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《絨山羊次級毛囊周期性生長相關(guān)基因的篩選》由會員上傳分享,免費在線閱讀,更多相關(guān)內(nèi)容在學(xué)術(shù)論文-天天文庫。
1、■.■%?分類號S8T3.3學(xué)校代碼101巧UDC的6.3學(xué)號201220…15A?xí)g(shù)《嗦乂爭碩±學(xué)位論文絨山羊次級毛囊周期性生長相關(guān)基因的篩選SelectionofRelativeGeneDuringSecondaryHairFollicleCyclinginCashmereGoat、申請人:張雜學(xué)科口類:農(nóng)學(xué)學(xué)科專業(yè):動物遺傳育種與繁殖硏究方向:絨山羊遺傳育種原理與方法指導(dǎo)教師:李金泉教授張燕軍副教授—論文提交日期:二〇五年
2、六月巧蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)研究生學(xué)位論文獨創(chuàng)聲明本人申明所呈交的學(xué)位論文是我本人在導(dǎo)師指導(dǎo)下進行的研究工作及取得的研究成果。據(jù)我所知,除了文中特別加標注和致謝的地方外,論文中不包括其他人已經(jīng)發(fā)表或撰寫過的研究成果,也不包括為獲得我校或其他教育機構(gòu)的學(xué)位或證書而使用過的材料一,與我同工作的同志對本研究所做的任何貢獻均己在論文中作了明確的說明并表示謝意。一申請學(xué)位論文與資料若有不實之處,本人承擔(dān)切相關(guān)責(zé)任。瓜典《-論文作者簽名:日期:施-y內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)研究生學(xué)位論文版權(quán)使用授權(quán)書目本人完全了解內(nèi)
3、蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)有關(guān)保護知識產(chǎn)權(quán)的規(guī)定,P;研究生在攻讀學(xué)位期間論文工作的知識產(chǎn)權(quán)單位屬內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)。本人保證畢業(yè)離校后,發(fā)表論文或使用論文工作成果時署名單位為內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué),且導(dǎo)師為通訊作者,通訊作者單位亦署名為內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)。學(xué)校有權(quán)保留并向國家有關(guān)部口或機構(gòu)送交論文的復(fù)印件和電子文檔,允許論文被查閱和借閱。學(xué)??桑坠紝W(xué)位論文的全部或部分內(nèi)容(保密內(nèi)容除外),采用影印、縮印或其他手段保存論文。論文作者簽名:指導(dǎo)教師簽名:旅日期:cML—Lif??.-摘要本研究對內(nèi)蒙古絨
4、山羊與薩能奶山羊的四個時期的皮膚樣品進行了轉(zhuǎn)錄組測序。利用生物信息學(xué)分析巧法對相同時期的絨山羊與奶山羊的差異表達基因和絨山羊不同時期之間的差昇表達基因進行了分析,W期能夠篩選出與次級毛囊周期性生長相關(guān)的候選基因,為深入探索絨毛生長發(fā)育《¥|^論依據(jù)。主剪開鱗果如下:mi-(。利巧皿inaHise2000對絨山羊與奶山羊四個時期的助躍樣品進斤了RNASq巧測序。測序共獲得38G數(shù)掠平均皆t樣品4.7G。每t樣品的原始reads均渡imoo萬化?。?,Clean比 ̄汾%料上。例在77%。檢出的山羊基因總數(shù)為2
5、0780,檢出率誕?。剩牐梗罚保担ィǎ玻┓治霾町惐磉@基因發(fā)現(xiàn)絨山羊與奶山羊間相同時期共有2409個差異表達基因,其中3月份共有3洗個塞異表達基卸6月份共有220個差異泰達基因,9月份共有427個差異表運基因,。月做箱。14。個差異表達基因(3)絨山羊不同時期差異就基因共550個,其中6月Vs3月有146個差異表達基因,9月Vs6月有98個基因,12月Vs9月有83個基因,3月Vs12月有223個熱就基因。(4)GO功能注釋分類濕示、細胞部分、細胞器部分,,差異表達基因主要富集在細胞通過結(jié)合、催化功能
6、參與生物調(diào)控、細胞M、備過程等生獅呈。(5)KEGGpafhway分析發(fā)孤絨山羊與奶山羊差異表達基因有巧個富集在與毛蕩生長相關(guān)的味、?VT規(guī)W、:OVF、M4P^和JVofcA信號通路中。絨山羊不同時期差異基因_有…個富集在與毛囊生長相關(guān)的WVT、化獻:TGiW、27VF和始4化信號通路中,可作為臟期性生長相游織基因,進行后續(xù)功能研究。(6)采用實時定量PCR對化個差異表達進行基因表達水平驗證,發(fā)現(xiàn)實時定量與轉(zhuǎn)龍分備果基衣-孰表明挪膊結(jié)菊頓I可靠。關(guān)鍵詞:絨山羊;M毛囊生怡轉(zhuǎn)錄組測麻候選基因;篩選;周
7、期SelectionofRelativeGeneDurinSecondarHairFollicleCyclingingyCashmereGoatAbstractscashmereoatandsudyuthetranscritomeeuencintdinolonnerMonoKa,ThitseseinIgpqggygsaanenmilkoafsskinresearch,deeseuencingtheskinsamlesfix)mfourrowtheriods
8、.Usinggpgpqpbioinformadcsanalsisthedifeimtiaflyexpressedenesbetweencasbmoeoatandmilkoatsintheygg