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《丙型肝炎病毒基因分型檢測(cè)方法研究進(jìn)展-論文.pdf》由會(huì)員上傳分享,免費(fèi)在線閱讀,更多相關(guān)內(nèi)容在行業(yè)資料-天天文庫(kù)。
1、2014年8月第34卷第8期中國(guó)實(shí)用內(nèi)科雜志819綜述丙型肝炎病毒基因分型檢測(cè)方法研究進(jìn)展周一萌,竇曉光,張琳O0l:10.7504/nI(2014070703中圖分類號(hào):R512.6+3文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A關(guān)鍵詞:丙型肝炎病毒;基因型Keywords:hepatitisCvirus;genotype丙型肝炎病毒(HCV)是引起慢性肝病的主要病原之我國(guó)慢性丙型肝炎患者基因亞型分布總體上以1b亞型一,屬黃病毒科,基因組為單股正鏈RNA,全基因組約為主,2a亞型其次,但是存在地區(qū)差異性。2002年Chen9.6kb。目前全世界HCV感染者很可能已超過
2、2.0等73、2005年Lu等以及Dong等研究顯示,1b型仍為億。我國(guó)人群抗HCV陽(yáng)性率為3.2%,約有近4千萬(wàn)感染我國(guó)HCV流行的主要基因型,1型和2型在年老的患者中較者。大部分HCV感染轉(zhuǎn)為慢性感染,其中20%慢性丙型多,而3型和6a型在年輕人中較多。HCV基因型地區(qū)分布肝炎患者發(fā)展為肝硬化,另外20%進(jìn)展為肝細(xì)胞癌。HCV不是固定不變的,影響因素有人群的流動(dòng)、靜脈吸毒者增加、基因分型與病程發(fā)展和干擾素治療應(yīng)答有密切的關(guān)系J,因血液透析等治療措施的普及以及使用檢測(cè)方法的不同。比此,HCV基因分型的檢測(cè)對(duì)控制丙型肝炎的傳播、提高丙型如由
3、于人口的流動(dòng),西南邊境地區(qū)6a型已取代2a型成為第肝炎的治療效果非常重要。本文將對(duì)HCV基因分型檢測(cè)方二流行基因型j。法研究現(xiàn)狀做一綜述。1.3HCV基因型的臨床意義歐洲肝病學(xué)會(huì)診療指南指出,HCV基因1型患者,經(jīng)標(biāo)準(zhǔn)劑量的聚乙二醇干擾素1HCV基因型的研究現(xiàn)狀(PEG—IFN)聯(lián)合利巴韋林(RBV)治療48周后,40%~54%1.1HCV基因分型1993年Simmonds等。通過比較不同的患者獲得SVR。HCV基因2型或3型患者,經(jīng)標(biāo)準(zhǔn)劑量的HCV毒株編碼非結(jié)構(gòu)蛋白5(NS5)區(qū)域的核苷酸序列,進(jìn)行PEG—IFN聯(lián)合RBV治療24周后,6
4、5%~82%的患者獲得系統(tǒng)進(jìn)化分析,按照發(fā)現(xiàn)的先后順序?qū)CV分為1—6型,SVR。不同基因型利巴韋林的治療劑量也不同,基因l、4、5、每個(gè)型下面有若干亞型,以a、b、c等表示。該分型法能與先6型患者的RBV劑量為15rag/(kg·d),基因2型和3型的前的各種分型命名法相對(duì)應(yīng),不僅協(xié)調(diào)了以前的分型命名方患者RBV劑量為800mg/d_l2J。不同基因型HCV患者肝臟法,而且可以命名新的型和亞型,因此得到了大多數(shù)學(xué)者的的病變程度也不同?;仡櫺匝芯堪l(fā)現(xiàn):1b亞型患者肝臟組認(rèn)同。不同基因型的全基因組序列差異達(dá)30%以上,氨基織學(xué)分級(jí)、病程進(jìn)展
5、速度以及平均HCV病毒載量均明顯高酸序列差異達(dá)25%~30%。同一基因型中不同亞型間的同于2型,lb亞型會(huì)引起較強(qiáng)的肝壞死炎癥和肝纖維化。因源性在70%~85%,大于85%歸為同一株。根據(jù)HCV基因此,HCV基因分型的檢測(cè)對(duì)控制丙型肝炎的傳播、提高丙型組高突變區(qū)(HVR)的變異,還可以把HCV分為許多準(zhǔn)種,肝炎的治療效果非常重要。病毒在感染者體內(nèi)一般以多個(gè)準(zhǔn)種的形式共存。2HCV基因型分子學(xué)檢測(cè)方法1.2HCV基因型分布目前HCV主要有6種基因型,8O多個(gè)亞型。1、2、3型呈全球分布,在美國(guó)、歐洲、日本及中2.1直接測(cè)序分析法通過聚合酶鏈?zhǔn)?/p>
6、反應(yīng)(PCR)擴(kuò)增國(guó),70%以上的HCV為1b型,主要由血液傳播。2a及2b型HCV基因組有代表性的片段(如E1、NS5b、C區(qū)),再進(jìn)行核占HCV感染患者的10%一30%,在北美、歐洲及日本也很普苷酸序列測(cè)定,直接測(cè)序后與GenBank中已上傳的基因序列遍;2e型主要發(fā)現(xiàn)于意大利北部地區(qū)。3型主要在印度及南進(jìn)行序列比對(duì)后,描繪出系統(tǒng)進(jìn)化樹,根據(jù)進(jìn)化距離及種系非地區(qū)流行,歐洲及美國(guó)的毒品靜脈注射者中也比較常見。關(guān)系確定HCV的基因型。目前為HCV基因分型方法中最4型主要分布于非洲及地中海北部國(guó)家如埃及。南非發(fā)現(xiàn)經(jīng)典、最準(zhǔn)確的方法,是HCV基
7、因分型的“金標(biāo)準(zhǔn)”。由基因5型,基因6型主要在中國(guó)香港及東南亞地區(qū)流行。于測(cè)序分析法所擴(kuò)增的基因組具有高異質(zhì)性,能準(zhǔn)確區(qū)分出亞型,因此許多其他分型方法都將序列分型作為參考標(biāo)準(zhǔn)。基金項(xiàng)目:沈陽(yáng)市科技計(jì)劃項(xiàng)目(F12—193—9—27)該方法所獲的序列信息最多,可以明確被測(cè)區(qū)域的多態(tài)性,作者單位:中國(guó)醫(yī)科大學(xué)附屬盛京醫(yī)院感染科,沈陽(yáng)110004并能發(fā)現(xiàn)新的基因型,但又因?yàn)檫@些區(qū)域序列變異大,導(dǎo)致通信作者:張琳,電子信箱:zhangl@一hospita1.org有時(shí)不能成功進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄PCR(1iT—PCR)和測(cè)序。而且該測(cè)ChineseJourn
8、alofPracticalImemalMedicineAug.2014Vo1.34No.8序法操作繁瑣、工序復(fù)雜,只能在有限范圍內(nèi)應(yīng)用,難以對(duì)較過LIPA條帶放射自顯影就能檢測(cè)H