抗原表位研究方法進(jìn)展

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1、抗原表位研究方法進(jìn)展宋帥，李春玲，賈愛(ài)卿，楊冬霞，李淼(廣東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院獸醫(yī)研究所廣東省獸醫(yī)公共衛(wèi)生實(shí)驗(yàn)室，廣東廣州510640)摘要：抗原表位是抗原分子中的主要功能單位，能有效刺激機(jī)體的細(xì)胞免疫和體液免疫。隨著免疫學(xué)和生物信息學(xué)技術(shù)的不斷發(fā)展，用于研究T細(xì)胞表位和B細(xì)胞表位的方法得到了很大的提高。論文中概述了近幾年用于研究T細(xì)胞表位的預(yù)測(cè)方法和鑒定方法，以及在B細(xì)胞表位研究中所用的表位肽掃描技術(shù)、蛋白質(zhì)“切割”法、噬菌體展示技術(shù)、x一衍射與核磁共振、表位預(yù)測(cè)方法等技術(shù)，并對(duì)每種研究方法進(jìn)行了比較，為從事抗原表位研究的人員提供參考，從而更有利于表位肽疫苗的研制和診斷方法的建

2、立。關(guān)鍵詞：T細(xì)胞表位；B細(xì)胞表位；預(yù)測(cè)；鑒定中圖分類號(hào)：$852．4文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼：A文章編號(hào)：i007—5038(2010)12-0087—05抗原表位又稱抗原決定簇，是指抗原分子表面用的人工疫苗以及免疫干預(yù)治療等具有重要意義。具有特殊結(jié)構(gòu)和免疫活性的化學(xué)基團(tuán)，具有刺激機(jī)1T細(xì)胞表位的研究方法體產(chǎn)生抗體或致敏淋巴細(xì)胞并能夠被其識(shí)別的一個(gè)T細(xì)胞表位是抗原蛋白中經(jīng)抗原遞呈細(xì)胞(an—免疫活性區(qū)。根據(jù)抗原表位特異性免疫應(yīng)答的程tigenpresentingcell，APC)處理，由主要組織相溶度，可將抗原表位分為免疫優(yōu)勢(shì)表位、亞優(yōu)勢(shì)表位和性復(fù)合物(majorhistocompat

3、ibilitycomplex，隱性表位。根據(jù)與抗原受體結(jié)合細(xì)胞的不同，分為MHC)分子遞呈給T淋巴細(xì)胞受體的多肽片段。主B細(xì)胞抗原表位和T細(xì)胞抗原表位；其中B細(xì)胞抗要涉及細(xì)胞毒性T細(xì)胞(cytotoxicTcell，CTL)抗原表位則往往為親水性肽段，一般位于抗原三維大原表位和輔助性T細(xì)胞(helperTcell，Th)抗原表分子的氨基酸長(zhǎng)鏈折疊處[1]，而T細(xì)胞抗原表位往位的研究，其中CTL抗原表位與MHCI類分子親往僅為埋藏在蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)內(nèi)部的疏水性肽和肽相關(guān)，Th抗原表位與MHCⅡ類分子的親和肽段L2]。根據(jù)表位對(duì)機(jī)體的影響，可分為保護(hù)性表位相關(guān)。所以對(duì)T細(xì)胞表位的

4、篩選主要基于候選肽(免疫位)、致病性表位(變應(yīng)位)和耐受性表位(耐受能否和MHC分子結(jié)合。與MHC工類分子結(jié)合的位)。按抗原表位結(jié)構(gòu)的不同分為連續(xù)性抗原表位多肽長(zhǎng)度通常為8個(gè)～11個(gè)氨基酸，一般為9個(gè)，和非連續(xù)性抗原表位，前者又稱線型表位，是由肽鏈在序列特定位置上有錨點(diǎn)存在。而MHCI1分子親上順序連續(xù)的氨基酸組成，后者又稱構(gòu)象型表位，是和肽長(zhǎng)度可達(dá)3O個(gè)氨基酸以上，其結(jié)合基序存在不由那些空間鄰近但順序上不連續(xù)的氨基酸組成。線同程度的退化[5]。隨著免疫學(xué)和生物信息學(xué)技術(shù)的型表位見(jiàn)于T細(xì)胞表位和部分B細(xì)胞表位，構(gòu)象型不斷發(fā)展，對(duì)T細(xì)胞表位的研究主要有以下幾種方表位只見(jiàn)于B細(xì)

5、胞表位]。在機(jī)體的免疫系統(tǒng)中，法。免疫細(xì)胞通常難以借助其表面受體識(shí)別整個(gè)蛋白質(zhì)1．1合成肽法分子，僅識(shí)別抗原分子上的抗原決定簇，也就是說(shuō)抗在機(jī)體的免疫系統(tǒng)中，T細(xì)胞主要識(shí)別抗原分體的特異性是針對(duì)抗原表位而不是針對(duì)完整的抗原子上的線型表位。所以根據(jù)抗原蛋白質(zhì)分子的氨基分子的_4]。表位一般只占5個(gè)～7個(gè)氨基酸或單糖酸序列隨機(jī)合成或連續(xù)合成一個(gè)或幾個(gè)重疊氨基酸殘基的大小，最多不超過(guò)20個(gè)氨基酸殘基?？乖淼囊幌盗须亩危缓笸ㄟ^(guò)多肽活性的檢測(cè)實(shí)驗(yàn)進(jìn)一位是蛋白質(zhì)抗原性的基礎(chǔ)，所以深入研究蛋白質(zhì)抗步確定T細(xì)胞表位。此方法鑒定的T細(xì)胞表位較原表位對(duì)疾病的診斷及預(yù)后判定，定點(diǎn)改造蛋白質(zhì)可

6、靠，且能發(fā)現(xiàn)一些不符合多肽結(jié)合基序(motif)的分子以降低蛋白質(zhì)藥物的免疫原性，設(shè)計(jì)無(wú)毒副作MHC結(jié)合抗原肽。GernerW等將口蹄疫病毒結(jié)收稿日期：2010—05—18基金項(xiàng)目：廣東省農(nóng)業(yè)攻關(guān)項(xiàng)目(2OO7AO2o3O。OO5一l1)作者簡(jiǎn)介：宋帥(1982一)．男，河南汝州人，研究實(shí)習(xí)員．碩士，主要從事動(dòng)物疫病及綜合防控技術(shù)研究。*通訊作者88動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展2010年第3l卷第l2期(總第210期)構(gòu)蛋白分成442段肽段進(jìn)行了淋巴細(xì)胞功能檢測(cè)，式識(shí)別和分類工具。其優(yōu)勢(shì)在于無(wú)需用特定方法確最終確定了在VP1上第66位～第8o位氨基酸組定網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)，因此支持向量機(jī)器法的算法也

7、較簡(jiǎn)單。成的肽段為特異性T細(xì)胞表位。但這種方法工作RyujiIK等口在隱馬爾可夫模型方法的基礎(chǔ)上構(gòu)量大、費(fèi)用高，而且重疊區(qū)之間的表位有可能被忽建了隱馬爾可夫模型，該模型不需要非結(jié)合肽序列略，所以不能夠鑒定出目的蛋白上所有的T細(xì)胞表數(shù)據(jù)，且預(yù)測(cè)準(zhǔn)確度有所提高。除了上述方法外，Le位。DJ等已證明可以利用噬菌體肽庫(kù)展示技術(shù)，在1．2免疫信息學(xué)預(yù)測(cè)法噬菌體表面表達(dá)功能性肽一MHC復(fù)合體，并直接用T細(xì)胞表位的預(yù)測(cè)研究始于對(duì)Th表位的預(yù)T細(xì)胞篩選T細(xì)胞表位的可能性。測(cè)，但對(duì)CTL表位預(yù)測(cè)的探索進(jìn)展最快，研究最深1．3多肽活性