實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)的原理及應(yīng)用RealtimeQuantitativePCR

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1、實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)的原理及應(yīng)用(RealtimeQuantitativePCR)講座提綱實(shí)時(shí)熒光定量PCR原理實(shí)時(shí)熒光定量PCR的幾種方法介紹實(shí)時(shí)熒光定量PCR醫(yī)學(xué)和科研中的應(yīng)用實(shí)時(shí)熒光定量PCR原理實(shí)時(shí)熒光定量PCR的幾種方法介紹實(shí)時(shí)熒光定量PCR醫(yī)學(xué)和科研中的應(yīng)用實(shí)時(shí)熒光定量PCR定義在PCR反應(yīng)體系中加入熒光基團(tuán),利用熒光信號(hào)累積實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)整個(gè)PCR進(jìn)程,最后通過(guò)標(biāo)準(zhǔn)曲線對(duì)未知模板進(jìn)行定量分析的方法實(shí)時(shí)熒光定量PCR原理實(shí)時(shí)原理常規(guī)PCR技術(shù):對(duì)PCR擴(kuò)增反應(yīng)的終點(diǎn)產(chǎn)物進(jìn)行定量和定性分析無(wú)法對(duì)起始模板準(zhǔn)確定量,無(wú)法對(duì)擴(kuò)增反應(yīng)實(shí)時(shí)檢測(cè)實(shí)時(shí)定

2、量PCR技術(shù):利用熒光信號(hào)的變化實(shí)時(shí)檢測(cè)PCR擴(kuò)增反應(yīng)中每一個(gè)循環(huán)擴(kuò)增產(chǎn)物量的變化,通過(guò)Ct值和標(biāo)準(zhǔn)曲線的分析對(duì)起始模板進(jìn)行定量分析實(shí)時(shí)熒光定量PCR原理定量原理介紹三個(gè)概念:擴(kuò)增曲線、熒光閾值、Ct值如何對(duì)起始模板定量?通過(guò)Ct值和標(biāo)準(zhǔn)曲線對(duì)起始模板進(jìn)行定量分析實(shí)時(shí)熒光定量PCR原理-----------擴(kuò)增曲線擴(kuò)增曲線圖:橫坐標(biāo):擴(kuò)增循環(huán)數(shù)(Cycle);縱坐標(biāo):熒光強(qiáng)度每個(gè)循環(huán)進(jìn)行一次熒光信號(hào)的收集熒光基團(tuán)熒光檢測(cè)元件實(shí)時(shí)熒光定量PCR原理-------熒光閾值熒光信號(hào)閾值(threshold):前15個(gè)循環(huán)信號(hào)作為熒光本底信號(hào)(basel

3、ine),即樣本的熒光背景值和陰性對(duì)照的熒光值熒光域值的缺省設(shè)置是3~15個(gè)循環(huán)的熒光信號(hào)的標(biāo)準(zhǔn)偏差的10倍手動(dòng)設(shè)置:原則要大于樣本的熒光背景值和陰性對(duì)照的熒光最高值,同時(shí)要盡量選擇進(jìn)入指數(shù)期的最初階段,并且保證回歸系數(shù)大于0.99真正的信號(hào):熒光信號(hào)超過(guò)域值實(shí)時(shí)熒光定量PCR原理-------Ct值Ct值的定義:PCR擴(kuò)增過(guò)程中,擴(kuò)增產(chǎn)物的熒光信號(hào)達(dá)到設(shè)定的閾值時(shí)所經(jīng)過(guò)的擴(kuò)增循環(huán)次數(shù)C(t)value實(shí)時(shí)熒光定量PCR原理-------Ct值的重現(xiàn)性橫軸:PCR反映循環(huán)數(shù)縱軸:熒光信號(hào)量Ct值的特點(diǎn):相同模板進(jìn)行96次擴(kuò)增,終點(diǎn)處產(chǎn)物量不恒定;

4、Ct值則極具重現(xiàn)性實(shí)時(shí)熒光定量PCR原理---------定量原理理想的PCR反應(yīng):X=X0*2n非理想的PCR反應(yīng):X=X0(1+Ex)nn:擴(kuò)增反應(yīng)的循環(huán)次數(shù)X:第n次循環(huán)后的產(chǎn)物量X0:初始模板量Ex:擴(kuò)增效率實(shí)時(shí)熒光定量PCR原理---------定量原理在擴(kuò)增產(chǎn)物達(dá)到閾值線時(shí):XCt=X0(1+Ex)Ct=M(1)XCt:熒光擴(kuò)增信號(hào)達(dá)到閾值強(qiáng)度時(shí)擴(kuò)增產(chǎn)物的量.在閾值線設(shè)定以后,它是一個(gè)常數(shù),我們?cè)O(shè)為M方程式(1)兩邊同時(shí)取對(duì)數(shù)得:logM=logX0(1+Ex)Ct(2)整理方程式(2)得:logX0=-log(1+Ex)*Ct+lo

5、gM(3)Log濃度與循環(huán)數(shù)呈線性關(guān)系,根據(jù)樣品擴(kuò)增達(dá)到域值的循環(huán)數(shù)即Ct值就可計(jì)算出樣品中所含的模板量實(shí)時(shí)熒光定量PCR原理---------標(biāo)準(zhǔn)曲線模板DNA量越多,熒光達(dá)到域值的循環(huán)數(shù)越少,即Ct值越小Log濃度與循環(huán)數(shù)呈線性關(guān)系,通過(guò)已知起始拷貝數(shù)的標(biāo)準(zhǔn)品可作出標(biāo)準(zhǔn)曲線,根據(jù)樣品Ct值,就可以計(jì)算出樣品中所含的模板量確定未知樣品的C(t)值通過(guò)標(biāo)準(zhǔn)曲線由未知樣品的C(t)值推算出其初始量Sample實(shí)時(shí)熒光定量PCR原理絕對(duì)定量25講座提綱實(shí)時(shí)熒光定量PCR原理實(shí)時(shí)熒光定量PCR的幾種方法介紹實(shí)時(shí)熒光定量PCR實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)及應(yīng)用實(shí)時(shí)熒光定量P

6、CR原理實(shí)時(shí)熒光定量PCR的幾種方法介紹實(shí)時(shí)熒光定量PCR實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)及應(yīng)用非特異性熒光標(biāo)記:1、SYBRGreen特異性熒光標(biāo)記:2、TaqMan3、MolecularBeacon4、Amplisensor實(shí)時(shí)熒光定量PCR原理---------DNA產(chǎn)物的熒光標(biāo)記QQR實(shí)時(shí)熒光定量PCR方法1---------SYBRGreen法SYBRGreenSYBRGreen法工作機(jī)理SYBRGreen能結(jié)合到雙鏈DNA的小溝部位SYBRGreen只有和雙鏈DNA結(jié)合后才發(fā)熒光變性時(shí),DNA雙鏈分開,無(wú)熒光復(fù)性和延伸時(shí),形成雙鏈DNA,SYBRGreen發(fā)

7、熒光,在此階段采集熒光信號(hào)。SYBRGreen實(shí)時(shí)熒光定量PCR原理SYBRGreenI工作原理5’3’5’3’SGNoEmissionSGSGSGExcitationSGSGSGSGSGSGSG5’3’5’3’EmissionExcitation實(shí)時(shí)熒光定量PCR原理SYBRGreenI熔解曲線分析溫度熒光強(qiáng)度TmTm值:DNA解鏈一半時(shí)的溫度實(shí)時(shí)熒光定量PCR原理SYBRGreenI熔解曲線分析將溫度與熒光強(qiáng)度的變化求導(dǎo)。(-dI/dT)-dIdTTmSYBRGreen法融解曲線分析融解曲線分析,單一峰無(wú)非特異性熒光定量準(zhǔn)確融解曲線分析,出現(xiàn)

8、雜峰其他產(chǎn)物出現(xiàn)非特異性熒光,因此定量不準(zhǔn)確非特異性產(chǎn)物CyclenumberFlourescencCk102Ck104SampleCy

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