丙型肝炎病毒基因分型檢測方法研究進展-論文.pdf

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1、2014年8月第34卷第8期中國實用內科雜志819綜述丙型肝炎病毒基因分型檢測方法研究進展周一萌,竇曉光,張琳O0l:10.7504/nI(2014070703中圖分類號:R512.6+3文獻標志碼:A關鍵詞:丙型肝炎病毒;基因型Keywords:hepatitisCvirus;genotype丙型肝炎病毒(HCV)是引起慢性肝病的主要病原之我國慢性丙型肝炎患者基因亞型分布總體上以1b亞型一,屬黃病毒科,基因組為單股正鏈RNA,全基因組約為主,2a亞型其次,但是存在地區(qū)差異性。2002年Chen9.6kb。目前全世界HCV感染者很可能已超過

2、2.0等73、2005年Lu等以及Dong等研究顯示,1b型仍為億。我國人群抗HCV陽性率為3.2%,約有近4千萬感染我國HCV流行的主要基因型,1型和2型在年老的患者中較者。大部分HCV感染轉為慢性感染,其中20%慢性丙型多,而3型和6a型在年輕人中較多。HCV基因型地區(qū)分布肝炎患者發(fā)展為肝硬化,另外20%進展為肝細胞癌。HCV不是固定不變的,影響因素有人群的流動、靜脈吸毒者增加、基因分型與病程發(fā)展和干擾素治療應答有密切的關系J,因血液透析等治療措施的普及以及使用檢測方法的不同。比此,HCV基因分型的檢測對控制丙型肝炎的傳播、提高丙型如由

3、于人口的流動,西南邊境地區(qū)6a型已取代2a型成為第肝炎的治療效果非常重要。本文將對HCV基因分型檢測方二流行基因型j。法研究現(xiàn)狀做一綜述。1.3HCV基因型的臨床意義歐洲肝病學會診療指南指出,HCV基因1型患者,經標準劑量的聚乙二醇干擾素1HCV基因型的研究現(xiàn)狀(PEG—IFN)聯(lián)合利巴韋林(RBV)治療48周后,40%~54%1.1HCV基因分型1993年Simmonds等。通過比較不同的患者獲得SVR。HCV基因2型或3型患者,經標準劑量的HCV毒株編碼非結構蛋白5(NS5)區(qū)域的核苷酸序列,進行PEG—IFN聯(lián)合RBV治療24周后,6

4、5%~82%的患者獲得系統(tǒng)進化分析,按照發(fā)現(xiàn)的先后順序將HCV分為1—6型,SVR。不同基因型利巴韋林的治療劑量也不同,基因l、4、5、每個型下面有若干亞型,以a、b、c等表示。該分型法能與先6型患者的RBV劑量為15rag/(kg·d),基因2型和3型的前的各種分型命名法相對應,不僅協(xié)調了以前的分型命名方患者RBV劑量為800mg/d_l2J。不同基因型HCV患者肝臟法,而且可以命名新的型和亞型,因此得到了大多數(shù)學者的的病變程度也不同?;仡櫺匝芯堪l(fā)現(xiàn):1b亞型患者肝臟組認同。不同基因型的全基因組序列差異達30%以上,氨基織學分級、病程進展

5、速度以及平均HCV病毒載量均明顯高酸序列差異達25%~30%。同一基因型中不同亞型間的同于2型,lb亞型會引起較強的肝壞死炎癥和肝纖維化。因源性在70%~85%,大于85%歸為同一株。根據(jù)HCV基因此,HCV基因分型的檢測對控制丙型肝炎的傳播、提高丙型組高突變區(qū)(HVR)的變異,還可以把HCV分為許多準種,肝炎的治療效果非常重要。病毒在感染者體內一般以多個準種的形式共存。2HCV基因型分子學檢測方法1.2HCV基因型分布目前HCV主要有6種基因型,8O多個亞型。1、2、3型呈全球分布,在美國、歐洲、日本及中2.1直接測序分析法通過聚合酶鏈式

6、反應(PCR)擴增國,70%以上的HCV為1b型,主要由血液傳播。2a及2b型HCV基因組有代表性的片段(如E1、NS5b、C區(qū)),再進行核占HCV感染患者的10%一30%,在北美、歐洲及日本也很普苷酸序列測定,直接測序后與GenBank中已上傳的基因序列遍;2e型主要發(fā)現(xiàn)于意大利北部地區(qū)。3型主要在印度及南進行序列比對后,描繪出系統(tǒng)進化樹,根據(jù)進化距離及種系非地區(qū)流行,歐洲及美國的毒品靜脈注射者中也比較常見。關系確定HCV的基因型。目前為HCV基因分型方法中最4型主要分布于非洲及地中海北部國家如埃及。南非發(fā)現(xiàn)經典、最準確的方法,是HCV基

7、因分型的“金標準”。由基因5型,基因6型主要在中國香港及東南亞地區(qū)流行。于測序分析法所擴增的基因組具有高異質性,能準確區(qū)分出亞型,因此許多其他分型方法都將序列分型作為參考標準。基金項目:沈陽市科技計劃項目(F12—193—9—27)該方法所獲的序列信息最多,可以明確被測區(qū)域的多態(tài)性,作者單位:中國醫(yī)科大學附屬盛京醫(yī)院感染科,沈陽110004并能發(fā)現(xiàn)新的基因型,但又因為這些區(qū)域序列變異大,導致通信作者:張琳,電子信箱:zhangl@一hospita1.org有時不能成功進行逆轉錄PCR(1iT—PCR)和測序。而且該測ChineseJourn

8、alofPracticalImemalMedicineAug.2014Vo1.34No.8序法操作繁瑣、工序復雜,只能在有限范圍內應用,難以對較過LIPA條帶放射自顯影就能檢測H

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