效數(shù)據(jù)統(tǒng)計，評估樣本中的菌群的豐度和多樣性，對菌群進行門、綱、目、科、屬、種六個水平的分類學比較。結(jié)果20個樣本中共檢測到有效序列115329條，平均每個樣本5766條，序列平均長度477bp。經(jīng)聚類比對，共生成2363個操作分類單元。在門的水平

6、共檢測到了6個門，其中以硬壁菌門為最多。在60個屬中，乳桿菌屬占絕大多數(shù)，平均含量在90％以上。而種的水平上，L．crispatus是最常見的菌種，其他種的乳桿菌少見。結(jié)論健康女性陰道菌群以乳桿菌為主，且L．crisputs是最常見的組成部分。第二部分南京地區(qū)婦女外陰陰道念珠菌病的分子流行病學研究目的了解南京地區(qū)引起外陰陰道念珠菌病的白念珠茵的優(yōu)勢基因型，比較不同年齡、不同生理狀態(tài)下白念珠菌基因型分布是否存在差異。方法收集2011年12月至2012年04月在南京市婦幼保健醫(yī)院就診的外陰陰道念珠菌病病例，獲取

7、患者的臨床資料和陰道分泌物標本。分泌物均經(jīng)鏡檢、培養(yǎng)純化及分子生物學鑒定。對鑒定為白念珠菌的菌株基因組DNA使用CAI微衛(wèi)星標記進行擴增，產(chǎn)物經(jīng)毛細管電泳后用ABI3700測序儀掃板后分析。結(jié)果共收集外陰陰道念珠菌病例246例，微衛(wèi)星標記成功擴增了208株白念珠菌DNA，共檢測到了51種基因型。其中占前三位的基因型分別是30：45，21：21和32：46，分別占所檢測樣本的29．3％、13．0％和12．O％。妊娠人群中主要的基因型是46：46、32：46和21：21，妊娠人群白念珠菌基因型與非妊娠人群分布存

8、在差異。各年齡組間白念珠菌基因型分布未見明顯差異。結(jié)論南京地區(qū)外陰陰道念珠菌病相關(guān)的白念珠菌基因型分布有著獨特的分布特征。妊娠人群的基因型分布與非妊娠人群相比具有顯著性差異。而年齡與基因型分布無關(guān)。第三部分妊娠期外陰陰道念珠菌病相關(guān)的白念珠菌基因多態(tài)性的研究目的了解引起妊娠婦女外陰陰道念珠菌病的白念珠菌基因型分布情況。方法收集中后期妊娠外陰陰道念珠菌病患者的陰道分泌物樣本，經(jīng)培養(yǎng)鑒定為白念珠菌后提取基因組DNA。