DB22T 1608-2012 牛病毒性腹瀉粘膜病病毒熒光RT-PCR檢測方法

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1、ICS65.020.30B41備案號:35742-2013DB22吉林省地方標(biāo)準(zhǔn)本標(biāo)準(zhǔn)僅供內(nèi)部使用不得翻印DB22/T1608—2012牛病毒性腹瀉/粘膜病病毒熒光RT-PCR檢測方法本標(biāo)準(zhǔn)僅供內(nèi)部使用不得翻印Methodofthereal-timeRT-PCRforthedetectionofBovineviraldiarrhea/mucosaldisease2012-12-01發(fā)布2013-01-01實施吉林省質(zhì)量技術(shù)監(jiān)督局發(fā)布本標(biāo)準(zhǔn)僅供內(nèi)部使用不得翻印本標(biāo)準(zhǔn)僅供內(nèi)部使用不得翻印DB22/T1608—2012本標(biāo)準(zhǔn)僅供內(nèi)部使用不得翻印前言

2、本標(biāo)準(zhǔn)按照GB/T1.1-2009給出的規(guī)則起草。本標(biāo)準(zhǔn)由吉林出入境檢驗檢疫局提出并歸口。本標(biāo)準(zhǔn)起草單位:吉林出入境檢驗檢疫局技術(shù)中心。本標(biāo)準(zhǔn)主要起草人:孟慶峰、王偉利、吳連鵬、王瑋琳、肖成蕊、蔡陽、宋戰(zhàn)昀、孟日增。本標(biāo)準(zhǔn)僅供內(nèi)部使用不得翻印I本標(biāo)準(zhǔn)僅供內(nèi)部使用不得翻印本標(biāo)準(zhǔn)僅供內(nèi)部使用不得翻印DB22/T1608—2012本標(biāo)準(zhǔn)僅供內(nèi)部使用不得翻印牛病毒性腹瀉/粘膜病病毒熒光RT-PCR檢測方法1范圍本標(biāo)準(zhǔn)規(guī)定了牛病毒性腹瀉/粘膜病病毒(bovineviraldiarrhea/mucosaldisease,BVDV)熒光RT-PCR檢測方法

3、。本標(biāo)準(zhǔn)適用于牛病毒性腹瀉/粘膜病病毒的檢測。2規(guī)范性引用文件下列文件對于本文件的應(yīng)用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,僅所注日期的版本適用于本文件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改單)適用于本文件。GB/T6682分析實驗室用水規(guī)格和試驗方法3縮略語下列縮略語適用于本文件。本標(biāo)準(zhǔn)僅供內(nèi)部使用不得翻印Ct值:達到閾值的循環(huán)數(shù)(CycleThreshold)DEPC:焦碳酸乙二酯(Diethylpyrocarbonate)Taq酶:TaqDNA聚合酶(TaqDNApolymerase)RNA:核糖核酸(Ribonucleic

4、Acid)熒光RT-PCR:熒光逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(yīng)(RealTimeFluorescentQuantitativeReverseTranscriptionPolymeraseChainReaction)4原理采用TaqMan方法,比對牛病毒性腹瀉/粘膜病病毒基因組5'端非編碼區(qū)最保守的核苷酸序列,設(shè)計特異性引物和特異性的熒光雙標(biāo)記探針進行配對。探針5'端標(biāo)記FAM熒光素為報告熒光基團(用R表示),3'端標(biāo)記TAMRA熒光素為淬滅熒光基團(用Q表示),它在近距離內(nèi)能吸收5'端熒光基因發(fā)出的熒光信號。PCR反應(yīng)進入退火階段時,引物和探針同時與目的

5、基因片段結(jié)合,此時探針上R基團發(fā)出的熒光信號被Q基因所吸收,儀器檢測不到熒光信號;而反應(yīng)進行到延伸階段時,Taq酶的5'到3'的外切核酸酶功能將探針降解。這樣探針上的R基團游離出來,所發(fā)出的熒光不再為Q所吸收而被檢測儀所接收。隨著PCR反應(yīng)的循環(huán)進行,PCR產(chǎn)物與熒光信號的增長呈現(xiàn)對應(yīng)關(guān)系。5試劑和材料除非另有說明,本方法所用試劑均為分析純,水為GB/T6682規(guī)定的一級水;所有試劑均用無RNA酶的容器分裝。5.1試劑1DB22/T1608—20125.1.1水:配制方法見附錄A.1。5.1.2Catrimox-14(Cat-14)。5.1.

6、3酚。本標(biāo)準(zhǔn)僅供內(nèi)部使用不得翻印5.1.4三氯甲烷。5.1.5檸檬酸鈉。5.1.6正丁醇。5.1.7乙酸鈉。5.1.8乙醇。5.1.9異丙醇(-20℃預(yù)冷)。5.1.10其他試劑:AMV反轉(zhuǎn)錄酶(5U/μL)、RnaseInhibitor(40U/μL)、10×AMVRTPCRbuffer、MgCL2(25mM)、dNTPMixture(各10mM)、EX-Taq酶(5U/μL)。5.1.11引物:根據(jù)病毒性腹瀉/粘膜病病毒(BVDV)國際標(biāo)準(zhǔn)株基因序列設(shè)計合成一對特異性引物:上游引物5'-CCATGCCCTTAGTAGGACTAGCA-3'

7、,下游引物5'-AACCACTGACGACTACCCTGTACT-3',TaqMan探針(FAM)5'-CCATCCAACGAACTCACCACTGTTGC-3'(TAMRA)均配制成20umol/L,-20℃保存。5.2對照樣品的制備5.2.1陽性對照樣品由指定單位提供或下列方法制備:將牛病毒性腹瀉粘膜病國際標(biāo)準(zhǔn)毒株按10%接種原代牛睪丸細胞,于37℃吸附1h后加入維持液(見附錄A.2),37℃培養(yǎng),待CPE達到70%時收獲病毒懸液,凍融2次~3次,5000r/min離心10min,取上清液備用。5.2.2陰性對照樣品由指定單位提供或下列方

8、法制備:將生長良好的原代睪丸細胞,凍融2次-3次,本標(biāo)準(zhǔn)僅供內(nèi)部使用不得翻印5000r/min離心10min,取上清液備用。6儀器6.1熒光PCR檢測儀。6.2高速

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