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《表觀遺傳學(xué)研究方法進(jìn)展.pdf》由會員上傳分享，免費在線閱讀，更多相關(guān)內(nèi)容在行業(yè)資料-天天文庫。
1、生物技術(shù)通報·技術(shù)與方法·BIOTECHNOLOGYBULLETIN2011年第9期表觀遺傳學(xué)研究方法進(jìn)展1．2111．2鄭小國陳亮樓巧君羅利軍12(上海市農(nóng)業(yè)生物基因中心，上海201106;華中農(nóng)業(yè)大學(xué)，武漢430070)摘要:表觀遺傳調(diào)控是基因表達(dá)調(diào)控的重要組成部分，已成為當(dāng)前研究的熱點。目前其研究主要集中在DNA甲基化和組蛋白修飾。針對這兩種表觀修飾，其研究方法也取得了較大進(jìn)展，一方面方法的靈敏度和特異性都在不斷提高;另一方面表觀修飾的檢測正在逐步從定性檢測向定量分析方向發(fā)展，從個別位點向高通量檢測發(fā)展。此外，新一代
2、測序技術(shù)的應(yīng)用將大大推動表觀遺傳研究的發(fā)展，包括單分子實時測序法、單分子納米孔測序法等。綜述目前常用的DNA甲基化、組蛋白修飾研究方法以及最新的單分子測序技術(shù)，并對它們在表觀遺傳修飾檢測中的應(yīng)用作了簡要對比分析。關(guān)鍵詞:表觀遺傳學(xué)DNA甲基化組蛋白修飾限制性內(nèi)切酶酶切法重亞硫酸鹽法染色質(zhì)免疫共沉淀單分子實時測序單分子納米孔測序ResearchMethodProgressofEpigenetics1．2111．2ZhengXiaoguoChenLiangLouQiaojunLuoLijun12(ShanghaiAgrobio
3、logicalGeneCenter，Shanghai201106;HuazhongAgriculturalUniversity，Wuhan430070)Abstract:Epigeneticregulationhasbecomeahotspotinthestudyongeneexpressionregulation．Epigeneticregulationmainlyfo-cusesonDNAmethylationandhistonemodification．Agreatdealoftechniqueshasbeendev
4、elopedtodetecttheseepigeneticmodifica-tionsandgreatprogresseshavealsobeenachievedintermsofdetectionsensitivityandspecificity，qualitativeandquantitativeassay．Thenext-generationsequencingtechnologieswillgreatlypromotethedevelopmentofepigeneticresearchprovidingachanc
5、eforrapidandhighthroughputepigeneticdetection，whichincludethesingle-molecular，real-timesequencing，single-moleculenanoporeDNAse-quencing．Thisreviewintroducedthemostcommonlyusedandnewlydevelopedtechniques，andmadeabriefcommentabouttheirap-plicationsinthedetectionofDN
6、Amethylationandhistonemodification．Keywords:EpigeneticDNAmethylationHistonemodificationRestrictionendonucleaseenzymedigestionBisulfateChromatinimmunoprecipitation(ChIP)Single-molecularreal-timesequencingSingle-moleculenanoporeDNAsequencing表觀遺傳(epigenetic)是指DNA序列不發(fā)
7、生變化和組蛋白共價修飾兩方面?；?，但基因表達(dá)卻發(fā)生了可遺傳的改變。這種改變DNA甲基化(DNAmethylation)是常見的表觀是細(xì)胞內(nèi)除了遺傳信息以外的其他可遺傳物質(zhì)發(fā)生遺傳現(xiàn)象，它是指在DNA甲基轉(zhuǎn)移酶(DNAmethyl-的改變，且這種改變在發(fā)育和細(xì)胞增殖過程中能穩(wěn)transferases，DNMTs)的作用下將甲基添加在DNA［1，2］定遺傳。分子中的堿基上。常見的DNA甲基化發(fā)生在DNA表觀遺傳學(xué)的現(xiàn)象很多，DNA甲基化(DNA鏈上的胞嘧啶(C)第5位碳原子和甲基間的共價結(jié)［5，6］methylation)、組
8、蛋白修飾(histonemodification)、基合形成5甲基胞嘧啶(5mC)。除此以外，在腺因組印記(genomicimprinting)、RNA編輯(RNAedi-嘌呤(A)N6位置可以引入一個甲基形成N6甲基腺ting)、基因沉默、核仁顯性、休眠轉(zhuǎn)座子激活和性別嘌呤(N6-mA)。在真核生物中
