瀕危藥用植物盤龍參rdnaits序列分析

瀕危藥用植物盤龍參rdnaits序列分析

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1、—30—江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué)2014年第42卷第5期李家敏,周秀玲,姜瓊.瀕危藥用植物盤龍參rDNAITS序列分析[J].江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué),2014,42(5):30-33.瀕危藥用植物盤龍參rDNAITS序列分析李家敏,周秀玲,姜瓊(宜春學(xué)院化學(xué)與生物工程學(xué)院,江西宜春336000)摘要:采用改良CTAB法提取2份江西省盤龍參總DNA,利用通用引物對rDNAITS序列進行PCR擴增,克隆后測序,應(yīng)用MEGA5.2軟件進行序列分析和構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,以研究盤龍參ITS片段遺傳多樣性,分析該片段在盤龍參DNA分子鑒別和綬草屬植物

2、系統(tǒng)學(xué)研究中的意義。結(jié)果表明,盤龍參樣本的rDNAITS長度為766~767bp;該樣本與GenBank中綬草屬的rDNAITS對比分析,ITS1、ITS2長度分別為214~245、256~367bp,變異位點分別為16.17%、3.50%,ITS總變異位點為9.27%;基于ITS序列,用p-distances法計算遺傳距離和NJ法建立系統(tǒng)發(fā)育樹,2段序列在綬草屬種內(nèi)保守,中間有較大變異,可作為盤龍參分子鑒定標(biāo)記,而綬草屬的系統(tǒng)發(fā)生關(guān)系尚須進一步研究。關(guān)鍵詞:綬草屬;盤龍參;ITS序列;遺傳多態(tài)性;藥用植物中圖分

3、類號:S567.230.1文獻標(biāo)志碼:A文章編號:1002-1302(2014)05-0030-04盤龍參為蘭科綬草屬植物綬草[Spiranthessinensis1材料與方法(Pers.)Ames]的根或全草,為多年生草本植物,以全草入藥,味甘,性溫,入肺、肝、腎三經(jīng),具有滋陰益氣、涼血解毒、潤肺1.1材料[1]止咳的功效,主要含有二氫菲類、黃酮類、苯丙素類、甾醇1.1.1試驗材料2013年3月,于江西宜春和贛州2個不類、三萜類和脂肪酸等多種化學(xué)成分,屬于名貴藥材,具有較同生態(tài)群采集樣本,經(jīng)課題組周秀玲副教授鑒

4、別為蘭科綬草高的藥用價值。Peng等在盤龍參根中發(fā)現(xiàn)一種新的二氫黃屬植物盤龍參,樣本憑證保存于江西省天然藥物活性成分研酮,對肺癌細胞A549、肝癌細胞BEL27402、食管癌細胞究重點實驗室。來源于Genbank的綬草屬rDNAITS序列相HT-29、乳腺癌細胞MCF-7、胃癌細胞SGC-7901、白血病關(guān)信息見表1。[2]細胞K562和腎癌細胞A498等多種癌細胞具有一定毒性。表1來源于GenBank的綬草屬rDNAITS序列盤龍參現(xiàn)為國家二級保護植物,已列入《瀕危野生動植登錄號物種來源地發(fā)布者[3]物種國際貿(mào)

5、易公約》,為國際瀕危植物。董必慧等對江蘇AJ539489Spiranthescernua美國Salazar沿海灘涂濕地的盤龍參資源進行調(diào)查,并提出有關(guān)盤龍參資AF301443Spiranthesdiluvialis美國Szalanski[4]。筆者在江西宜春和贛州調(diào)查時發(fā)現(xiàn)野生HE575517Spiranthesnebulorum美國Szalanski源保護的策略AF301441Spiranthesromanzoffiana美國Szalanski種盤龍參零星分布,對其采樣進行馴化,在種植過程中發(fā)現(xiàn)盤HE57551

6、8Spiranthessinensis美國Szalanski龍參種子萌發(fā)率低,長勢弱,成活極少,且植株結(jié)實不飽滿,明AY364888Spiranthesspiralis西班牙Bernardos顯不如野外生長旺盛。對采樣進行回訪,采樣點的盤龍參數(shù)AB740173Spiranthessinensisvar.a(chǎn)moena日本Ohga量變少或不見蹤跡,這對盤龍參的遺傳多樣性研究造成困難。AB740174Spiranthessinensisvar.a(chǎn)moena日本Ohga物種的瀕危與其遺傳結(jié)構(gòu)和遺傳多樣性有關(guān),遺傳多樣AB

7、740175Spiranthessinensisvar.sinensis日本OhgaAB740176Spiranthessinensisvar.sinensis日本Ohga性的高低是物種生存能力的具體體現(xiàn)。目前,在研究遺傳結(jié)構(gòu)方面常采用DNA分子標(biāo)記技術(shù),rDNAITS序列分析技術(shù)1.1.2主要儀器超低溫冰箱(7010702,Thermo);水浴鍋是其中之一。rDNAITS序列是核糖體內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū),位于(HH-4);離心機(Eppendorf-G5415R,德國);XP基因擴增18S和26SrDNA基因之間,包括

8、了ITS1-5.8SrDNA-ITS2儀(BYQ602101-174,杭州博日);雙穩(wěn)定時電泳儀(DYY-區(qū)段,具有較好的保守性。本研究首次通過rDNAITS序列的6C,北京六一);紫外分光光度計(UV-2000);凝膠成像系統(tǒng)遺傳分析為盤龍參種間鑒定和種內(nèi)遺傳多樣性提供生物學(xué)理(GelMediaSystem,北京創(chuàng)美偉業(yè))。論依據(jù),并根據(jù)序列堿基差異、G+C含量差異和片

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