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《感染球孢白僵菌的家蠶免疫應(yīng)答差異表達(dá)基因分析.pdf》由會員上傳分享，免費(fèi)在線閱讀，更多相關(guān)內(nèi)容在應(yīng)用文檔-天天文庫。
1、昆蟲學(xué)報(bào)ActaEntomologicaSinica，January2014，57(1)：13—24ISSN0454-6296感染球孢白僵菌的家蠶免疫應(yīng)答差異表達(dá)基因分析侯成香，覃光星，耿濤，高坤，潘中華，錢荷英，郭錫木，2，l、、江蘇科技大學(xué)蠶業(yè)研究所，江蘇鎮(zhèn)江212018；2．中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院蠶業(yè)研究所，江蘇鎮(zhèn)江212018)摘要：【目的】篩選家蠶Bombyxmori應(yīng)對白僵菌Beauveriabassiana侵染的應(yīng)答基因，以進(jìn)一步研究家蠶抵御真菌侵染的分子機(jī)制?！痉椒ā坎捎眯乱淮鶶olex
2、a高通量測序技術(shù)對感染白僵菌及未感染白僵菌的對照組家蠶進(jìn)行了測序分析，篩選差異表達(dá)基因；結(jié)合生物信息學(xué)工具分析差異表達(dá)基因的功能注釋、分類及涉及的信號通路等；應(yīng)用熒光定量PCR技術(shù)驗(yàn)證10個(gè)基因的差異表達(dá)?！窘Y(jié)果】通過測序和生物信息學(xué)分析共獲得377個(gè)差異表達(dá)基因，其中表達(dá)上調(diào)基因236個(gè)，下調(diào)基因141個(gè)；KEGG通路分析表明，各通路中既有表達(dá)上調(diào)的基因，也有下調(diào)基因；12個(gè)上調(diào)基因、26個(gè)下調(diào)基因參與3個(gè)顯著性富集的KEGG通路，即核糖體、氨酰tRNA生物合成和剪接體通路。定量PCR與測序結(jié)
3、果顯示，溶菌酶、熱激蛋白、谷胱甘肽s-轉(zhuǎn)移酶、肽聚糖識別蛋白等與免疫應(yīng)激相關(guān)的蛋白基因均呈現(xiàn)表達(dá)上調(diào)?！窘Y(jié)論】本研究篩選獲得的差異表達(dá)基因，特別是上調(diào)表達(dá)的基因可能與家蠶應(yīng)對白僵菌侵染的應(yīng)答機(jī)制有關(guān)，其中與免疫應(yīng)激相關(guān)的蛋白基因如溶菌酶、熱激蛋白、谷胱甘肽S一轉(zhuǎn)移酶、肽聚糖識別蛋白基因等可能直接參與了家蠶對白僵菌的免疫識別和防御，研究結(jié)果為從分子水平闡明家蠶抵御真菌侵染的防御機(jī)制和白僵菌對家蠶的致病機(jī)理提供新的依據(jù)。關(guān)鍵詞：家蠶；球孢白僵菌；免疫應(yīng)答；轉(zhuǎn)錄組；差異表達(dá)基因中圖分類號：Q965．8
4、文獻(xiàn)標(biāo)識碼：A文章編號：0454-6296(2014)01-0013。12infectionbyBeauveriabassianaHOUCheng-Xiang，，QINGuang．Xing，，GENGTao，，GAOKun，，PANZhong．Hua，QIANHe—Ying，GUOXi—Jie(1．SericuhuralResearchInstitute，JiangsuUniversityofScienceandTechnology，Zhenjiang212018，Jiangsu，China；2
5、．SericuhuralResearchInstitute，ChineseAcademyofAgriculturalSciences，Zhenjiang，Jiangsu212018，China)Abstract：【Aim】Toscreentheresponsivegenesofthesilkworm(Bombyxmori)againstinfectionbyBeauveriabassianainordertofurtherelaborateitsmolecularmechanismsofdefe
6、nsingB．bassianainfection．【Methods】HighthroughputSolexasequencingtechnologywasemployedinthetranscriptomeanalysisofsilkwormlarvaeoftheinfectedanduninfected(contro1)groups．Diferentiallyexpressedgenes(DEGs)andtheirfunctions，classificationsandpathwayswere
7、analyzedbybioinformaticsmethods．TenDEGswerefurtheridentifiedbyfluorescencequantitativePCR．【Results】WithSolexasequencingandbioinformaticanalysis，377DEGsincluding236up—regulatedgenesand141down—regulatedgeneswereidentified．KEGGpathwayanalysisindicatedth
8、attherewerebothup—anddown—regulatedDEGsinanypathway．Twelveup-regulatedDEGsand26down—regulatedoneswereinvolvedinthreesignificantlyenrichedKEGG(KyotoEncyclopediaofGenesandGenomes)pathways，i．e．，ribosome，aminoacyl—tRNAbiosynthesisandspliceosomepathways．B
