第二章_基因工程的酶學(xué)基礎(chǔ).ppt

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1、生命科學(xué)學(xué)院第二章基因工程的酶學(xué)基礎(chǔ)基因工程的操作,是在分子水平上的操作,是依賴(lài)一些酶(如限制性核酸內(nèi)切酶,連接酶,DNA聚合酶等)作為工具對(duì)基因進(jìn)行人工切割,拼接和擴(kuò)增等操作。所以把這些酶稱(chēng)之為“工具酶”。生命科學(xué)學(xué)院生命科學(xué)學(xué)院第二章 基因工程的酶學(xué)基礎(chǔ)第一節(jié) 限制性核酸內(nèi)切酶第二節(jié)DNA連接酶第三節(jié)DNA聚合酶和反轉(zhuǎn)錄酶第四節(jié)DNA修飾酶第五節(jié) 外切核酸酶第六節(jié) 單鏈內(nèi)切核酸酶第七節(jié)RNA酶生命科學(xué)學(xué)院本章重點(diǎn)掌握的內(nèi)容限制性核酸內(nèi)切酶、同裂酶、同尾酶、星星活性。II型限制性核酸內(nèi)切酶命名原則、操作注意事項(xiàng)及產(chǎn)生星活性的原因、影響酶活性的因素。DNA聚合酶的種類(lèi)及性質(zhì)其它常用工具酶的功

2、能及其用途。生命科學(xué)學(xué)院第一節(jié)限制性核酸內(nèi)切酶任何一種生物體都存在防御外界物質(zhì)進(jìn)入的機(jī)制限制/修飾系統(tǒng)(R-M,Restriction-modificationsystem)生命科學(xué)學(xué)院第一節(jié)限制性核酸內(nèi)切酶大腸桿菌B大腸桿菌K修飾的phageλ(B)EOP=10-4(限制作用)EOP=10-4(限制作用)EOP=1(修飾作用)修飾的phageλ(K)人們發(fā)現(xiàn)侵染大腸桿菌的噬菌體都存在著一些功能性障礙。即所謂的寄主控制的限制與修飾現(xiàn)象簡(jiǎn)稱(chēng)(R/M體系)。細(xì)菌的R/M體系類(lèi)似于免疫系統(tǒng),能辨別自身的DNA與外來(lái)的DNA,并能使后者降解掉。一、寄主的限制與修飾現(xiàn)象EOP???Efficiency

3、?of?plate成斑率生命科學(xué)學(xué)院第一節(jié)限制性核酸內(nèi)切酶生命科學(xué)學(xué)院第一節(jié)限制性核酸內(nèi)切酶一、寄主的限制與修飾現(xiàn)象限制(restriction):指一定類(lèi)型的細(xì)菌可以通過(guò)限制酶的作用,破壞入侵的噬菌體DNA,導(dǎo)致噬菌體的寄主幅度受到限制。限制作用:實(shí)際就是限制性?xún)?nèi)切酶降解外源DNA,維護(hù)宿主遺傳穩(wěn)定的保護(hù)機(jī)制。生命科學(xué)學(xué)院第一節(jié)限制性核酸內(nèi)切酶一、寄主的限制與修飾現(xiàn)象修飾(modification):指寄主本身的DNA,由于在合成后通過(guò)甲基化酶的作用得以甲基化,使DNA得以修飾,從而免遭自身限制性酶的破壞。修飾作用:宿主細(xì)胞通過(guò)甲基化作用達(dá)到識(shí)別自身遺傳物質(zhì)和外來(lái)遺傳物質(zhì)的目的。生命科學(xué)學(xué)

4、院第一節(jié)限制性核酸內(nèi)切酶一、寄主的限制與修飾現(xiàn)象1968Linn和Arber從E.coliB中發(fā)現(xiàn)限制酶Ⅰ1970Smith(美)在流感嗜血桿菌發(fā)現(xiàn)限制酶Ⅱ1978W.Arber,H.O.Smith,Nathans因發(fā)現(xiàn)限制性?xún)?nèi)切酶及對(duì)其功能研究的突出貢獻(xiàn)獲得諾貝爾生物醫(yī)學(xué)獎(jiǎng)生命科學(xué)學(xué)院第一節(jié)限制性核酸內(nèi)切酶一、寄主的限制與修飾現(xiàn)象寄主控制的限制與修飾的作用一是保護(hù)自身的DNA不受限制;二是破壞外源DNA使之迅速降解?;蚬こ讨?,應(yīng)采用缺少限制作用的菌株作為受體。生命科學(xué)學(xué)院第一節(jié)限制性核酸內(nèi)切酶二、限制性?xún)?nèi)切酶的類(lèi)型限制性核酸內(nèi)切酶(限制性酶):在細(xì)胞內(nèi)能夠識(shí)別雙鏈DNA分子中的特定核苷酸

5、序列,并對(duì)DNA分子進(jìn)行切割的一種酶。據(jù)限制性核酸內(nèi)切酶的識(shí)別切割特性、催化條件及是否具有修飾酶活性,可分為Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ型。主要特性Ⅰ型Ⅱ型Ⅲ型限制修飾蛋白結(jié)構(gòu)輔助因子識(shí)別序列切割位點(diǎn)雙功能(具甲基化)異源三聚體ATPMg2+SAM距識(shí)別序列1kb處隨機(jī)性切割單一功能同源二聚體Mg2+4-6bp回文序列識(shí)別序列內(nèi)或附近特異切割雙功能(具甲基化)異源二聚體ATPMg2+距識(shí)別序列下游24-26bp處隨機(jī)性切割基因工程中使用注:SAM為S-腺苷甲硫氨酸生命科學(xué)學(xué)院第一節(jié)限制性核酸內(nèi)切酶1.I型限制性?xún)?nèi)切酶首先由M.Meselson和R.Yuan在1968年從大腸桿菌B株和K株分離的。如EcoB

6、和EcoK。(1)識(shí)別位點(diǎn)序列未甲基化修飾的特異序列。EcoB:TGA(N)8TGCTEcoK:AAC(N)6GTGC生命科學(xué)學(xué)院第一節(jié)限制性核酸內(nèi)切酶(2)切割位點(diǎn)在距離特異性識(shí)別位點(diǎn)約1000—1500bp處隨機(jī)切開(kāi)一條單鏈。(3)作用機(jī)理需ATP、Mg2+和SAM(S-腺苷蛋氨酸)。Recognizesitecut1-1.5kb生命科學(xué)學(xué)院第一節(jié)限制性核酸內(nèi)切酶2.II類(lèi)限制性?xún)?nèi)切酶首先由H.O.Smith和K.W.Wilcox在1970年從流感嗜血菌中分離出來(lái)。分離的第一個(gè)酶是HindⅡ(1)識(shí)別位點(diǎn)序列未甲基化修飾的雙鏈DNA上的特殊靶序列(多數(shù)是回文序列),與DNA的來(lái)源無(wú)關(guān)。A

7、BCC’B’A’A’B’C’CBAA’B’N’BAABNB’A’或生命科學(xué)學(xué)院第一節(jié)限制性核酸內(nèi)切酶(2)切割位點(diǎn)識(shí)別位點(diǎn)處。切開(kāi)雙鏈DNA。形成粘性末端(stickyend)或平齊末端(bluntend)。如:EcoRI5’-G?AATTC-3’3’-CTTAA?G-5’PstI5’-CTGCA?G-3’3’-G?ACGTC-5’產(chǎn)生粘性末端EcoRV5’-GAT?ATC-3’3’-CTA?TAG-5’產(chǎn)生

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