白氏文昌魚(yú)IKK基因的克隆及其免疫功能分析

白氏文昌魚(yú)IKK基因的克隆及其免疫功能分析

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1、學(xué)位論文獨(dú)創(chuàng)性聲明本人鄭重聲明:所提交的學(xué)位論文是本人在導(dǎo)師指導(dǎo)下進(jìn)行的研究工作和取得的研究成果。本論文中除引文外,所有實(shí)驗(yàn)、數(shù)據(jù)和有關(guān)材料均是真實(shí)的。本論文中除引文和致謝的內(nèi)容外,不包含其他人或其它機(jī)構(gòu)已經(jīng)發(fā)表或撰寫(xiě)過(guò)的研究成果。其他同志對(duì)本研究所做的貢獻(xiàn)均已在論文中作了聲明并表示了謝意。學(xué)位論文作者簽名:f虱孔芻日期:如tj}ts’坫學(xué)位論文使用授權(quán)聲明研究生在校攻讀學(xué)位期間論文工作的知識(shí)產(chǎn)權(quán)單位屬南京師范大學(xué)。學(xué)校有權(quán)保存本學(xué)位論文的電子和紙質(zhì)文檔,可以借閱或上網(wǎng)公布本學(xué)位論文的部分或全部?jī)?nèi)容,可以采用影印、

2、復(fù)印等手段保存、匯編本學(xué)位論文。學(xué)??梢韵驀?guó)家有關(guān)機(jī)關(guān)或機(jī)構(gòu)送交論文的電子和紙質(zhì)文檔,允許論文被查閱和借閱。(保密論文在解密后遵守此規(guī)定)保密論文注釋:本學(xué)位論文屬于保密論文,密級(jí):Z區(qū)鹽保密期限為——年。學(xué)位論文作者簽名:C虱昀指導(dǎo)教師簽名:日期:沙啊s、沾Lt期:.土‘摘要形態(tài)學(xué)以及分子生物學(xué)的證據(jù)表明文昌魚(yú)是脊索動(dòng)物中的基底生物,是研究脊椎動(dòng)物形態(tài)、發(fā)育以及免疫系統(tǒng)的起源與進(jìn)化的重要模式生物。隨著比較免疫學(xué)的迅速發(fā)展,以及佛羅里達(dá)文昌魚(yú)基因組測(cè)序的完成,關(guān)于文昌魚(yú)免疫的研究越來(lái)越引起人們的關(guān)注。因此,本研究在

3、文昌魚(yú)EST數(shù)據(jù)庫(kù)的基礎(chǔ)上,利用分子生物學(xué)方法初步研究了文昌魚(yú)IKK基因在LPS刺激后的免疫應(yīng)答方面的機(jī)制,同時(shí)結(jié)合進(jìn)化分析了文昌魚(yú)IKK基因在進(jìn)化中的地位,本論文主要的研究成果如下:(1)利用RACE對(duì)白氏文昌魚(yú)的AmphilKK基因進(jìn)行克隆,結(jié)果表明AmphilKK基因的cDNA序列全長(zhǎng)3087bp,其中ORF包含2334bp,預(yù)計(jì)編碼777aa,5’UTR包含164bp,3’UTR包含589bp。(2)經(jīng)過(guò)初步分析表明,AmphiIKK的理論分子量為89.3kDa,等電點(diǎn)為6.26;AmphiIKK與之前發(fā)現(xiàn)

4、的IKK蛋白之間存在著43.8%.64.0%的相似性,23.6%.43.3%的一致性。AmphiIKK蛋白具有哺乳動(dòng)物IKK蛋白一樣,具有一個(gè)保守的絲氨酸/蘇氨酸激酶結(jié)構(gòu)域,在這個(gè)結(jié)構(gòu)域中,含有一個(gè)絲氨酸/蘇氨酸激酶活化位點(diǎn)和一個(gè)保守的MAPKK活化莖環(huán)。與人類的IKKa和IKKl3比較,文昌魚(yú)IKK蛋白同樣具有一個(gè)潛在的HLH基序,一個(gè)LZ結(jié)構(gòu),和NBD結(jié)構(gòu)。AmphiIKK蛋白的空間三級(jí)結(jié)構(gòu)與其他7個(gè)物種的IKK蛋白均相同,均折疊成“手槍”狀。系統(tǒng)發(fā)育分析表明,AmphiIKK間于無(wú)脊椎動(dòng)物和脊椎動(dòng)物之間,和合

5、浦珠母貝、太平洋牡蠣等無(wú)脊椎動(dòng)物更為接近。(3)實(shí)時(shí)定量檢測(cè)表明IKK基因在所有檢測(cè)的組織中均表達(dá),其中在肌肉、鰓和脊索中表達(dá)最為豐富。在LPS刺激后,AmphilKK在6h有1.46倍的表達(dá)量,在8h時(shí)有1.80倍的表達(dá)量,在12h后趨于平常,表明在外源LPS刺激后文昌魚(yú)IKK基因表現(xiàn)出上調(diào)趨勢(shì)。關(guān)鍵詞:文昌魚(yú);Ird3激酶;NF.r,B:LPS;適應(yīng)性免疫AbstractBothmorphologicalandmolecularevidenceshowthatamphioxusisthebasalchordat

6、eandisacrucialorganismforunderstandingthechordateevolutionincludingtheoriginoftheimmunesystem,morphologyanddevelopment.Withtherapiddevelopmentofcomparativeimmunology,aswellasthecompletionoftheBranchiostomafloridaegenomesequencing,theattentionWasfocusedonamphio

7、xusimmuneincreasingly.Therefore,thisstudyonthebasisofAmphioxusESTdatabase,usedmolecularbiologymethodstostudyAmphilKKgeneafterLPSstimulationmechanism,whileanalyzedtheAmphilKKgeneevolution.Themainresultsofthethesisareasfollow:(1)TakingadvantageoftheIKKconservedd

8、omainandESTlibraryofamphioxus(Branchiostomafloridae),wesearched,amplifiedandvalidateda627bpeDNAfragmentfromamphioxus.Basedonthe627bpfragment,a480bpanda2543bpfragmentwereamplifiedby

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