絨山羊骨骼肌高肉堿相關(guān)基因的篩選

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1、分類號(hào)Ｓ８．１３；；學(xué)校代碼１０１２９ｔｏｅ６３６學(xué)號(hào)２０１２２０１０１１嗦乂肇碩±學(xué)位論文絨山羊骨骼肌高肉堿相關(guān)基因的歸選Ｓｃｒｅｅ口ｉｎｇＧｅｎｅｓ民ｅｌａｔｅｄｔｏＨｉｇｈＣｏｎｔｅｎｔｏｆＣａｍ沾ｎｅｉｎＳｋｅｌｅｔａｌＭｕｓｃｌｅｉｎＣａｓｈｍｅｒｅＧｏａｔ申請(qǐng)人：王靜學(xué)科口類：農(nóng)學(xué)學(xué)科專業(yè)：動(dòng)物遺傳育種與繁遺研究方向：數(shù)量基因組學(xué)暨性狀遺傳原理指導(dǎo)教師：李金泉教授張文廣教授—論文提交日期：二〇五年六月；內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)研

2、究生學(xué)位論文獨(dú)創(chuàng)聲明，本人申明所呈交的學(xué)位論文是我本人在導(dǎo)師指導(dǎo)下進(jìn)行的研究工作及取得的研究成果。據(jù)我所知，除了文中特別加標(biāo)注和致謝的地方外，論文中不包括其他人己經(jīng)發(fā)表或撰寫過的研究成果，也不包一括為獲得我?；蚱渌逃龣C(jī)構(gòu)的學(xué)位或證書而使用過的材料，與我同工作的同志對(duì)本研究所做的任何貢獻(xiàn)均已在論文中作了明確的說明并表示謝意。一申請(qǐng)學(xué)位論文與資料若有不實(shí)之處，本人承擔(dān)切相關(guān)責(zé)任。論文作者簽名：ｊ－日期：乂乂．掙Ｙ義內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)研究生學(xué)位論文版權(quán)使用授權(quán)書本人完全了解內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)

3、大學(xué)有關(guān)保護(hù)知識(shí)產(chǎn)權(quán)的規(guī)定，即；研究生在攻讀學(xué)位期間論文工作的知識(shí)產(chǎn)權(quán)單位屬內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)。本人保證畢業(yè)離校后，發(fā)表論文或使用論文工作成果時(shí)署名單位為巧蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)，且導(dǎo)師為通訊作者，通訊作者單位亦署名為內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)。學(xué)校有權(quán)保留并向國家有關(guān)部口或機(jī)構(gòu)送交論文的復(fù)印件和電子文檔，允許論文被査闊和借閱。學(xué)?？桑坠紝W(xué)位論文的全部或部分內(nèi)容（保密內(nèi)容除外），采用影印、縮印或其他手段保存論文。論文作者簽名：么命指導(dǎo)教師簽名：Ｊ日期：如摘要以肉堿是人體必需營養(yǎng)素，且可用作減肥的

4、保健品。內(nèi)蒙古絨山羊肌肉中肉堿含量較其他動(dòng)物髙，而且目前沒有關(guān)于不同部位肌肉中肉減含量情況的研究，也不清楚調(diào)控肉堿含量的相關(guān)基因。因此，找出調(diào)控肉堿含量的基因，對(duì)于今后有關(guān)肉堿的研巧及羊肉精細(xì)分割出售具有重要意義。本研巧Ｗ內(nèi)蒙古絨山羊?yàn)檠芯繉?duì)象，利用髙效－液相色譜法（ＨＰＬＣ）測定了絨山羊不同部位肌肉組織中總?cè)鈮A含量，通進(jìn)ＲＮＡＳｅｑ技術(shù)對(duì)肉堿含量較髙的股四頭肌，＾及肉堿含量較低的股二頭?。郏?；及也臟轉(zhuǎn)錄組文庫進(jìn)行高通量測序，對(duì)差異基因進(jìn)行功能注釋和富集性分析，將肉堿相關(guān)基因與差異基一因中結(jié)合篩

5、選出絨山羊骨骼肌髙肉堿含量的候選基因，從而為進(jìn)步研巧絨山羊骨骼肌肉堿含量提供研究依據(jù)與思路，為實(shí)現(xiàn)絨山羊肉類精細(xì)分割，為給企業(yè)創(chuàng)造更大的利潤提供可能。本研巧主要研巧結(jié)果如下：１、利用ＨＰＬＣ測定了絨山羊１２個(gè)不同部位肌肉總?cè)鈮A含量。其中骨骼肌肉堿含、￣－ｍ屯?。ǎ戳浚ǎ保玻埃常担常保玻常保担常纾耄纾┱w高于１３．４５４７９．４５ｍｇ／ｋｇ）；骨骼肌中半膜?。崳姾孔罡撸伤念^肌次之，股二頭肌最低；總體上肉堿含量為：后腿肌肉＞肩背部?。崳娙猓荆犌巴燃∪?。２、成功構(gòu)建了內(nèi)蒙古絨山羊股二頭肌、股四頭肌和

6、也臟轉(zhuǎn)錄姐文庫，利用ＲＮＡ－Ｓ進(jìn)行髙通量測序Ｈａｔ軟件比對(duì)巧技術(shù)，得到７．２ＧＢ原始測序數(shù)據(jù)。通過Ｔｏｐ分二二、，１８６４析得出股頭肌與股四頭肌差昇表達(dá)基因共個(gè)；股頭肌與屯臟差異表達(dá)基因共９９３個(gè)；股四頭肌與也臟差異表達(dá)基因共２７７０個(gè)。３、差異表達(dá)基因ＧＯ功能注釋結(jié)果表明：羞異基因主要與肌肉發(fā)育、葡萄糖代謝、ＡＴＰ代謝、氧化磯酸化、泛素化、襄泡介導(dǎo)的轉(zhuǎn)運(yùn)和線粒體相關(guān)ＫＥＧＧ通路富；集分析表明：差異基因主要參與ＰＰＡＲ信號(hào)通路、膜島素信號(hào)通路和ＭＡＰＫ信號(hào)通路。４、結(jié)合Ｇｅｎｅｏｎｔｏｌｏｇ

7、ｙ網(wǎng)站上的肉堿相關(guān)基因，篩選出絨山羊骨骼肌髙肉堿含量、的９個(gè)候選基因，分別為；ＰＤＺＫ１ＣＤＶ３、ＡＣＡＤＬ、ＰＲＫＡＡ２、ＰＲＫＡＢ２、ＭＯＢＡＴ１、ＮＡＴ６、ＰＬＡ２Ｇ１５和ＨＲＡＳＬＳ。５、進(jìn)化樹分析可知：ＰＤＺＫ１、ＣＤＶ３、ＡＣＡＤＬ、ＰＲＫＡＡ２、ＭＯＢＡＴ１、ＰＬＡ２Ｇ１５和ＨＲＡＳＬＳ在山羊、綿羊和牛，大鼠和小鼠中同源性高，且保守性強(qiáng)；山羊ＰＲＫＡＢ２與其他物種同源性低且變異大；雞的ＰＤＺＫ１、ＣＤＶ３、ＰＲＫＡＡ２、ＰＲＫＡＢ２、ＭＯＢＡＴ１、ＰＬＡ２Ｇ１５和ＨＲＡＳＬＳ基

8、因與其他物種的同源性均較低。－：絨山羊ＲＮＡＳｅ二頭肌關(guān)鍵詞；肉堿；股四頭肌也臟；ｑ；股；ＳｃｒｅｅｎｉｎｇＧｅｎｅｓ民ｅｌａｔｅｄｔ：ｏＨｉｈＣｏｎｔｅｎｔｏｆＣａｒｎｉｔｉｎｅｉｎＳｋｅｌｅｔａｌｇＭｕｓｃｌｅｉｎＣａｓｈｍｅｒｅＧｏａｔＡｂｓｔｒａｃｔＬ