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《煙草轉(zhuǎn)錄組測序及ntttg2調(diào)控arf同源基因表達(dá)的研究》由會員上傳分享,免費在線閱讀,更多相關(guān)內(nèi)容在學(xué)術(shù)論文-天天文庫。
1、萬方數(shù)據(jù)TOBACCOTRANSCRIPTOMEANALYSISREVEALINGTHEROLEOFNTTTG2INREGULATINGEXPRESSION0FPUTATIVE4U刪RE&PI引恤尉C跏GENESBYShuyuanMuADissertationSubmittedtoNanjingAgriculturalUniversity,Nanjing,P.R.ChinainPartialFulfillmentoftheRequirementsfortheMasterDegreeofAgronomyDirectedbyProfessorHansongDongNanjingAgricultur
2、alUniversityNanjing210095,P.R.ChinaJune2014萬方數(shù)據(jù)原創(chuàng)性聲明lUllIIIIIIIIIIIIIIY2975568本人鄭重聲明:所呈交的學(xué)位論文,是本人在導(dǎo)師的指導(dǎo)下,獨立進(jìn)行研究工作所取得的成果。除文中已經(jīng)注明引用的內(nèi)容外,本論文不包含任何其他個人或集體已●經(jīng)發(fā)表或撰寫過的作品成果。對本文的研究做出重要貢獻(xiàn)的個人和集體,均已在文中,以明確方式標(biāo)明。本人完全意識到本聲1明的法律結(jié)果由本人承擔(dān)。學(xué)位論文作者(需親筆)簽名:穆弓扭援沙f華年占月弓自學(xué)位論文版權(quán)使用授權(quán)書本學(xué)位論文作者完全了解學(xué)校有關(guān)保留、使用學(xué)位論文的規(guī)定,同意學(xué)校保留并向國家有關(guān)部門或機(jī)
3、構(gòu)送交論文的復(fù)印件和電子版,允許論文被查閱和借閱。本人授權(quán)南京農(nóng)業(yè)大學(xué)可以將本學(xué)位論文的全部或部分內(nèi)容編入有關(guān)數(shù)據(jù)庫進(jìn)行檢索,可以采用影印、縮印或掃描等復(fù)制手段保存和匯編學(xué)位論文。保密口,在年解密后適用本授權(quán)書。本學(xué)位論文屬于不保密彭(請在以上方框內(nèi)打誓√一)學(xué)位論文作者(需親筆)簽名:奄薌投越沁恤年舌月≥臼導(dǎo)師(需親筆)簽名:C鄉(xiāng)--0/名年夠日萬方數(shù)據(jù)目錄摘要???????..???..???????..?.??...??..???.?.???...??..??..?..IABSTRACT?????????????????????????????????????.III第一部分文獻(xiàn)綜述??
4、????????????????????????????。1第一章測序技術(shù)的進(jìn)展和應(yīng)用????????????????????..11測序技術(shù)的發(fā)展史概述?????????????????????11.1第一代測序技術(shù)?????????????????????.11.2第二代測序技術(shù)?????????????????????.21.3第三代測序技術(shù)簡介???????????????????.41.4其它新型測序技術(shù)概述??????????????????.52高通量測序技術(shù)的應(yīng)用?????????????????????6第二章植物WD40蛋白結(jié)構(gòu)與功能概述????????????????.9
5、1WD40蛋白的定義和結(jié)構(gòu)體系??????????????????.92真核生物蛋白組中含有豐富的WD40結(jié)構(gòu)域???????????.103TTG蛋白研究進(jìn)展??????????????????????..1l第三章生長素信號通路概述?????????????????????13第二部分研究報告?????????????????????????????.17第一章煙草轉(zhuǎn)錄組測序與分析????????????????????171材料與方法?????????????????????????..181.1植物材料????????????????????????181.2葉片總RNA的提取????
6、???????????????181.3cDNA文庫的建立和測序?????????????????181.4數(shù)據(jù)分析????????????????????????192測序數(shù)據(jù)結(jié)果與分析?????????????????????..202.1原始數(shù)據(jù)處理??????????????????????202.2Unigenes的功能注釋???????????????????232.3Unigenes的功能分類???????????????????252.4Unigenes代謝途徑分析??????????????????272.5CDS預(yù)測??????????????????????????28萬
7、方數(shù)據(jù)煙草轉(zhuǎn)錄組測序及NtTTG2調(diào)控ARF同源基因表達(dá)的研究2.6基因表達(dá)水平分析及RNA.seq整體質(zhì)量評估????????..29第二章受NtTTG2調(diào)控的ARF同源基因鑒定與ARF8轉(zhuǎn)錄功能研究????31l材料與方法?????????????????????????..321.1植物材料????????????????????????321.2歸入生長素反應(yīng)的unigenes分類????